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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G405150
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 100746305-100749240 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2075 bp · TkA03G405150|TK1151|cDNA

AATAAGCCTTGGATTTTGACTATAAAAAGAAAAATAAAAAATAAACTAGGAAAATAAATCTTGATTCCAGTGGCAAACATGAATCTCGATTCCTAATTTGCCATCCGCCGCAGTTAAACCGCCGGTGAAAGCCGTTCTCTTATCCGTCTTTTCATCCTCTGCTTCCAAACCCTAAATTCGAAACCCTATCCGTTTCCCCAATATTCGATCATTCAATTGGAAGCAAATTTATCAGTTTTTCGGACAGAATCACCTCCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1488 bp · TkA03G405150|TK1151|CDS

ATGGTGTTGGCGGAACTAGGGGGGAGCATTTCACGTGCTCTCCAGCAGATGAGCAATGCCACGATCATCGATGAGAAGGTTCTTAACGATTGCTTAAATGAAATCACTCGCGCTCTTCTCCAGTCCGATGTTCAATTCAAGCTCGTTCGTGAAATGCAAACTAATATTAAGAAGATCGTCAATCTCGATGATCTCGCTGCAGGCCATAACAAGCGAAAAATCATCCAACAGGCTATATTCAACGAGCTCTGCAAGATGTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

495 aa · TkA03G405150|TK1151|PROTEIN

MVLAELGGSISRALQQMSNATIIDEKVLNDCLNEITRALLQSDVQFKLVREMQTNIKKIVNLDDLAAGHNKRKIIQQAIFNELCKMLDPGKPSFTPKKSKPSVVMFVGLQGSGKTTTCTKYAFYHQKKGWKPALVCADTFRAGAFDQLKQNATKAKIPFYGSYMESDPVKIAVEGVERFKKENCDLIIVDTSGRHKQEVALFEEMRQVSEATKPDLVIFVMDSSIGQAAFDQAQAFKQSVAVGAVIITKMDGHAKGGGAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G405150
TK1151 IDTkA03G405150
OH-1004 IDLXL04_009171
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G405150
位置Chr03:100746305-100749240 (+)
描述Similar to Signal recognition particle 54 kDa protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g48900 信号识别颗粒（SRP）复合体的组分，一种核糖核蛋白复合体，介导分泌和膜蛋白的共翻译靶向内质网（ER）。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009171 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006616 SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, translocation 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005786 signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0003924 GTPase activity 分子功能
GO:0005525 GTP binding 分子功能
GO:0008312 7S RNA binding 分子功能
GO:0030942 endoplasmic reticulum signal peptide binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48900
sly:544156
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.387
排名 1 · TkA03G405150 · TK1151
线粒体0.329
排名 2 · TkA03G405150 · TK1151
内质网0.172
排名 3 · TkA03G405150 · TK1151
细胞核0.121
排名 4 · TkA03G405150 · TK1151
过氧化物酶体0.099
排名 5 · TkA03G405150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02881SRP54_N6-83 aa
PF00465Fe-ADH19-56 aa
PF13401AAA_2225-70 aa
PF02978SRP_SPB34-65 aa
PF01583APS_kinase35-65 aa
PF00004AAA48-92 aa
PF03029ATP_bind_152-87 aa
PF04851ResIII76-218 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G405150PF02881SRP54_N6835.1e-1452.9
TkA03G405150PF00465Fe-ADH19560.01415.7
TkA03G405150PF13401AAA_2225700.05514.5
TkA03G405150PF02978SRP_SPB34657.1e-38130.5
TkA03G405150PF01583APS_kinase35650.2612.0
TkA03G405150PF00004AAA48920.007317.5
TkA03G405150PF03029ATP_bind_152870.1912.2
TkA03G405150PF04851ResIII762180.003418.0
TkA03G405150PF06414Zeta_toxin951420.01715.3
TkA03G405150PF25199nSTAND_NTPase5961400.04214.4
TkA03G405150PF13245AAA_19992010.003518.2
TkA03G405150PF13401AAA_221001360.05514.5
TkA03G405150PF00448SRP541012964.1e-78262.3
TkA03G405150PF01583APS_kinase1011510.2612.0
TkA03G405150PF20720nSTAND31021350.001818.7
TkA03G405150PF09439SRPRB1021200.006416.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P49967拟南芥sp|P49967|SR543_ARATH Signal recognition particle subunit SRP54 389.100%Swiss-Prot高置信

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