TkA03G157170 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G157170

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 39853595-39856747 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1748 bp · TkA03G157170|TK1151|cDNA

AAATAAGTGTAACTACAGGGGCCGTTTGCTCAAATCTGTGTTGAATAACAGGTCAATGCTTAAAGCCCCAACACTACTACACGGTGGTTAGGATCCAAACCTCAAGAACCCTAAAACCAAAGGAAGATAACATGGCGAATTTCTCCATCGCCACCGTCTTCATTGCCTCGATCTCACTGTTACTCGCACTCACCCACTCATTTTCTATCGAGAACCCTACAGATCGGCGCATTTTAGTGTTGGTCGACGACTTGGCTCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1317 bp · TkA03G157170|TK1151|CDS

ATGGCGAATTTCTCCATCGCCACCGTCTTCATTGCCTCGATCTCACTGTTACTCGCACTCACCCACTCATTTTCTATCGAGAACCCTACAGATCGGCGCATTTTAGTGTTGGTCGACGACTTGGCTCTCAAGTCTTCGCACTCGATCTTCTTCAGCTCATTACAGGCACGTGGATTTGAGCTCGATTTCAAGCTCTCAGATGATCCCAAGATCTCGCTTCAGAGATACGGGCAACATTTATATGATGGCCTGATTCTGTT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

438 aa · TkA03G157170|TK1151|PROTEIN

MANFSIATVFIASISLLLALTHSFSIENPTDRRILVLVDDLALKSSHSIFFSSLQARGFELDFKLSDDPKISLQRYGQHLYDGLILFSPTTERFGGSLDVAAILDFVDSGKDLIVAADANASDLIRNIAAECGIDFDEDQSAVVIDHGSYAVSETEGDHTLIAADDLIQSDVLLGSTKIEAPVLFKGIGHSLNPANSLVVKVLSASPSAYSANPKSKLSTPPSLSGSSISLVSVVQARNNARVVFSGSLDLFSNKFFKSP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G157170`
TK1151 ID	TkA03G157170
OH-1004 ID	LXL04_007327
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G157170

位置 Chr03:39853595-39856747 (+)

描述 Similar to OST48: Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g66680`	寡糖基转移酶（OST）复合物的亚基，将特定糖链（真核生物中为Glc(3)Man(9)GlcNAc(2)）从脂质载体多萜醇焦磷酸转移至新生多肽Asn-X-Ser/Thr共有基序中的天冬酰胺残基，催化蛋白质N-糖基化的第一步。	Mutants in DEFECTIVE GLYCOSYLATION, an Arabidopsis homolog of an oligosaccharyltransferase complex subunit, show protein underglycosylation and defects in cell differentiation and growth.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02392.x

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os07g0209000`	寡糖基转移酶（OST）复合物的亚基，将特定糖链（真核生物中为Glc(3)Man(9)GlcNAc(2)）从脂质载体多萜醇焦磷酸转移至新生多肽Asn-X-Ser/Thr共有基序中的天冬酰胺残基，催化蛋白质N-糖基化的第一步。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007327 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006487 protein N-linked glycosylation 生物过程

GO:0009101 glycoprotein biosynthetic process 生物过程

GO:0009664 plant-type cell wall organization 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0031647 regulation of protein stability 生物过程

GO:0034097 response to cytokine 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005730 nucleolus 细胞组分

GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G66680

dosa:Os07g0209000

mmu:13200

xla:444283

xtr:100145597

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.870

排名 1 · TkA03G157170 · TK1151

细胞核0.081

排名 2 · TkA03G157170 · TK1151

细胞质0.080

排名 3 · TkA03G157170 · TK1151

高尔基体0.067

排名 4 · TkA03G157170 · TK1151

溶酶体／液泡0.054

排名 5 · TkA03G157170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03345OST48_N30-289 aa

PF09822ABC_transp_aux72-124 aa

PF14258DUF435095-259 aa

PF09822ABC_transp_aux198-280 aa

PF23358OST48_MD300-438 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G157170	`PF03345`	OST48_N	30	289	3.2e-77	260.1
TkA03G157170	`PF09822`	ABC_transp_aux	72	124	0.0011	19.0
TkA03G157170	`PF14258`	DUF4350	95	259	0.026	15.5
TkA03G157170	`PF09822`	ABC_transp_aux	198	280	0.0011	19.0
TkA03G157170	`PF23358`	OST48_MD	300	438	1.2e-48	165.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q944K2`	拟南芥	sp\|Q944K2\|OST48_ARATH Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit	75.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q6ZLK0`	水稻	sp\|Q6ZLK0\|OST48_ORYSJ Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase 48 kDa subunit	77.600%	Swiss-Prot	高置信

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