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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G513180
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 128737680-128742581 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3998 bp · TkA03G513180|TK1151|cDNA

TAATAATACAACCTAACTTAATAAAAGCAAAAAAGCCATATGAAGACATAAACAGGTGAAGACCGGATACATCCAAAAGCTAACACAAATGAAAGATACAGTTGGGAAGGGAACGGAAGGGTATATTCTTTTCTCACAATCGGATAATCGGCTGCCTTTTATCTAATTTAAATCCCTCGATCGTTCACTCCACCCCACCCCGTCCCATTCAAAATCTCACTCCCATCAATTTCCTTAACAAACAAACAATTTCCAAGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

2457 bp · TkA03G513180|TK1151|CDS

ATGGACGTGTTTCTAAGTGATTTCGATAGCTACAGTGAAAGCAGTAGCTCTGATGATCAAGAAGACGACGAGTTCATGTACAGTGGGCAAGCGAGCTGTATCCTCTCTAATCTCCAAGAAACCATCGGCAAAATTGATGATTTCTTGTTGTTTGAGAGAAGGTACGTCCATGGCGACATTGTTTGTTCAGTGAATGATCCGTCACAAATGGGAAAAGTAATCAATTTTGAAATGGTCGTGGAGTTGGAGAATCTTAACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

818 aa · TkA03G513180|TK1151|PROTEIN

MDVFLSDFDSYSESSSSDDQEDDEFMYSGQASCILSNLQETIGKIDDFLLFERRYVHGDIVCSVNDPSQMGKVINFEMVVELENLNEKKLKDINSKDLQRIRSISMGDYVISGPWVGKADNITDSVTVLFDDGTKCEFTKTDTDNLIPISPDLVDDSQYPFYPGQRVKLVNSARSNSTRWFCGSQTETHNEGTVCKIDTGSVHVTWLGCALFGSEVGAPVPPSLQNSKDVTPISCFLNWQLGDWCVVPKISHSGFQEIFV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G513180
TK1151 IDTkA03G513180
OH-1004 IDLXL04_010233
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 92.534
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G513180
位置Chr03:128737680-128742581 (-)
描述Similar to UBC24: Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 24
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g33770 E2 泛素蛋白连接酶，介导 E1 依赖性蛋白泛素化。
PHO2-dependent degradation of PHO1 modulates phosphate homeostasis in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.096636
Nitrogen limitation adaptation, a target of microRNA827, mediates degradation of plasma membrane-localized phosphate transporters to maintain phosphate homeostasis in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.116012
Identification of downstream components of ubiquitin-conjugating enzyme PHOSPHATE2 by quantitative membrane proteomics in Arabidopsis roots.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.115998
NITROGEN LIMITATION ADAPTATION recruits PHOSPHATE2 to target the phosphate transporter PT2 for degradation during the regulation of Arabidopsis phosphate homeostasis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.113.120311
At2g16920 接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 暂无已核实直接文献
At1g53025 接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 暂无已核实直接文献
At3g15355 接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 暂无已核实直接文献
At1g53020 接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010233 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006817 phosphate ion transport 生物过程
GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0055062 phosphate ion homeostasis 生物过程
GO:2000185 regulation of phosphate transmembrane transport 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016874 ligase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53025
ath:AT2G16920
ath:AT2G33770
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.568
排名 1 · TkA03G513180 · TK1151
细胞核0.415
排名 2 · TkA03G513180 · TK1151
细胞膜0.069
排名 3 · TkA03G513180 · TK1151
高尔基体0.068
排名 4 · TkA03G513180 · TK1151
内质网0.059
排名 5 · TkA03G513180 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17020DUF509750-108 aa
PF07388A-2_8-polyST57-100 aa
PF23046tSH3-B_UBE2O107-236 aa
PF23044SH3-C_UBE2O183-207 aa
PF23044SH3-C_UBE2O267-279 aa
PF23043SH3-B_UBE2O295-357 aa
PF23046tSH3-B_UBE2O320-342 aa
PF05743UEV322-347 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G513180PF17020DUF5097501080.05414.5
TkA03G513180PF07388A-2_8-polyST571000.007316.7
TkA03G513180PF23046tSH3-B_UBE2O1072361.4e-35122.6
TkA03G513180PF23044SH3-C_UBE2O1832072.6e-1040.7
TkA03G513180PF23044SH3-C_UBE2O2672792.6e-1040.7
TkA03G513180PF23043SH3-B_UBE2O2953571.3e-1661.4
TkA03G513180PF23046tSH3-B_UBE2O3203421.4e-35122.6
TkA03G513180PF05743UEV3223470.0001422.3
TkA03G513180PF23044SH3-C_UBE2O3584212.6e-1040.7
TkA03G513180PF23043SH3-B_UBE2O3634081.3e-1661.4
TkA03G513180PF17020DUF50973854200.05414.5
TkA03G513180PF23046tSH3-B_UBE2O3874041.4e-35122.6
TkA03G513180PF28803DUF84653874210.04914.1
TkA03G513180PF07388A-2_8-polyST4886220.007316.7
TkA03G513180PF28803DUF84655155250.04914.1
TkA03G513180PF00179UQ_con5777083.7e-2382.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VY10拟南芥sp|Q8VY10|UBC24_ARATH Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 2447.400%Swiss-Prot中等置信
Q9ZVX1拟南芥sp|Q9ZVX1|UBC23_ARATH Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 2342.100%Swiss-Prot中等置信
Q8GY87拟南芥sp|Q8GY87|UBC26_ARATH Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 2652.000%Swiss-Prot低置信
Q9LUQ5拟南芥sp|Q9LUQ5|UBC25_ARATH Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 2551.500%Swiss-Prot低置信
Q9C918拟南芥sp|Q9C918|UBC38_ARATH Putative ubiquitin-conjugating enzyme E2 3849.300%Swiss-Prot低置信

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