TkA03G494020 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G494020

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 123907920-123912967 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1657 bp · TkA03G494020|TK1151|cDNA

TAGAATTTCAAGTTTCACTACAACCGTTAAACCATCTAACGTACTTTTCTTTGTTTTTTGTTGCAGCTTGGTATGGGAAGTGCAGTGGAGACTCTCTGCGGGCAAGCATACGGAGCTCAACAATACGAAATGCTTGGCATTTACCTCCAAAGATCCACCATCCTTCTAATGGCGACCGCCATTCCCCTAATGTTTCTCTACATCTTCTCCAAATTCCTCCTCCTCCTAATCGGCCAATCCAAAGAAATCGCCACGGCAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1197 bp · TkA03G494020|TK1151|CDS

ATGGGAAGTGCAGTGGAGACTCTCTGCGGGCAAGCATACGGAGCTCAACAATACGAAATGCTTGGCATTTACCTCCAAAGATCCACCATCCTTCTAATGGCGACCGCCATTCCCCTAATGTTTCTCTACATCTTCTCCAAATTCCTCCTCCTCCTAATCGGCCAATCCAAAGAAATCGCCACGGCAGCCTCCCTCTTCATCTACGGCCTCATCCCCCAAATCTTCGCATACGCCGCCAATTTCCCAATCCAAAAATTCCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

398 aa · TkA03G494020|TK1151|PROTEIN

MGSAVETLCGQAYGAQQYEMLGIYLQRSTILLMATAIPLMFLYIFSKFLLLLIGQSKEIATAASLFIYGLIPQIFAYAANFPIQKFLQAQSIVNPSAYIAAVMLVFHVILTYLALYVWGWGLLGGSMVLSFSWWAIVVAQFVYIVKSDRTKETWTGFSTQAFSGLWAFLKLSTASAVMLCLETWYFQILILIAGLLPDPEIALDSLAVCGTILGWVLMIAIGFNAAASVRVSNELGAGHPKSAKFAVVVVTLSSFVVALI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G494020`
TK1151 ID	TkA03G494020
OH-1004 ID	LXL04_010062
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	83.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 77.734 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G494020

位置 Chr03:123907920-123912967 (-)

描述 Similar to DTX40: Protein DETOXIFICATION 40

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g21690`	蛋白质解毒 40。	暂无已核实直接文献
`At1g61890`	蛋白质解毒 37。	暂无已核实直接文献
`At1g11670`	蛋白 DETOXIFICATION 36。	暂无已核实直接文献
`At4g21903`	蛋白质解毒38（DETOXIFICATION 38）。	暂无已核实直接文献
`At4g21910`	蛋白 DETOXIFICATION 39。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010062 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:1990961 xenobiotic detoxification by transmembrane export across the plasma membrane 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005773 vacuole 细胞组分

GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0015297 antiporter activity 分子功能

GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0042910 xenobiotic transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G11670

ath:AT1G61890

ath:AT3G21690

ath:AT4G21903

ath:AT4G21910

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.383

排名 1 · TkA03G494020 · TK1151

溶酶体／液泡0.369

排名 2 · TkA03G494020 · TK1151

内质网0.101

排名 3 · TkA03G494020 · TK1151

细胞质0.086

排名 4 · TkA03G494020 · TK1151

高尔基体0.084

排名 5 · TkA03G494020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01554MatE1-113 aa

PF01554MatE175-336 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G494020	`PF01554`	MatE	1	113	2.8e-55	187.1
TkA03G494020	`PF01554`	MatE	175	336	2.8e-55	187.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LVD9`	拟南芥	sp\|Q9LVD9\|DTX40_ARATH Protein DETOXIFICATION 40	68.400%	Swiss-Prot	高置信
`O80695`	拟南芥	sp\|O80695\|DTX37_ARATH Protein DETOXIFICATION 37	63.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q9SAB0`	拟南芥	sp\|Q9SAB0\|DTX36_ARATH Protein DETOXIFICATION 36	63.700%	Swiss-Prot	高置信
`F4JKB9`	拟南芥	sp\|F4JKB9\|DTX38_ARATH Protein DETOXIFICATION 38	59.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q940N9`	拟南芥	sp\|Q940N9\|DTX39_ARATH Protein DETOXIFICATION 39	58.400%	Swiss-Prot	高置信

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