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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G592880
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 152964214-152967293 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2620 bp · TkA02G592880|TK1151|cDNA

CGACGGTGCACCATAACCATGTACACCTGCAACATAGTAATCTGATCGAGCGGCCACGAAATACACTTCAGATTCCACCTTACATCTCGTGGACTCTCCCTCCAACCTTGACTTGCCAGCTGGTCTTCACAAGGGAACACTCTGCACCATCATCGTCTACATCTTCATCTGCAAAGACCTGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGTCAAAAAGAAAATTCCAACAAAACCCATGGCTCGTGCTGAAAACCACACTCCGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

2001 bp · TkA02G592880|TK1151|CDS

ATGGGTGTTTCATCGTTTCTTTTGTTGCTCTCTCTGTTCTTCACCATATTGTGTGCACCAACTGTTTGTGGAAACGCAGAGCTTCGAGCCCTGATGGACATCAAGACCAGTCTAGACCCATACAACCTACATTTGGGCTCCTGGACTGTATTGGGAAACCATTGCGACTTCGAAGGCGTTGGGTGCAATGAAATGGGTCAGGTCGCTAATATTTCTTTACAGGGGAAAGGTCTCTCCGGTAAACTCTCGCCGGCGTTTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

666 aa · TkA02G592880|TK1151|PROTEIN

MGVSSFLLLLSLFFTILCAPTVCGNAELRALMDIKTSLDPYNLHLGSWTVLGNHCDFEGVGCNEMGQVANISLQGKGLSGKLSPAFSELKHLTGLYLHYNSLSGDFPKEIANLTELSDLYLNVNNLSGSIPVELENMESLQVLQLCYNQFSGSIPTQLGSLKKLTVLSLQFNHLSGALPASLGDLALLTRLDLSFNRLFGSIPTRLADAPMLQVLDVRNNTLSGNVPLALQRLGEGFQFSNNFGLCGVDFTTLKACSALD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G592880
TK1151 IDTkA02G592880
OH-1004 IDLXL04_012011
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 94.737
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G592880
位置Chr02:152964214-152967293 (+)
描述Similar to NIK2: Protein NSP-INTERACTING KINASE 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g16670 冷冻耐受的负调控因子，通过磷酸化14-3-3蛋白（例如GRF6）触发其从细胞质转移到细胞核以应对冷胁迫。 暂无已核实直接文献
At1g19090 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶1。 暂无已核实直接文献
At4g23260 富半胱氨酸的类受体蛋白激酶 18。 暂无已核实直接文献
At1g34210 参与油菜素甾醇依赖和非依赖信号通路的丝氨酸/苏氨酸激酶。
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0457800 LRR 受体激酶参与体细胞胚胎发生的正向调节和对稻瘟病菌病原体 Magnaporthe oryzae 的防御反应。
Rice SERK1 gene positively regulates somatic embryogenesis of cultured cell and host defense response against fungal infection.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1534-4
An XA21-associated kinase (OsSERK2) regulates immunity mediated by the XA21 and XA3 immune receptors.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu003
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012011 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0042659 regulation of cell fate specification 生物过程
GO:0045184 establishment of protein localization 生物过程
GO:0048638 regulation of developmental growth 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程
GO:0090708 specification of plant organ axis polarity 生物过程
GO:0160073 Casparian strip assembly 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G25560
ath:AT4G20140
dosa:Os02g0283800
osa:4329032
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.852
排名 1 · TkA02G592880 · TK1151
内质网0.080
排名 2 · TkA02G592880 · TK1151
细胞质0.076
排名 3 · TkA02G592880 · TK1151
细胞核0.061
排名 4 · TkA02G592880 · TK1151
溶酶体／液泡0.024
排名 5 · TkA02G592880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_225-63 aa
PF06480FtsH_ext65-79 aa
PF00560LRR_171-89 aa
PF23598LRR_1481-219 aa
PF13855LRR_885-126 aa
PF12799LRR_490-130 aa
PF24758LRR_At5g5637090-150 aa
PF00560LRR_191-113 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G592880PF08263LRRNT_225632.1e-0628.6
TkA02G592880PF06480FtsH_ext65790.2312.4
TkA02G592880PF00560LRR_171892.3e-1657.1
TkA02G592880PF23598LRR_14812191.3e-0938.0
TkA02G592880PF13855LRR_8851262.3e-1453.6
TkA02G592880PF12799LRR_4901301.4e-1041.8
TkA02G592880PF24758LRR_At5g56370901500.113.0
TkA02G592880PF00560LRR_1911132.3e-1657.1
TkA02G592880PF00560LRR_11161372.3e-1657.1
TkA02G592880PF24758LRR_At5g563701191730.113.0
TkA02G592880PF00560LRR_11391612.3e-1657.1
TkA02G592880PF13855LRR_81391982.3e-1453.6
TkA02G592880PF12799LRR_41391741.4e-1041.8
TkA02G592880PF13516LRR_61391510.00417.8
TkA02G592880PF24758LRR_At5g563701612230.113.0
TkA02G592880PF12799LRR_41622021.4e-1041.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93YN1拟南芥sp|Q93YN1|CRPK1_ARATH Cold-responsive protein kinase 135.400%Swiss-Prot低置信
Q9LMB9拟南芥sp|Q9LMB9|CRK1_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 135.800%Swiss-Prot低置信
Q8RX80拟南芥sp|Q8RX80|CRK18_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1837.300%Swiss-Prot低置信
Q9XIC7拟南芥sp|Q9XIC7|SERK2_ARATH Somatic embryogenesis receptor kinase 231.800%Swiss-Prot低置信
Q7XV05水稻sp|Q7XV05|SERK2_ORYSJ LRR receptor kinase SERK232.200%Swiss-Prot低置信

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