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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G609420
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 157177761-157181892 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2858 bp · TkA02G609420|TK1151|cDNA

CTCAGGATCACCGAGCACGTATTCGTTTCCTAATAATGTATCCAATCACATCGAAAATAGATAAAATCCCACCCTCAAAATAAAAGAAAAAGAAAAAGAACAGAGCGCCAAGTTCAATCGTCTTATGGGAGATAAGGTTTCTCCTCTCCTGATCCTCCTCCCCTTTTATTTTCTTTCACCGATTGTGTGGCTCACTTTGGCTAACAAGAGTTAATATAAAAAACTGAGCTCGGTTTTCATCGATAAACTTCTTCATAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2373 bp · TkA02G609420|TK1151|CDS

ATGTCTGCTCTTCAAGCTTTTCTCATCTGTAAACCCCCAACAGTCTCTAATCTAGTGCCTCACTCAAGACGTCTTCAATTTCATCGTATTCACTCTTTTAATTTGGGTTCTTTTCCTTCAACAAGTTATCGCAATAAAACTCGCCCTTTCTTCGCATTGCATCAAGATAATGTCGATTCGAATTCGGGTCTAGCTTCATCGAGTAATGGTAATCACAATCTAGCACGGGAGTCGGAGACCCAAGTTGTCGACTTTACCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

790 aa · TkA02G609420|TK1151|PROTEIN

MSALQAFLICKPPTVSNLVPHSRRLQFHRIHSFNLGSFPSTSYRNKTRPFFALHQDNVDSNSGLASSSNGNHNLARESETQVVDFTEGEVSNSEECLNEAEGEINGAGDEVGKEKGKLPLFVFLMGFFARMKSGFEKMLLSDGFSWWPFWRQEKKLELLISEADLNPKDAAKQSALLVELNKHSPESVIRRFEQRQYAVDSKGVAEYIRALVATNAIAEYLPDEQSGKPSSLPALLQELKQRASGNLDESFLNPGISERQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G609420
TK1151 IDTkA02G609420
OH-1004 IDLXL04_011839
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G609420
位置Chr02:157177761-157181892 (+)
描述Similar to FTSH11: ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g53170 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。
FtsH11 protease plays a critical role in Arabidopsis thermotolerance.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02855.x
At2g26140 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0618800 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
Os01g0574500 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
Os01g0574400 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011839 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0010073 meristem maintenance 生物过程
GO:0010304 PSII associated light-harvesting complex II catabolic process 生物过程
GO:0045037 protein import into chloroplast stroma 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26140
ath:AT5G53170
dosa:Os01g0574400
dosa:Os01g0574500
dosa:Os01g0618800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.923
排名 1 · TkA02G609420 · TK1151
线粒体0.082
排名 2 · TkA02G609420 · TK1151
细胞质0.031
排名 3 · TkA02G609420 · TK1151
细胞核0.029
排名 4 · TkA02G609420 · TK1151
细胞膜0.019
排名 5 · TkA02G609420 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13191AAA_16174-240 aa
PF13238AAA_18184-197 aa
PF13401AAA_22225-284 aa
PF02367TsaE371-402 aa
PF06414Zeta_toxin374-399 aa
PF05496RuvB_N375-445 aa
PF13191AAA_16376-400 aa
PF06068TIP49377-412 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G609420PF13191AAA_161742400.0002522.3
TkA02G609420PF13238AAA_181841970.0117.0
TkA02G609420PF13401AAA_222252845.8e-0524.1
TkA02G609420PF02367TsaE3714020.212.3
TkA02G609420PF06414Zeta_toxin3743990.2611.4
TkA02G609420PF05496RuvB_N3754450.003317.9
TkA02G609420PF13191AAA_163764000.0002522.3
TkA02G609420PF06068TIP493774120.0009319.2
TkA02G609420PF06745ATPase3783940.06113.4
TkA02G609420PF01695IstB_IS213784000.1312.5
TkA02G609420PF13245AAA_193783980.5511.1
TkA02G609420PF00004AAA3795074.6e-42144.3
TkA02G609420PF07728AAA_53794474.3e-0524.2
TkA02G609420PF13401AAA_223794025.8e-0524.1
TkA02G609420PF13521AAA_283794120.0008620.3
TkA02G609420PF20720nSTAND33794750.001419.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FGM0拟南芥sp|Q9FGM0|FTSHB_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 11, chloroplastic/mitochondrial75.300%Swiss-Prot高置信
O80983拟南芥sp|O80983|FTSH4_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 4, mitochondrial52.300%Swiss-Prot高置信
A2ZVG7水稻sp|A2ZVG7|FTSH9_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 9, chloroplastic/mitochondrial78.000%Swiss-Prot高置信
Q8LQJ8水稻sp|Q8LQJ8|FTSH5_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 5, mitochondrial51.800%Swiss-Prot高置信
Q8LQJ9水稻sp|Q8LQJ9|FTSH4_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 4, mitochondrial50.100%Swiss-Prot高置信

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