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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G382010
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 94248457-94250362 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

817 bp · TkA03G382010|TK1151|cDNA

CAAAACGACAACGCATAAGAACTGCCAGGTGTCGACGAAAATGCACCTGAAACCAAAAATATCTGCCGACCCTTCCTCTCCGATACTTCTCCCTGTGATTTACCACTAAAGCGACGAACATGAATAGTAACATACCTCCACCGCCTCATTCAAGATATTTATCAAACACCTTGTCTGCACTCCATACCTATATATATGGACCAAGTCTTCCATAACTCCTCACCGACCATTTTCATTCACATATTCTTCATTTCAATCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

558 bp · TkA03G382010|TK1151|CDS

ATGGATCGTCCCTATAAACGCTCGCTTTCATCTTCTTCGTATCGCCCACAAGGTTCTCATCCGTTACGATTCGAAAACGAAGTCGTAGAATTTGATGATGGAGATGTTCCCCAACCCCTTGATTGCTTAATCGGGACACCAATCCCACCGTTTTTGTCAAAAACTTACGATTTGGTGGATGATCCACGATTAGACCAGATCATATCATGGGGCAATCATGGTGCAAGCTTCATTGTGAGGGACCCAGTGGAGTTCGCAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

186 aa · TkA03G382010|TK1151|PROTEIN

MDRPYKRSLSSSSYRPQGSHPLRFENEVVEFDDGDVPQPLDCLIGTPIPPFLSKTYDLVDDPRLDQIISWGNHGASFIVRDPVEFARVILPRNFKHNNLSSFVRQLNTYGFRKIDTDRWEFACESFLQGKRHLLKNIKRRKTEWNSNPNSNSNSNSNSISIESEVEILQKEKKEMMQEVIKLQQQQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G382010
TK1151 IDTkA03G382010
OH-1004 IDLXL04_005053
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)95.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 48.148
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G382010
位置Chr03:94248457-94250362 (+)
描述Similar to HSFA3: Heat stress transcription factor A-3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g03720 特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件。
A cascade of transcription factor DREB2A and heat stress transcription factor HsfA3 regulates the heat stress response of Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03334.x
Functional analysis of an Arabidopsis heat-shock transcription factor HsfA3 in the transcriptional cascade downstream of the DREB2A stress-regulatory system.2008 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2008.01.134
At3g22830 特异性结合 DNA 序列 5'-AGAAnnTTCT-3' 的转录激活剂，称为热休克启动子元件 (HSE)。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0161900 转录调控因子，特异性结合热休克启动子元素（HSE）的DNA。 暂无已核实直接文献
Os10g0419300 特异性结合热休克启动子元件 DNA 的转录激活剂。
Isolation and characterization of a cDNA encoding two novel heat-shock factor OsHSF6 and OsHSF12 in Oryza sativa L.2005 · DOI: 10.5483/bmbrep.2005.38.5.602
Os03g0795900 在环境应激下表达的转录激活剂，特异性结合热休克启动子元件 的 DNA。
Expression of rice heat stress transcription factor OsHsfA2e enhances tolerance to environmental stresses in transgenic Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1007/s00425-007-0670-4
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005053 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G03720
dosa:Os02g0527300
dosa:Os03g0795900
dosa:Os07g0178600
dosa:Os10g0419300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.939
排名 1 · TkA03G382010 · TK1151
细胞质0.156
排名 2 · TkA03G382010 · TK1151
细胞膜0.019
排名 3 · TkA03G382010 · TK1151
线粒体0.012
排名 4 · TkA03G382010 · TK1151
质体0.010
排名 5 · TkA03G382010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00447HSF_DNA-bind51-140 aa
PF00447HSF_DNA-bind165-176 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G382010PF00447HSF_DNA-bind511404.5e-29101.6
TkA03G382010PF00447HSF_DNA-bind1651764.5e-29101.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GYY1拟南芥sp|Q8GYY1|HSFA3_ARATH Heat stress transcription factor A-359.900%Swiss-Prot高置信
Q9LUH8拟南芥sp|Q9LUH8|HFA6B_ARATH Heat stress transcription factor A-6b54.200%Swiss-Prot高置信
Q8H7Y6水稻sp|Q8H7Y6|HFA2D_ORYSJ Heat stress transcription factor A-2d63.600%Swiss-Prot中等置信
Q338B0水稻sp|Q338B0|HFA2C_ORYSJ Heat stress transcription factor A-2c62.800%Swiss-Prot中等置信
Q6F388水稻sp|Q6F388|HFA2E_ORYSJ Heat stress transcription factor A-2e50.600%Swiss-Prot高置信

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