TkA03G389950 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G389950

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 96618285-96620681 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1657 bp · TkA03G389950|TK1151|cDNA

CTACTTTCACTCTTTCTTCCCTTCAACAATAGCTTTGTGTAGTCCGATGCTTCTATATCTTCCTCTATTTTCCATATATCAATCGCGTAACATGATCCCAAGAACCTAGATCTTTTTCACTCGCTGCTCCGGCGATCCTTCTTCACCGTCGACGAATCAAGATCCCAGTTATTTGGTGGTTTAGTTGAGAATTTCCATGGCGGATAACAATGTGAATTCCAGTTCACCTGCTGAAAACCAAAACCACAGCTCTGATGAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1314 bp · TkA03G389950|TK1151|CDS

ATGGCGGATAACAATGTGAATTCCAGTTCACCTGCTGAAAACCAAAACCACAGCTCTGATGAGACCATAAACCCTATAACCAACCAGAGCGAGGTATCCATTGATGCAATCGCACAAAAGGTTCAAGAGTCTATGTCTATTTCCAAGAGGCATAAGTTTTGGGAAACTCAACCAGTTGGACAGTTTAAAGACGTTGGCAACCCAACCTTACCTGAAGGCCCAATTGAGCCTCCAACGCCATTATCAGAAGTTAAACAAGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

437 aa · TkA03G389950|TK1151|PROTEIN

MADNNVNSSSPAENQNHSSDETINPITNQSEVSIDAIAQKVQESMSISKRHKFWETQPVGQFKDVGNPTLPEGPIEPPTPLSEVKQEPYNLPGPYEWITCDMDTEEMCAEVYNLLANNYVEDDENMFRFNYSKDFLQWALRPPGYYRSWHIGVRVKSSKKLVAFITGVPAKIRAKDTIVNMAEINFLCVHKKLRSKRLAPVMIKEVTRRVHMENIWQAAYTAGVVLPTPISTCQYWHRSLNPKKLIDVGFSRLGARMTMS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G389950`
TK1151 ID	TkA03G389950
OH-1004 ID	LXL04_008257
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 93.593 / OH-1004 88.528 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G389950

位置 Chr03:96618285-96620681 (-)

描述 Similar to NMT1: Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g57020`	向某些细胞蛋白的 N 端甘氨酸残基添加肉豆蔻酰基。	暂无已核实直接文献
`At2g44170`	可能向某些细胞蛋白的 N 端甘氨酸残基添加肉豆蔻酰基。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008257 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006499 N-terminal protein myristoylation 生物过程

GO:0010064 embryonic shoot morphogenesis 生物过程

GO:0018008 N-terminal peptidyl-glycine N-myristoylation 生物过程

GO:0022400 regulation of opsin-mediated signaling pathway 生物过程

GO:0031669 cellular response to nutrient levels 生物过程

GO:0042180 ketone metabolic process 生物过程

GO:0072657 protein localization to membrane 生物过程

GO:0150032 positive regulation of protein localization to lysosome 生物过程

GO:1903749 positive regulation of establishment of protein localization to mitochondrion 生物过程

GO:1904263 positive regulation of TORC1 signaling 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G57020

hsa:4836

mmu:18107

rno:259274

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.683

排名 1 · TkA03G389950 · TK1151

细胞核0.273

排名 2 · TkA03G389950 · TK1151

细胞膜0.098

排名 3 · TkA03G389950 · TK1151

溶酶体／液泡0.070

排名 4 · TkA03G389950 · TK1151

高尔基体0.066

排名 5 · TkA03G389950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01233NMT74-233 aa

PF04708Pox_F16116-207 aa

PF00583Acetyltransf_1125-209 aa

PF13527Acetyltransf_9134-217 aa

PF02799NMT_C247-427 aa

PF00583Acetyltransf_1373-398 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G389950	`PF01233`	NMT	74	233	1.9e-77	259.3
TkA03G389950	`PF04708`	Pox_F16	116	207	0.074	13.2
TkA03G389950	`PF00583`	Acetyltransf_1	125	209	0.08	13.9
TkA03G389950	`PF13527`	Acetyltransf_9	134	217	0.081	13.6
TkA03G389950	`PF02799`	NMT_C	247	427	2.1e-78	263.3
TkA03G389950	`PF00583`	Acetyltransf_1	373	398	0.08	13.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LTR9`	拟南芥	sp\|Q9LTR9\|NMT1_ARATH Glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 1	79.300%	Swiss-Prot	高置信
`Q94L32`	拟南芥	sp\|Q94L32\|NMT2_ARATH Putative glycylpeptide N-tetradecanoyltransferase 2	65.000%	Swiss-Prot	高置信

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