基因注释
展示当前基因的功能描述、GO/KEGG 注释及分物种同源证据。命中结果按查询版本、序列来源和比对证据分层显示。
查询结果
| 基因 ID | TkA03G513180 |
|---|---|
| 当前查询版本 | TK1151 |
| 位置 | Chr03:128737680-128742581 (-) |
| 描述 | Similar to UBC24: Probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 24 (Arabidopsis thaliana OX%3D3702) |
| 注释来源组装 | GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
功能注释来源:OH1004 · LXL04_010233 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
当前查询返回来自 OH1004 注释条目的 13 条 GO 注释和 3 条 KEGG 基因交叉引用;只下载当前查询结果,不据此推断 KEGG 通路成员。
拟南芥 / 水稻参考基因与文献
文献对应拟南芥或水稻参考基因;橡胶草的功能关联来自当前参考组装的蛋白序列比对。
拟南芥
| 参考基因 ID | 可能功能 | 对应论文 / DOI |
|---|---|---|
At2g33770 |
E2 泛素蛋白连接酶,介导 E1 依赖性蛋白泛素化。 |
PHO2-dependent degradation of PHO1 modulates phosphate homeostasis in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.096636 Nitrogen limitation adaptation, a target of microRNA827, mediates degradation of plasma membrane-localized phosphate transporters to maintain phosphate homeostasis in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.116012
|
At2g16920 |
接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g53025 |
接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 | 暂无已核实直接文献 |
At3g15355 |
接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 | 暂无已核实直接文献 |
At1g53020 |
接受 E1 复合物中的泛素并催化其与其他蛋白质的共价连接。 | 暂无已核实直接文献 |
水稻
当前来源表未检出该物种的同源命中。
GO / KEGG
以下 GO/KEGG 注释源自上述 OH1004 注释条目,保留原始同源转移证据及覆盖度;其来源物种范围与拟南芥/水稻直接比对表不同。
| 类型 | ID | 名称 | 命名空间 | 证据 | 来源 |
|---|---|---|---|---|---|
| GO | GO:0006817 | phosphate ion transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016036 | cellular response to phosphate starvation | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016567 | protein ubiquitination | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-UniPathway | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0055062 | phosphate ion homeostasis | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IMP:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:2000185 | regulation of phosphate transmembrane transport | 生物过程 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IGI:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0000139 | Golgi membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005634 | nucleus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=ISM:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005783 | endoplasmic reticulum | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005789 | endoplasmic reticulum membrane | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-SubCell | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005794 | Golgi apparatus | 细胞组分 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IDA:TAIR | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0005524 | ATP binding | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0016874 | ligase activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IEA:UniProtKB-KW | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| GO | GO:0061631 | ubiquitin conjugating enzyme activity | 分子功能 | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0; UniProt GO evidence=IBA:GO_Central | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |
| KEGG | ath:AT1G53025 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=4; 一致性=52.381; 覆盖度=30.882; E 值=2.01e-88 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G16920 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=2; 一致性=38.729; 覆盖度=74.774; E 值=2.43e-125 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release | |
| KEGG | ath:AT2G33770 | KEGG gene cross-reference from reviewed UniProt hit; pathway name pending | Swiss-Prot reviewed 同源转移; 命中排序=1; 一致性=47.019; 覆盖度=100.566; E 值=0.0 | UniProtKB/Swiss-Prot DAT 2026 current_release |