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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G012950
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 3363183-3367830 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1594 bp · TkA03G012950|TK1151|cDNA

TCAAACTAGAAGGTTGACAGTGCCAATCTTTCAAAAAACAATGGAGCATAATGCAAATCATCTGTATAAATTGCAAGGGCCTCTTTCTCCATCAACTCTGGTTGCAAAACTGAGAAAAAAAACGACCAGTCCCACACCGCCGGGATCTATATTTCCGGTGAATTCCCTACTGTCTCCGGTCATACATATTCTCTACCCACATATAAACACAAAATTCTAAGTTTCCTGTTCGATTCACTAGGGAAAGTAGTCTAGACAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

840 bp · TkA03G012950|TK1151|CDS

ATGGAATCTGGTCGTCTTTTTTTTGGTTCCAACAGTAACAACATGCTTTTCCTCGGGAATGGAGACAACTATTTTAGCGGAACGAGAATGGGGTTCAACATGGAAGAATCTTCGAAGAAGAGGCCATTTTTGAGCTCGATCGATGACATGATGGAAGACGAATACTACGACGAACAATTGACGGAAAAGAAACGGCGTCTCAGCCCCGAACAGGTACACATGCTGGAACAAAGCTTTGAGGAAGACAACAAACTGGAGCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

279 aa · TkA03G012950|TK1151|PROTEIN

MESGRLFFGSNSNNMLFLGNGDNYFSGTRMGFNMEESSKKRPFLSSIDDMMEDEYYDEQLTEKKRRLSPEQVHMLEQSFEEDNKLEPERKTELAKKLGLQPRQVAVWFQNRRARWKTKTLERDYDRLKSSYDILTSDFDSIVKENEKLKAEVISLTEKLQSKEAVTDDQDTDIAAEEAGSGHVPPLSTTVKLEDHLSTGSGAGSAVVDDLDGPQLVDSGDSYFPETNEYTHEYAAAPVDQSEEDDGSDDGQKNFEYQFAT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G012950
TK1151 IDTkA03G012950
OH-1004 IDLXL04_008618
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)50.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 51.613 / OH-1004 45.846
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G012950
位置Chr03:3363183-3367830 (+)
描述Similar to HAT5: Homeobox-leucine zipper protein HAT5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g01470 可能参与叶发育的转录激活子。
Ectopic expression of the Arabidopsis transcriptional activator Athb-1 alters leaf cell fate in tobacco.1995 · DOI: 10.1105/tpc.7.11.1773

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0729700 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2X980 可能的转录因子。 暂无已核实直接文献
Os08g0416000 可能的转录激活因子，结合DNA序列5'-CAAT[AT]ATTG-3'。 暂无已核实直接文献
UniProt: Q9XH36 可能的转录激活因子，结合DNA序列5'-CAAT[AT]ATTG-3'。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008618 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048826 cotyledon morphogenesis 生物过程
GO:0080022 primary root development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G69780
ath:AT3G01470
dosa:Os02g0729700
dosa:Os08g0481400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.980
排名 1 · TkA03G012950 · TK1151
细胞质0.079
排名 2 · TkA03G012950 · TK1151
细胞膜0.023
排名 3 · TkA03G012950 · TK1151
内质网0.015
排名 4 · TkA03G012950 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA03G012950 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15934Yuri_gagarin35-161 aa
PF20733LRIM1_dimer43-86 aa
PF05103DivIVA58-86 aa
PF06156YabA59-89 aa
PF03432Relaxase60-97 aa
PF00046Homeodomain63-116 aa
PF28533DUF842963-70 aa
PF25450Rab11-FIP370-163 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G012950PF15934Yuri_gagarin351610.06913.7
TkA03G012950PF20733LRIM1_dimer43861.59.4
TkA03G012950PF05103DivIVA58860.2711.9
TkA03G012950PF06156YabA59890.09814.0
TkA03G012950PF03432Relaxase60970.09313.7
TkA03G012950PF00046Homeodomain631161.1e-1867.5
TkA03G012950PF28533DUF842963700.03214.8
TkA03G012950PF25450Rab11-FIP3701631.59.9
TkA03G012950PF04977DivIC83990.2711.7
TkA03G012950PF05920Homeobox_KN871143.3e-0524.3
TkA03G012950PF28533DUF84291151640.03214.8
TkA03G012950PF02183HALZ1181604e-1762.8
TkA03G012950PF06156YabA1181720.09814.0
TkA03G012950PF20733LRIM1_dimer1211751.59.4
TkA03G012950PF04977DivIC1221570.2711.7
TkA03G012950PF03432Relaxase1261760.09313.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q02283拟南芥sp|Q02283|HAT5_ARATH Homeobox-leucine zipper protein HAT549.000%Swiss-Prot中等置信
Q6YWR4水稻sp|Q6YWR4|HOX16_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX1651.500%Swiss-Prot高置信
A2X980水稻sp|A2X980|HOX16_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX1650.800%Swiss-Prot高置信
Q6ZA74水稻sp|Q6ZA74|HOX5_ORYSJ Homeobox-leucine zipper protein HOX552.400%Swiss-Prot中等置信
Q9XH36水稻sp|Q9XH36|HOX5_ORYSI Homeobox-leucine zipper protein HOX552.400%Swiss-Prot中等置信

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