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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G483760
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 121025791-121029239 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2519 bp · TkA03G483760|TK1151|cDNA

ATATATTATAAATAAAAACATAAAAAAACATATCTTATATTTCGTATTGGGAAAGGGACAATTTAATCTTGAGGGTACGTCCACCATTGCCGACACCTTCTGTGTTCTCGTGGCCATCTCCTTTCCCTTTCCTCGCTTCATCATCTGTTTATGGTGTCTTGAAATCTTTCACTTTTCTGGTCGTTTAATTTCTGAGCGTGCAAGCCAAGAATGGTATTTTGGGTTTCATCATAGAAGTTAGGTATACTCGGTTTTCTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1905 bp · TkA03G483760|TK1151|CDS

ATGAAGATGAAGATGAAGATGAAAATTAGGATGCAGAAACCAGTGCTAGTGTTACTTTTTATAACGGTTCTTGCCCCCATTGTCCTTTACACTGATAGACTCGCTACATTTTCTTCGTTTTCTACAGCAGAATACGAATTGGAGCCTTCGACACTTTCATTGAATCGTGATGTCAGGCCCCAAAATTTACTTCATCAGGAGTTAACCGAAGCAAAAGAAGAACCGGTGGATAATGTTTATTTGGAAAATTTGACTAGATC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

634 aa · TkA03G483760|TK1151|PROTEIN

MKMKMKMKIRMQKPVLVLLFITVLAPIVLYTDRLATFSSFSTAEYELEPSTLSLNRDVRPQNLLHQELTEAKEEPVDNVYLENLTRSIQRLDGERSRKTRQLNEESEQHDNIAIKQVTQGLHEADHSDKRHESTENQKLKMSEHKLLSTETETKQDGKSMEPTKTKIKKADESISTDTRVKYLKDQLIRGRIYLSLSATRTNSQFIRELRLRMKEVQRALGDATKDSDLPKNANEKLKAMEQTLAKGKQIQDDCTAVVKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G483760
TK1151 IDTkA03G483760
OH-1004 IDLXL04_009945
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G483760
位置Chr03:121025791-121029239 (-)
描述Similar to GAUT4: Probable galacturonosyltransferase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g47780 可能参与细胞壁中果胶和/或木聚糖的生物合成。 暂无已核实直接文献
At3g61130 参与果胶生物合成。
Functional identification of an Arabidopsis pectin biosynthetic homogalacturonan galacturonosyltransferase.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0600120103
At4g38270 可能参与细胞壁中果胶和/或木聚糖的生物合成。 暂无已核实直接文献
At2g46480 可能参与细胞壁中果胶和/或木聚糖的生物合成。 暂无已核实直接文献
At3g25140 Alpha-1-4-D-半乳糖醛酸基转移酶参与同型半乳糖醛酸 合成，HGA 是一类在细胞粘附中发挥作用的果胶。
QUASIMODO1 is expressed in vascular tissue of Arabidopsis thaliana inflorescence stems, and affects homogalacturonan and xylan biosynthesis.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-0008-z

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009945 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010289 homogalacturonan biosynthetic process 生物过程
GO:0045489 pectin biosynthetic process 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0000137 Golgi cis cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005797 Golgi medial cisterna 细胞组分
GO:0005802 trans-Golgi network 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G30575
ath:AT2G46480
ath:AT3G61130
ath:AT4G38270
ath:AT5G47780
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.761
排名 1 · TkA03G483760 · TK1151
内质网0.117
排名 2 · TkA03G483760 · TK1151
细胞外0.082
排名 3 · TkA03G483760 · TK1151
细胞质0.077
排名 4 · TkA03G483760 · TK1151
细胞膜0.067
排名 5 · TkA03G483760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10819DUF256467-92 aa
PF10819DUF2564100-146 aa
PF06103DUF948106-119 aa
PF25557GAUT_1113-147 aa
PF25557GAUT_1176-251 aa
PF10819DUF2564207-273 aa
PF06103DUF948227-268 aa
PF01501Glyco_transf_8298-607 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G483760PF10819DUF256467927.57.7
TkA03G483760PF10819DUF25641001467.57.7
TkA03G483760PF06103DUF9481061190.8310.6
TkA03G483760PF25557GAUT_11131479.2e-30103.4
TkA03G483760PF25557GAUT_11762519.2e-30103.4
TkA03G483760PF10819DUF25642072737.57.7
TkA03G483760PF06103DUF9482272680.8310.6
TkA03G483760PF01501Glyco_transf_82986076.7e-82275.6
TkA03G483760PF18404Glyco_transf_243815032.2e-0731.3
TkA03G483760PF25557GAUT_14204409.2e-30103.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93ZX7拟南芥sp|Q93ZX7|GAUT4_ARATH Probable galacturonosyltransferase 460.700%Swiss-Prot高置信
Q9LE59拟南芥sp|Q9LE59|GAUT1_ARATH Polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase58.800%Swiss-Prot高置信
Q0WQD2拟南芥sp|Q0WQD2|GAUT3_ARATH Probable galacturonosyltransferase 354.500%Swiss-Prot高置信
Q9ZPZ1拟南芥sp|Q9ZPZ1|GAUT2_ARATH Putative galacturonosyltransferase 249.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LSG3拟南芥sp|Q9LSG3|GAUT8_ARATH Galacturonosyltransferase 852.700%Swiss-Prot中等置信

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