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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G561980
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 145168361-145171122 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2416 bp · TkA02G561980|TK1151|cDNA

AAAAGCCTGACTACAACCTACGCAGATCACAAATGATCGCTTGTCCAGTTGGTTAATACACTGGTCTCCTTGTGGGAGGTCCAGTGTTCGAGTCTTCTGCCAAGCGTGATGTATTGGGTTTGATAACCCACATGGTGGGGTGTGGAGGTGCTGAGTACACGTTGACATGCTCGGATAAATCCTTCGCGCTCCGTTGCAACATCCGCCGTTTCCAAAAAAAAAAACAACCTACGCAGATCACTGAAAAGTGAAAACAGTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1875 bp · TkA02G561980|TK1151|CDS

ATGACCGCGTCGAGGTTATTGCCAACGATCAGGGCAACAGAACAACGCCGTCTTATCACTTATGTGGCTTTTACCGATACCGAACGCCTTATCGGCGATGCTGCTAAAAATCAAGTGGCAATGAATCCCATAAATACGGTTTTCGATGCAAAACGATTAATCGGCCGAAGGTTTACTGATGCTTCCGTCCAGAGTGATATAAAGCTATGGCCATTCAAGGTCATTCCTGGACCTGCCGAGAAACCATTGATTGTGGTAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

624 aa · TkA02G561980|TK1151|PROTEIN

MTASRLLPTIRATEQRRLITYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPINTVFDAKRLIGRRFTDASVQSDIKLWPFKVIPGPAEKPLIVVNYKGEEKQFAAEEISSMVLIKMREIAEAYLGTSVKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKSSSSGEKNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEEGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVQEFKRKNKKDITGNPRALRRLRTSCERAKRTLSST...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G561980
TK1151 IDTkA02G561980
OH-1004 IDLXL04_012423
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)94.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.795 / OH-1004 93.475
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G561980
位置Chr02:145168361-145171122 (+)
描述Similar to HSP70: Heat shock cognate 70 kDa protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g12580 与其他伴侣蛋白合作，Hsp70 是关键组分，可促进新合成蛋白的折叠，协助前体蛋白转运进入细胞器，并负责在应激条件下降解受损蛋白（可能）。
Comprehensive expression profile analysis of the Arabidopsis Hsp70 gene family.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.2.789
Heat shock protein cognate 70-4 and an E3 ubiquitin ligase, CHIP, mediate plastid-destined precursor degradation through the ubiquitin-26S proteasome system in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.071548
At5g02490 在其他分子伴侣的协作下，Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器，并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。 暂无已核实直接文献
At5g02500 与其他伴侣蛋白合作，Hsp70 是关键组分，可促进新合成蛋白的折叠，协助前体蛋白转运进入细胞器，并负责在应激条件下降解受损蛋白（可能）。
Physiological and molecular assessment of altered expression of Hsc70-1 in Arabidopsis. Evidence for pleiotropic consequences.2003 · DOI: 10.1104/pp.102.019398
Interaction between SGT1 and cytosolic/nuclear HSC70 chaperones regulates Arabidopsis immune responses.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.051896
WPP-domain proteins mimic the activity of the HSC70-1 chaperone in preventing mistargeting of RanGAP1-anchoring protein WIT1.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.143404
The cytosolic/nuclear HSC70 and HSP90 molecular chaperones are important for stomatal closure and modulate abscisic acid-dependent physiological responses in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.174425
At3g09440 在其他分子伴侣的协作下，Hsp70s 是促进新合成蛋白折叠、协助前体蛋白转运到细胞器，并在应激条件下负责损伤蛋白降解的关键成分。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_012423 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006457 protein folding 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009266 response to temperature stimulus 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0010187 negative regulation of seed germination 生物过程
GO:0010286 heat acclimation 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0042026 protein refolding 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G12580
ath:AT5G02500
sly:101247772
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.627
排名 1 · TkA02G561980 · TK1151
细胞核0.318
排名 2 · TkA02G561980 · TK1151
细胞膜0.123
排名 3 · TkA02G561980 · TK1151
内质网0.107
排名 4 · TkA02G561980 · TK1151
线粒体0.094
排名 5 · TkA02G561980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00012HSP7016-595 aa
PF06723MreB_Mbl118-357 aa
PF01968Hydantoinase_A153-194 aa
PF21523ParM_N177-212 aa
PF25601AAA_lid_14219-247 aa
PF16469NPA275-310 aa
PF02782FGGY_C293-362 aa
PF16469NPA495-521 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G561980PF00012HSP70165955.7e-239795.0
TkA02G561980PF06723MreB_Mbl1183577.9e-1451.9
TkA02G561980PF01968Hydantoinase_A1531940.07513.0
TkA02G561980PF21523ParM_N1772120.08613.6
TkA02G561980PF25601AAA_lid_142192470.4911.0
TkA02G561980PF16469NPA2753100.06414.6
TkA02G561980PF02782FGGY_C2933620.001918.8
TkA02G561980PF16469NPA4955210.06414.6
TkA02G561980PF25601AAA_lid_144955300.4911.0
TkA02G561980PF01968Hydantoinase_A5445750.07513.0
TkA02G561980PF21523ParM_N5475770.08613.6
TkA02G561980PF16469NPA5505840.06414.6
TkA02G561980PF25601AAA_lid_145555810.4911.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LHA8拟南芥sp|Q9LHA8|HS704_ARATH Heat shock 70 kDa protein 486.700%Swiss-Prot高置信
P22954拟南芥sp|P22954|HS702_ARATH Heat shock 70 kDa protein 286.700%Swiss-Prot高置信
P22953拟南芥sp|P22953|HS701_ARATH Heat shock 70 kDa protein 194.400%Swiss-Prot高置信
O65719拟南芥sp|O65719|HSP7C_ARATH Heat shock 70 kDa protein 393.200%Swiss-Prot高置信

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