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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G388850
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 96289072-96291979 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1819 bp · TkA03G388850|TK1151|cDNA

CGACATCGTAGTGCGGATGACACTTTTCGCCCAAATTTATATCGAATACACAGTGAAGGGAGAAAACGATTCTAGGATTTCAAAGACTCGGACAACGCGGCGTCTATCTTCTTCGACCACAACGAGCTAGGGTTTCTTCTTTCTTTACCTCCTTCCAATCATCAAAATCGAACCCTAAATTCAAACCGATCTTCACTCACCCATTTCTTTCATCTCCCTTACAGAAAAACAGACGGAAGATCGTCATTTTTCTTCTTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1269 bp · TkA03G388850|TK1151|CDS

ATGGATGGAAGCCACCCTTTCGTTAATGGCGACGATGAGCAACTTCAATTTGACAACCTTAATCAAAACCATGAAGATTATGATGATAATGTAGATGATAGTGGTGGAGGCAATGAGATAAGACATTCAATCAATGACAGTAGTCGTGACTCTTCAGCAGGAAAACTATTTGTTGGAGGCATTGCCTGGGAGACTTCAGAAGAGTCCTTCAGCAATTACTTCAGCCATTATGGAGAGCTAACAGATTCTGTGATAATGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

422 aa · TkA03G388850|TK1151|PROTEIN

MDGSHPFVNGDDEQLQFDNLNQNHEDYDDNVDDSGGGNEIRHSINDSSRDSSAGKLFVGGIAWETSEESFSNYFSHYGELTDSVIMMDKISGRPRGFGFVTFADPADADKVLEQDHVIDGRPVEVKRTVPREDMQGGRGLSRTKKIFVGGIPLTLTEDDMREYFMSYGDIIEHQIMLDHITGRSRGFGFVTFDSEEAVDKIFADGQLHELGGKQVEIKRAEPKRAGGDFSYDNRSRRGGGGGGGGGGGGGGGGGSKAYGG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G388850
TK1151 IDTkA03G388850
OH-1004 IDLXL04_008274
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 80.332 / OH-1004 64.695
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G388850
位置Chr03:96289072-96291979 (+)
描述Similar to RNP1: Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g14300 参与前 mRNA 加工。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008274 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0006417 regulation of translation 生物过程
GO:0008380 RNA splicing 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0048864 stem cell development 生物过程
GO:0051028 mRNA transport 生物过程
GO:1901000 regulation of response to salt stress 生物过程
GO:2000070 regulation of response to water deprivation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005681 spliceosomal complex 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G14300
cel:CELE_R10E9.1
dme:Dmel_CG32169
hsa:124540
mmu:76626
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.648
排名 1 · TkA03G388850 · TK1151
细胞核0.452
排名 2 · TkA03G388850 · TK1151
细胞膜0.073
排名 3 · TkA03G388850 · TK1151
内质网0.059
排名 4 · TkA03G388850 · TK1151
线粒体0.040
排名 5 · TkA03G388850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24432DUF755542-62 aa
PF16367RRM_755-81 aa
PF00076RRM_156-122 aa
PF23085RRM_PARP14_359-126 aa
PF28441RRM_1160-129 aa
PF14703PHM7_cyt68-114 aa
PF14605Nup35_RRM_272-110 aa
PF08206OB_RNB89-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G388850PF24432DUF755542621.89.3
TkA03G388850PF16367RRM_755813.5e-1143.7
TkA03G388850PF00076RRM_1561223.1e-32111.0
TkA03G388850PF23085RRM_PARP14_3591267.2e-0936.3
TkA03G388850PF28441RRM_11601291.3e-0629.3
TkA03G388850PF14703PHM7_cyt681140.04214.8
TkA03G388850PF14605Nup35_RRM_2721108e-0523.2
TkA03G388850PF08206OB_RNB891090.01216.0
TkA03G388850PF24432DUF75551391511.89.3
TkA03G388850PF23085RRM_PARP14_31432187.2e-0936.3
TkA03G388850PF16367RRM_71442063.5e-1143.7
TkA03G388850PF00076RRM_11462153.1e-32111.0
TkA03G388850PF14605Nup35_RRM_21461978e-0523.2
TkA03G388850PF14703PHM7_cyt1461700.04214.8
TkA03G388850PF28441RRM_111492201.3e-0629.3
TkA03G388850PF08206OB_RNB1801960.01216.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W034拟南芥sp|Q8W034|RNP1_ARATH Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 151.100%Swiss-Prot低置信

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