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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G495300
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 124338997-124342143 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1515 bp · TkA03G495300|TK1151|cDNA

AAAAAAATTGTGTAGTCTCTGAATACTTTAATGAATAAATCGGCTTCTGCCCCCTTATCGGAAGCCACTTTGCCGTTGATAACAATTTAAAACATACGACTCCAAAATTAGAGATAAAACTCATAAAAGGATTAGAAAACTTACCCAACAACCAGACATCAATAAGAAAACCCCTTCAAATGCGCACAGACATTCCGATGCTCCTAATTTCCTTCATCTCCATTGTTCAGAGAGGTGTAGCTTAGCTCTCAGCAAAGAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

441 bp · TkA03G495300|TK1151|CDS

ATGGTATGTCAACAGTGGGGAGGAATTAATGGAATCGGATTCTATGCAAGCCAAATCTTTGAAACCGCTGGATTTTCATTGGGGATATCTGGAACGATTGCTTATGCCTTGATAAAGATTCATGTCACGATTGTTGGCATGATCTTGCTGGACATATCAGGAAGAAGGATTCTACTTCTGGTTGTGAACTGTAAGGATGAGCTGGCACAATATTATCTGATGGACTGCCTAATTCAGCCTACGGTTGACATAAAGACAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

146 aa · TkA03G495300|TK1151|PROTEIN

MVCQQWGGINGIGFYASQIFETAGFSLGISGTIAYALIKIHVTIVGMILLDISGRRILLLVVNCKDELAQYYLMDCLIQPTVDIKTVLSLLMERLSSYAASSPEVLPEFLQVEAFSKLSSAIGKVQVLFELIKGLIKDEFCIFQID

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G495300
TK1151 IDTkA03G495300
OH-1004 IDLXL04_010075
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 56.809
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G495300
位置Chr03:124338997-124342143 (-)
描述Similar to RABA5D: Ras-related protein RABA5d
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g51310 在囊泡蛋白分选中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g75850 在囊泡蛋白分选中发挥作用。
Arabidopsis VPS35, a retromer component, is required for vacuolar protein sorting and involved in plant growth and leaf senescence.2008 · DOI: 10.1093/pcp/pcn006
At2g17790 在囊泡蛋白分选中发挥作用。
Loss-of-function mutations of retromer large subunit genes suppress the phenotype of an Arabidopsis zig mutant that lacks Qb-SNARE VTI11.2010 · DOI: 10.1105/tpc.109.069294
At5g18840 糖转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g54730 糖转运蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010075 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程
GO:0042147 retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005770 late endosome 细胞组分
GO:0005771 multivesicular body 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05810
ath:AT1G75850
ath:AT2G31680
ath:AT3G51310
ath:AT5G18840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.434
排名 1 · TkA03G495300 · TK1151
细胞质0.160
排名 2 · TkA03G495300 · TK1151
细胞膜0.146
排名 3 · TkA03G495300 · TK1151
溶酶体／液泡0.130
排名 4 · TkA03G495300 · TK1151
高尔基体0.117
排名 5 · TkA03G495300 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00083Sugar_tr2-61 aa
PF03635Vps3556-79 aa
PF03635Vps3578-125 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G495300PF00083Sugar_tr2612.7e-0937.2
TkA03G495300PF03635Vps3556792.2e-1040.5
TkA03G495300PF03635Vps35781252.2e-1040.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A8R7K9拟南芥sp|A8R7K9|VP35C_ARATH Vacuolar protein sorting-associated protein 35C63.000%Swiss-Prot低置信
F4I0P8拟南芥sp|F4I0P8|VP35B_ARATH Vacuolar protein sorting-associated protein 35B58.700%Swiss-Prot低置信
Q7X659拟南芥sp|Q7X659|VP35A_ARATH Vacuolar protein sorting-associated protein 35A55.400%Swiss-Prot低置信
Q8LBI9拟南芥sp|Q8LBI9|EDL16_ARATH Sugar transporter ERD6-like 1655.700%Swiss-Prot低置信
Q3ECP7拟南芥sp|Q3ECP7|ERDL5_ARATH Sugar transporter ERD6-like 557.400%Swiss-Prot低置信

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