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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G313840
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 77072727-77079338 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3481 bp · TkA03G313840|TK1151|cDNA

AAGCGCCGGCTCTCATCAGATTGTTTTGAAAATTTTGAGACTTCTCTCTTCTTCTCGCCTAGAATCCAATCCCTATTCCCGACTTCTCTCTTCTTCCTGCACGACCTCGCCGTAGGCGGCTACCGGCTACCATCTCGTCCTCCGTCCTCCGTCCTTTGCCTTGCTGTGTGTCGTCGGCGCCTACCCCTGCTTCCTTGCTTAATCTTGCTGTCGTCTTCCTTGCTCCATCTCGTACGCTGCACAGCTTCCGATTCCAGGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

3039 bp · TkA03G313840|TK1151|CDS

AAGCGCCGGCTCTCATCAGATTGTTTTGAAAATTTTGAGACTTCTCTCTTCTTCTCGCCTAGAATCCAATCCCTATTCCCGACTTCTCTCTTCTTCCTGCACGACCTCGCCGTAGGCGGCTACCGGCTACCATCTCGTCCTCCGTCCTCCGTCCTTTGCCTTGCTGTGTGTCGTCGGCGCCTACCCCTGCTTCCTTGCTTAATCTTGCTGTCGTCTTCCTTGCTCCATCTCGTACGCTGCACAGCTTCCGATTCCAGTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1012 aa · TkA03G313840|TK1151|PROTEIN

KRRLSSDCFENFETSLFFSPRIQSLFPTSLFFLHDLAVGGYRLPSRPPSSVLCLAVCRRRLPLLPCLILLSSSLLHLVRCTASDSSLGSSERMAFSTPISSSYLPRVYSQLSAHDAATETKSRIFLSNTSSLLQRSLTYKAGFPSHLERKESYNLKVSASLTTDVSTPELPVKPSVVKGDTWAIHKFGGTCVGTSERIHNVAEIVKEDSSERKLVVVSAMSKVTDMMYDLIEKAQSRDDSYELALDAVFEKHKSTAHDLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G313840
TK1151 IDTkA03G313840
OH-1004 IDLXL04_029365
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)42.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 26.087 / OH-1004 69.892
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G313840
位置Chr03:77072727-77079338 (-)
描述Similar to Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase, chloroplastic (Fragment)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g19710 双功能天冬氨酸激酶和高丝氨酸脱氢酶，催化从天冬氨酸合成赖氨酸、蛋氨酸和苏氨酸的第一步和第三步。 暂无已核实直接文献
At1g31230 双功能天冬氨酸激酶和高丝氨酸脱氢酶，催化从天冬氨酸合成赖氨酸、蛋氨酸和苏氨酸的第一步和第三步。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029365 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009067 aspartate family amino acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009086 methionine biosynthetic process 生物过程
GO:0009088 L-threonine biosynthetic process 生物过程
GO:0009089 L-lysine biosynthetic process via diaminopimelate 生物过程
GO:0009090 L-homoserine biosynthetic process 生物过程
GO:0051289 protein homotetramerization 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004072 aspartate kinase activity 分子功能
GO:0004412 homoserine dehydrogenase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042802 identical protein binding 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
bab:bbp_183
bas:BUsg_188
ecj:JW0001
eco:b0002
ecoc:C3026_00010
zma:542249
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.954
排名 1 · TkA03G313840 · TK1151
线粒体0.062
排名 2 · TkA03G313840 · TK1151
细胞质0.053
排名 3 · TkA03G313840 · TK1151
过氧化物酶体0.039
排名 4 · TkA03G313840 · TK1151
细胞核0.025
排名 5 · TkA03G313840 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00696AA_kinase183-464 aa
PF06497Baculo_Ac102199-243 aa
PF13840ACT_7500-562 aa
PF00742Homoserine_dh503-524 aa
PF22468ACT_9505-565 aa
PF01842ACT511-564 aa
PF13740ACT_6516-563 aa
PF13840ACT_7581-644 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G313840PF00696AA_kinase1834643.4e-44152.1
TkA03G313840PF06497Baculo_Ac1021992430.08913.6
TkA03G313840PF13840ACT_75005621.2e-1970.6
TkA03G313840PF00742Homoserine_dh5035247.4e-53179.7
TkA03G313840PF22468ACT_95055655.3e-43145.3
TkA03G313840PF01842ACT5115642.1e-1556.9
TkA03G313840PF13740ACT_65165630.02715.0
TkA03G313840PF13840ACT_75816441.2e-1970.6
TkA03G313840PF22468ACT_95876465.3e-43145.3
TkA03G313840PF01842ACT5936342.1e-1556.9
TkA03G313840PF13740ACT_65966190.02715.0
TkA03G313840PF24367DUF75235996430.2212.5
TkA03G313840PF03447NAD_binding_36597953.4e-2280.1
TkA03G313840PF06497Baculo_Ac1026686790.08913.6
TkA03G313840PF00742Homoserine_dh80310017.4e-53179.7
TkA03G313840PF13740ACT_699410080.02715.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O81852拟南芥sp|O81852|AKH2_ARATH Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2, chloroplastic75.900%Swiss-Prot高置信
Q9SA18拟南芥sp|Q9SA18|AKH1_ARATH Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 1, chloroplastic75.200%Swiss-Prot高置信

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