TkA03G026750 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA03G026750

当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 7167164-7185121 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2598 bp · TkA03G026750|TK1151|cDNA

TATGCTATACTTTATGATATAATACGAAATCTCTTTGCAAAGATTGAATTCCCTTATAAAAAAAGGCGGGTACTCCCATTTCAGGTAGGTTAACATAAAGATCTTCCTTTACTTCCCAATCTGTGTATCTGTCGCCGGCGGGAAATCATCTTTGATTCAGACTTTCTGGGCCTATTAAGGCCGTAATTCTGGAAGGATGATTCTTTCTGCTCTTTTGACATCCGTTGGAATAAACTTCGGTTTATGTATTATATACATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1236 bp · TkA03G026750|TK1151|CDS

ATGTATGCCTTCACTGCATTTGTGTACTATCTTCTGTATGATGAGTATAGTTATATATCTTCGAAAAGGCTTGCATTCTACTCCTCATCCGAGCCTAAGTTCAACGAATTTACAGTATTGGTTCGAGGTATCCCAAAGTCATCCACCCAAAGCTTAAATGAAACTGTTGAGAAATTTTTCTCAGAGTGTTATCCTTCGTCATATCTATCACATTATATGGTCTATAACACTTCAAAGATTTGGAAGCTAATTCTTGATGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

411 aa · TkA03G026750|TK1151|PROTEIN

MYAFTAFVYYLLYDEYSYISSKRLAFYSSSEPKFNEFTVLVRGIPKSSTQSLNETVEKFFSECYPSSYLSHYMVYNTSKIWKLILDAKEIYERLSNLKSTKKRSQRYGRVGFFGLCGPKVDLVEYYEKELEDLEDKVRMEQTLLNGKEHRAAFVSFKSRIGAAVTLHIQQGPNPTEWLTEQAPEDRDIYWAFFSTSFLTRWIGNVVVVIACVILTILFFIPVVIVQGLTNLYTLEAWFPFLKGILDINIISQVITGYLPS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA03G026750`
TK1151 ID	TkA03G026750
OH-1004 ID	LXL04_006325
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 90.268 / OH-1004 55.045 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA03G026750

位置 Chr03:7167164-7185121 (+)

描述 Similar to HYP1: CSC1-like protein HYP1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g01100`	作为一种渗透敏感的钙可通透阳离子通道。	暂无已核实直接文献
`At1g69450`	作为一种渗透敏感的钙可通透阳离子通道。	暂无已核实直接文献
`At1g62320`	作为一种渗透敏感的钙可通透阳离子通道。	暂无已核实直接文献
`At1g11960`	在植物气孔免疫中起关键作用的钙渗透通道。	The calcium-permeable channel OSCA1.3 regulates plant stomatal immunity.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2702-1
`At1g58520`	作为一种渗透敏感的钙可通透阳离子通道。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_006325 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007231 osmosensory signaling pathway 生物过程

GO:0010118 stomatal movement 生物过程

GO:0045087 innate immune response 生物过程

GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0005227 calcium-activated cation channel activity 分子功能

GO:0005262 calcium channel activity 分子功能

GO:0008381 mechanosensitive monoatomic ion channel activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G10090

ath:AT1G11960

ath:AT1G58520

ath:AT1G69450

ath:AT3G01100

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.512

排名 1 · TkA03G026750 · TK1151

内质网0.192

排名 2 · TkA03G026750 · TK1151

细胞质0.155

排名 3 · TkA03G026750 · TK1151

溶酶体／液泡0.147

排名 4 · TkA03G026750 · TK1151

高尔基体0.090

排名 5 · TkA03G026750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14703PHM7_cyt37-191 aa

PF24825SNU71_RBD37-112 aa

PF27598AKAP9_coil_N87-183 aa

PF02714RSN1_7TM205-373 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA03G026750	`PF14703`	PHM7_cyt	37	191	1.3e-38	133.7
TkA03G026750	`PF24825`	SNU71_RBD	37	112	0.1	13.8
TkA03G026750	`PF27598`	AKAP9_coil_N	87	183	0.26	10.8
TkA03G026750	`PF02714`	RSN1_7TM	205	373	6.1e-42	144.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GUH7`	拟南芥	sp\|Q8GUH7\|OSC23_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 2.3	57.000%	Swiss-Prot	高置信
`F4I248`	拟南芥	sp\|F4I248\|OSC24_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 2.4	51.700%	Swiss-Prot	高置信
`F4HYR3`	拟南芥	sp\|F4HYR3\|OSC14_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 1.4	38.100%	Swiss-Prot	中等置信
`B5TYT3`	拟南芥	sp\|B5TYT3\|OSC13_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 1.3	37.100%	Swiss-Prot	中等置信
`F4IBD7`	拟南芥	sp\|F4IBD7\|OSC21_ARATH Hyperosmolality-gated Ca2+ permeable channel 2.1	41.100%	Swiss-Prot	中等置信

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