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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G433800
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 107931916-107936180 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

864 bp · TkA03G433800|TK1151|cDNA

ATGGGAACCAAAATCAAAGGGGTTTTTAAAGGATTCAAATTCATCTCTCAAATTTTCGTTATGAATGAGCGTGAAATGGAGATTGGGTATCCAACTGATGTTAAACATGTTGCTCATATTGGCTGGGATGGATCTTCAGGCAGTGCTCCTTCATGGGTAATTTGGTCAGGATTGCAGGCAATCTTTAGTCCCCCAACAGCAATACGTGGGGGTATTCCTATAATCTTCCCTCAAGGAATAAGAAGAATAGCAAGGAAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

864 bp · TkA03G433800|TK1151|CDS

ATGGGAACCAAAATCAAAGGGGTTTTTAAAGGATTCAAATTCATCTCTCAAATTTTCGTTATGAATGAGCGTGAAATGGAGATTGGGTATCCAACTGATGTTAAACATGTTGCTCATATTGGCTGGGATGGATCTTCAGGCAGTGCTCCTTCATGGGTAATTTGGTCAGGATTGCAGGCAATCTTTAGTCCCCCAACAGCAATACGTGGGGGTATTCCTATAATCTTCCCTCAAGGAATAAGAAGAATAGCAAGGAAAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

287 aa · TkA03G433800|TK1151|PROTEIN

MGTKIKGVFKGFKFISQIFVMNEREMEIGYPTDVKHVAHIGWDGSSGSAPSWVIWSGLQAIFSPPTAIRGGIPIIFPQGIRRIARKEDLLTILRQHVKSNVLHIDNKFYLQNVELITCLLKSGADPNVIDEEGWKPVQVAALRGNCGAVEVLFPMDVDVYTQLRNMSKKLESDLEISKKRHIELVEQCESLKKGREDSDAREEALSEFKAIEQKYNNTKEELGQYADNDPATFEARKESIKVAHEAANRWTDNIFTLRLW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G433800
TK1151 IDTkA03G433800
OH-1004 IDLXL04_027673
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 54.007 / OH-1004 47.840
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G433800
位置Chr03:107931916-107936180 (-)
描述Similar to RIC10: CRIB domain-containing protein RIC10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g29170 减数分裂过程中正确的同源染色体配对以及有效的交叉和基因内重组所必需的。
The Arabidopsis thaliana MND1 homologue plays a key role in meiotic homologous pairing, synapsis and recombination.2006 · DOI: 10.1242/jcs.02967
AtMND1 is required for homologous pairing during meiosis in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1186/1471-2199-7-24
The interplay of RecA-related proteins and the MND1-HOP2 complex during meiosis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1371/journal.pgen.0030176
At4g04900 作为“植物 Rho”(ROP) 家族的 Rho 相关 GTP 结合蛋白的下游效应子。
A genome-wide analysis of Arabidopsis Rop-interactive CRIB motif-containing proteins that act as Rop GTPase targets.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010218
At1g61795 作为“植物 Rho”(ROP) 家族的 Rho 相关 GTP 结合蛋白的下游效应子。 暂无已核实直接文献
At4g21745 作为“植物 Rho”(ROP) 家族的 Rho 相关 GTP 结合蛋白的下游效应子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027673 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000902 cell morphogenesis 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010215 cellulose microfibril organization 生物过程
GO:0031122 cytoplasmic microtubule organization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0010005 cortical microtubule, transverse to long axis 细胞组分
GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G33460
ath:AT3G23380
ath:AT4G04900
ath:AT4G21745
ath:AT4G28556
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.336
排名 1 · TkA03G433800 · TK1151
细胞核0.243
排名 2 · TkA03G433800 · TK1151
线粒体0.194
排名 3 · TkA03G433800 · TK1151
质体0.115
排名 4 · TkA03G433800 · TK1151
细胞外0.083
排名 5 · TkA03G433800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00786PBD27-48 aa
PF06419COG6_N93-112 aa
PF13637Ank_4109-152 aa
PF13606Ank_3111-128 aa
PF00023Ank111-130 aa
PF12796Ank_2112-158 aa
PF13857Ank_5119-140 aa
PF13857Ank_5119-160 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G433800PF00786PBD27482e-0628.7
TkA03G433800PF06419COG6_N931120.2712.1
TkA03G433800PF13637Ank_41091524.2e-0627.6
TkA03G433800PF13606Ank_31111280.05914.7
TkA03G433800PF00023Ank1111300.212.8
TkA03G433800PF12796Ank_21121580.0007420.7
TkA03G433800PF13857Ank_51191400.01216.7
TkA03G433800PF13857Ank_51191600.01216.7
TkA03G433800PF13606Ank_31321600.05914.7
TkA03G433800PF00023Ank1331520.212.8
TkA03G433800PF03961FapA1612300.03314.5
TkA03G433800PF06419COG6_N1612100.2712.1
TkA03G433800PF13256DUF40471682230.02715.2
TkA03G433800PF18517LZ3wCH2102221.3e-1867.4
TkA03G433800PF18517LZ3wCH2322851.3e-1867.4
TkA03G433800PF03961FapA2612790.03314.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GYD2拟南芥sp|Q8GYD2|MND1_ARATH Meiotic nuclear division protein 1 homolog67.700%Swiss-Prot低置信
Q9M0Y9拟南芥sp|Q9M0Y9|RIC10_ARATH CRIB domain-containing protein RIC1067.300%Swiss-Prot低置信
Q1G3Y0拟南芥sp|Q1G3Y0|RIC9_ARATH CRIB domain-containing protein RIC965.500%Swiss-Prot低置信
Q0WL69拟南芥sp|Q0WL69|RIC11_ARATH CRIB domain-containing protein RIC1162.300%Swiss-Prot低置信

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