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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G200980
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 50470203-50478338 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

6973 bp · TkA03G200980|TK1151|cDNA

AAAGGAAATGATTGTTTTGATTTTGAGACAGCGTAGTAAAGAGCTGAAAAAAACCCACAGTGGAAAAGCAGCCTCGTTTCTCTCTCAATTGCCGACGGGGACCCGCTTTCACTACATTACATCTTGCAGGATACACCATTTGATGTTCCGAGTTCCAGACCACTCTTTGCGAGACAGCATTTTCGTTATGTATCTGTGTTAGCTGAGGAGGCTGCAAGGGGTACTTTCAAGTGAAGTATTGGTTCAAATGTCAAAATATC...

CDS

下载 CDS FASTA

3231 bp · TkA03G200980|TK1151|CDS

ATGTCAAAATATCCCTTCCTTGATCCACCAGAAAATGCTGCATCTGGAAACAGGACATCAAATGGAAGCACCAAAGCAGACGATGCTGAAGAAACAATCTCCATGGTTGCTCAATTTCTCGAGCAACTCCATGGAAACATCTCTTCACCGCATGAAAAAGAAGCTATTACAACACAATTGCTCGCCATTGCTAAATCAAAAAAGGAGGCACGCTCTATCATAGGTTCACATTCTCAAGCAATGCCATTGTTCATATCCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1076 aa · TkA03G200980|TK1151|PROTEIN

MSKYPFLDPPENAASGNRTSNGSTKADDAEETISMVAQFLEQLHGNISSPHEKEAITTQLLAIAKSKKEARSIIGSHSQAMPLFISILRTGTPLAKLNVAATLTALCKDEELRLKVLLGGCIPPLLSLLKSESTKSKMAAAEAIFEVSSGGLSDDHVGMKIFVTEGVVPTLWEQLTSKTRQDKVVVGFITGALRNLCGDKDGYWRVTLEAGGVDIIVRLLSSNNAAIQSNAASLLARLMLAFNNSMQKIIDSGAIEALLG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G200980
TK1151 IDTkA03G200980
OH-1004 IDLXL04_007479
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)41.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.955 / OH-1004 49.609
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G200980
位置Chr03:50470203-50478338 (+)
描述Similar to CSI1: Protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g77460 微管细胞骨架的调节因子（通过相似性）。
Cellulose synthase INTERACTIVE3 regulates cellulose biosynthesis in both a microtubule-dependent and microtubule-independent manner in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.116715
At1g44120 微管细胞骨架的调控因子。 暂无已核实直接文献
At2g22125 微管细胞骨架的调控因子。
POM-POM2/cellulose synthase interacting1 is essential for the functional association of cellulose synthase and microtubules in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.111.093575
The Arabidopsis ARCP protein, CSI1, which is required for microtubule stability, is necessary for root and anther development.2012 · DOI: 10.1105/tpc.111.095059
Impaired cellulose synthase guidance leads to stem torsion and twists phyllotactic patterns in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1016/j.cub.2013.04.013
Cellulose synthase INTERACTIVE3 regulates cellulose biosynthesis in both a microtubule-dependent and microtubule-independent manner in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.116715
CESA TRAFFICKING INHIBITOR inhibits cellulose deposition and interferes with the trafficking of cellulose synthase complexes and their associated proteins KORRIGAN1 and POM2/CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE PROTEIN1.2015 · DOI: 10.1104/pp.114.249003

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007479 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007166 cell surface receptor signaling pathway 生物过程
GO:0008360 regulation of cell shape 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0009833 plant-type primary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程
GO:0010215 cellulose microfibril organization 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0034614 cellular response to reactive oxygen species 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G44120
ath:AT1G77460
ath:AT2G22125
ath:AT2G23140
ath:AT2G28830
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.470
排名 1 · TkA03G200980 · TK1151
细胞核0.435
排名 2 · TkA03G200980 · TK1151
细胞膜0.156
排名 3 · TkA03G200980 · TK1151
内质网0.062
排名 4 · TkA03G200980 · TK1151
高尔基体0.045
排名 5 · TkA03G200980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03224V-ATPase_H_N34-89 aa
PF20168PDS538-168 aa
PF11701UNC45-central39-77 aa
PF24768ARM_ARMC540-169 aa
PF21050ARMC9_ARM54-113 aa
PF16782SIL157-109 aa
PF25598ARM_PUB59-281 aa
PF13513HEAT_EZ72-105 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G200980PF03224V-ATPase_H_N34894.4e-0833.6
TkA03G200980PF20168PDS5381680.1610.4
TkA03G200980PF11701UNC45-central39770.2411.9
TkA03G200980PF24768ARM_ARMC5401694.1e-2382.9
TkA03G200980PF21050ARMC9_ARM541137.4e-0626.7
TkA03G200980PF16782SIL1571090.3111.0
TkA03G200980PF25598ARM_PUB592812.2e-1764.1
TkA03G200980PF13513HEAT_EZ721052.7e-0938.0
TkA03G200980PF00514Arm771072.5e-34116.9
TkA03G200980PF23271HEAT_GCN1801450.009516.8
TkA03G200980PF02985HEAT821085.9e-0523.7
TkA03G200980PF13646HEAT_2831441.4e-1248.4
TkA03G200980PF13513HEAT_EZ991432.7e-0938.0
TkA03G200980PF28415SIL1_FES1_HPBP1_C1051481.8e-0938.1
TkA03G200980PF00514Arm1201452.5e-34116.9
TkA03G200980PF21419RoxA-like_Cyt-c1201330.1312.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4I718拟南芥sp|F4I718|CSI3_ARATH Protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 356.600%Swiss-Prot高置信
Q9C6Y4拟南芥sp|Q9C6Y4|CSI2_ARATH Protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 244.800%Swiss-Prot中等置信
F4IIM1拟南芥sp|F4IIM1|CSI1_ARATH Protein CELLULOSE SYNTHASE INTERACTIVE 140.600%Swiss-Prot中等置信

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