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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G588200
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 151795347-151800062 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2327 bp · TkA02G588200|TK1151|cDNA

ATTCCTTCCTCTGTATTAGCTGTAACGTTGAACGCCAAATGCGGAGTTGGTGACATAATCACCGTCACAGAAGTCATCACTTGATCACCAAACTCCGCGGTCTCACCGGGGGCACATTCTCTACGTTTACCTCTCTCTACAGCAGTGTTGGGGGCTCTTAACAGCTAAGGTCTGCAGGGCCAAAAGGTGACCCTGAAGAGGTGCAGATAGCTATGAATTTGCGTTTTGGCATTGTCTAACAAGAATGCCAGGCATACCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1266 bp · TkA02G588200|TK1151|CDS

ATGGGGAAGATTCCACTTGATTTCCTTCATCTGTCATGGGAGAAATCCCCAAATTTAAGTTTAGGAGAGAGAGTTGAGGTGATGTCAACTGTGAGCATGCAGTCCTGTTTTATGAAGTTAACTGGTACTTCAGCTAAGGAGAAATGTCTATCTTTTCAGCTTCCATATAATTCTGAAGCTGTGAGTATATTGCAGCAAGTACCTGTGATGATATCTGCTGAAGAGCTTGGGGCAAAAGATATATCACCTTATGACGTTTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

421 aa · TkA02G588200|TK1151|PROTEIN

MGKIPLDFLHLSWEKSPNLSLGERVEVMSTVSMQSCFMKLTGTSAKEKCLSFQLPYNSEAVSILQQVPVMISAEELGAKDISPYDVYSYNNIPRNSMPHVIRLRTGNVVFNYKYYNNILQRSEVTEDYSCPFCLVKCASYKGLKLHLVSSHDLFRFEFWVNEDYQVVIVSVKSDTGTSEIFGNIADPRQQSLFFCRKPLSRKDPTLKTNHVLPSVLDSDVPATLANLRGDSEPMEIDIYSPNAKDVTGPESPQTLPATKL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G588200
TK1151 IDTkA02G588200
OH-1004 IDLXL04_012085
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 68.013
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G588200
位置Chr02:151795347-151800062 (+)
描述Similar to EMF2: Polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q8L6Y4 多梳族 (PcG) 蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g16845 多梳族 蛋白。
The VERNALIZATION 2 gene mediates the epigenetic regulation of vernalization in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1016/s0092-8674(01)00573-6
A PHD-polycomb repressive complex 2 triggers the epigenetic silencing of FLC during vernalization.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0808687105
UniProt: P0DKJ7 多梳族 (PcG) 蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g35670 多梳族 (PcG) 蛋白。
Identification of new members of Fertilisation Independent Seed Polycomb Group pathway involved in the control of seed development in Arabidopsis thaliana.2004 · DOI: 10.1242/dev.01168

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0306800 多梳族 (PcG) 蛋白。
Expression, imprinting, and evolution of rice homologs of the polycomb group genes.2009 · DOI: 10.1093/mp/ssp036
Os04g0162100 多梳族 (PcG) 蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012085 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006325 chromatin organization 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009910 negative regulation of flower development 生物过程
GO:0010048 vernalization response 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0031507 heterochromatin formation 生物过程
GO:0048586 regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0141044 epigenetic programming in the endosperm 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005677 chromatin silencing complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G16845
ath:AT5G51230
dosa:Os04g0162100
dosa:Os09g0306800
osa:4335036
osa:4346674
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.877
排名 1 · TkA02G588200 · TK1151
细胞质0.196
排名 2 · TkA02G588200 · TK1151
细胞膜0.028
排名 3 · TkA02G588200 · TK1151
线粒体0.027
排名 4 · TkA02G588200 · TK1151
内质网0.014
排名 5 · TkA02G588200 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24663DUF76511-79 aa
PF23320Zn_SUZ12106-173 aa
PF13894zf-C2H2_4128-151 aa
PF13894zf-C2H2_4194-211 aa
PF09733VEFS-Box277-399 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G588200PF24663DUF76511799.8e-30104.3
TkA02G588200PF23320Zn_SUZ121061738.1e-32109.5
TkA02G588200PF13894zf-C2H2_41281512.59.7
TkA02G588200PF13894zf-C2H2_41942112.59.7
TkA02G588200PF09733VEFS-Box2773996.9e-53178.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L6Y4拟南芥sp|Q8L6Y4|EMF2_ARATH Polycomb group protein EMBRYONIC FLOWER 254.200%Swiss-Prot高置信
Q8W5B1拟南芥sp|Q8W5B1|VRN2_ARATH Polycomb group protein VERNALIZATION 249.900%Swiss-Prot中等置信
P0DKJ7拟南芥sp|P0DKJ7|FIS2L_ARATH Polycomb group protein FERTILIZATION-INDEPENDENT SEED 245.700%Swiss-Prot低置信
P0DKJ8拟南芥sp|P0DKJ8|FIS2C_ARATH Polycomb group protein FERTILIZATION-INDEPENDENT SEED 241.900%Swiss-Prot低置信
Q69KN0水稻sp|Q69KN0|EMF2B_ORYSJ Polycomb group protein EMF2B52.700%Swiss-Prot高置信
Q0JF48水稻sp|Q0JF48|EMF2A_ORYSJ Polycomb group protein EMF2A46.200%Swiss-Prot中等置信

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