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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G201100
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 50515143-50521316 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3456 bp · TkA03G201100|TK1151|cDNA

TCACTTCTTTTTTCAGCTCTGAAAAATTCAAAGTTAAAACATTTTGGAGGGATAAAACCAAGGGCGGCAAACCAGTGCCATAGCCGGCCCCTCCCCTCAAGCGCCACCTCCGCCCGATCAATGTCCTTCTCCTCCAGATCTTCAAGGTCCTCCATCTCGCCTTTCAGGTCGAGAAAGTCATCCGAACCACCTGTCAAAGGCGCCACTGCTCGTCCCACCAAGCCTCAAACATCGAAGCCACCTATTTCCCCGTCGACTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

3330 bp · TkA03G201100|TK1151|CDS

TCACTTCTTTTTTCAGCTCTGAAAAATTCAAAGTTAAAACATTTTGGAGGGATAAAACCAAGGGCGGCAAACCAGTGCCATAGCCGGCCCCTCCCCTCAAGCGCCACCTCCGCCCGATCAATGTCCTTCTCCTCCAGATCTTCAAGGTCCTCCATCTCGCCTTTCAGGTCGAGAAAGTCATCCGAACCACCTGTCAAAGGCGCCACTGCTCGTCCCACCAAGCCTCAAACATCGAAGCCACCTATTTCCCCGTCGACTCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1109 aa · TkA03G201100|TK1151|PROTEIN

SLLFSALKNSKLKHFGGIKPRAANQCHSRPLPSSATSARSMSFSSRSSRSSISPFRSRKSSEPPVKGATARPTKPQTSKPPISPSTPSISSTKLSERPISTNIKENVTVTVRLRPLNSREIGKGDEIAWFADGDYSLQNEFNPALAYGFDRVFGPATTTRHVYDVAAHHVVNGAMEGINGTVFAYGVTSSGKTHTMHGEQKSPGIIPLAVKDVFGIIQETPGREFLLRVSYLEIYNEVINDLLNPTGQNLRIREDNQGTY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G201100
TK1151 IDTkA03G201100
OH-1004 IDLXL04_007641
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.032 / OH-1004 98.889
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G201100
位置Chr03:50515143-50521316 (+)
描述Similar to KIN7E: Kinesin-like protein KIN-7E, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g21730 类动力蛋白KIN-7C，线粒体。 暂无已核实直接文献
At5g06670 类动力蛋白KIN-7L，叶绿体型。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0434600 类驱动蛋白 KIN-7E，叶绿体定位。 暂无已核实直接文献
Os02g0775400 可能的向负端驱动电机蛋白，具有微管增强的 ATP 酶活性。 暂无已核实直接文献
Os10g0512800 类驱动蛋白KIN-7K，叶绿体型。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007641 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005871 kinesin complex 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0000287 magnesium ion binding 分子功能
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G21730
ath:AT4G39050
ath:AT5G06670
osa:9271714
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.634
排名 1 · TkA03G201100 · TK1151
细胞核0.325
排名 2 · TkA03G201100 · TK1151
细胞膜0.120
排名 3 · TkA03G201100 · TK1151
高尔基体0.057
排名 4 · TkA03G201100 · TK1151
溶酶体／液泡0.046
排名 5 · TkA03G201100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd106-243 aa
PF00225Kinesin112-424 aa
PF19697Atg11_middle202-210 aa
PF05951Peptidase_M15_2345-433 aa
PF16796Microtub_bd393-445 aa
PF19697Atg11_middle427-457 aa
PF17414MatP_C431-457 aa
PF05951Peptidase_M15_2557-582 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G201100PF16796Microtub_bd1062439.5e-2071.8
TkA03G201100PF00225Kinesin1124244.6e-104348.7
TkA03G201100PF19697Atg11_middle2022100.1712.8
TkA03G201100PF05951Peptidase_M15_23454330.2511.8
TkA03G201100PF16796Microtub_bd3934459.5e-2071.8
TkA03G201100PF19697Atg11_middle4274570.1712.8
TkA03G201100PF17414MatP_C4314570.1513.1
TkA03G201100PF05951Peptidase_M15_25575820.2511.8
TkA03G201100PF04728LPP6646967.07.7
TkA03G201100PF16796Microtub_bd7217599.5e-2071.8
TkA03G201100PF00225Kinesin7427654.6e-104348.7
TkA03G201100PF04728LPP8698877.07.7
TkA03G201100PF30366YehQ_4HB8919590.4811.3
TkA03G201100PF19697Atg11_middle8999390.1712.8
TkA03G201100PF04728LPP9149417.07.7
TkA03G201100PF19697Atg11_middle9419760.1712.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8W5R6拟南芥sp|Q8W5R6|KN7C_ARATH Kinesin-like protein KIN-7C, mitochondrial65.400%Swiss-Prot高置信
F4K3X8拟南芥sp|F4K3X8|KN7L_ARATH Kinesin-like protein KIN-7L, chloroplastic52.200%Swiss-Prot高置信
B9FFA3水稻sp|B9FFA3|KN7E_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7E, chloroplastic63.800%Swiss-Prot高置信
Q6YZ52水稻sp|Q6YZ52|KN7D_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7D, chloroplastic54.100%Swiss-Prot高置信
Q9FW70水稻sp|Q9FW70|KN7K_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7K, chloroplastic52.100%Swiss-Prot高置信

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