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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G527510
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 136036062-136038756 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2231 bp · TkA02G527510|TK1151|cDNA

CTCGGCTCGGCTCGTTTGCACCCCTACTCCTGGTCAACTCAGCTTCCAACTCTATCGCAATTTAACCTTCTTCTCCATGTTTCCCTCTGACATTTTATTTTATTTTCTCTACATCATTCTTCTCTTTCAATTCCCAAATTGAGGCGAAAATTTTGGGTTTCTGACTTGTTCTGTTTCAATTTCTACATAATTAATCAATGGCTTTTATCATTCCTTTCTCCGTTAATTTTGAGTGGCTCATAGTCAATAATAATTTACAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1554 bp · TkA02G527510|TK1151|CDS

ATGGGAAACAAAAACGCTGCTCCTGCTCCCGCAAAAGCTGGATTTTTCGAATCAATTCTAGGGGGGCCTAAGAAGAAAACCCGGTCACGGCAGAACACTAAGAAAAGTAAGAAGAGTACCAAGGGGTCGGACATATCGGAAGTCTCTAGCGGCGGATCTCATCATGGATCCATATTGCAAACGAAAACAGGGAACATGAAGGATCACTACACATTGGGTAGGGAATTAGGGCAAGGCCAATTTGGGACGACGTTTCTATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

517 aa · TkA02G527510|TK1151|PROTEIN

MGNKNAAPAPAKAGFFESILGGPKKKTRSRQNTKKSKKSTKGSDISEVSSGGSHHGSILQTKTGNMKDHYTLGRELGQGQFGTTFLCMEKGTGKEFACKSIAKRKLVMEEEIEDVRREIQIMHHMAGHPNVISIVGAYEDAVAVYVIMELCEGGELFDRIIERGHYTEKKAADLSRVIVGVVDACHSLGVIHRDLKPENFLFFSEDEDSLLKSIDFGLSVFFKPGEMFYDTVGSAYYMAPEVLRKKYDEKCDVWSAGVII...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G527510
TK1151 IDTkA02G527510
OH-1004 IDLXL04_032800
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)76.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 89.168 / OH-1004 78.803
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G527510
位置Chr02:136036062-136038756 (+)
描述Similar to CPK20: Calcium-dependent protein kinase 20
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g38910 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g04870 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
A calcium-dependent protein kinase can inhibit a calmodulin-stimulated Ca2+ pump (ACA2) located in the endoplasmic reticulum of Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1073/pnas.97.11.6224

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0789000 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0161600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os04g0584600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032800 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0043067 regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:1900055 regulation of leaf senescence 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G38910
ath:AT3G10660
ath:AT5G04870
dosa:Os03g0788500
dosa:Os03g0789000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.485
排名 1 · TkA02G527510 · TK1151
细胞质0.435
排名 2 · TkA02G527510 · TK1151
细胞核0.229
排名 3 · TkA02G527510 · TK1151
高尔基体0.080
排名 4 · TkA02G527510 · TK1151
内质网0.064
排名 5 · TkA02G527510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14531Kinase-like64-119 aa
PF00069Pkinase70-328 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr71-323 aa
PF01636APH110-158 aa
PF14531Kinase-like162-316 aa
PF06293Kdo167-216 aa
PF01636APH188-220 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr351-384 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G527510PF14531Kinase-like641190.002318.0
TkA02G527510PF00069Pkinase703281.9e-75254.4
TkA02G527510PF07714PK_Tyr_Ser-Thr713236.9e-2898.4
TkA02G527510PF01636APH1101580.002618.3
TkA02G527510PF14531Kinase-like1623160.002318.0
TkA02G527510PF06293Kdo1672160.1312.4
TkA02G527510PF01636APH1882200.002618.3
TkA02G527510PF07714PK_Tyr_Ser-Thr3513846.9e-2898.4
TkA02G527510PF20742DUF5580_M3574360.0002621.7
TkA02G527510PF13833EF-hand_83583981.9e-1866.6
TkA02G527510PF25825SAPC2_N3684450.002218.5
TkA02G527510PF12763EH3694412.4e-0834.5
TkA02G527510PF21008AIF-13694383.8e-0834.4
TkA02G527510PF10591SPARC_Ca_bdg3694340.0005221.0
TkA02G527510PF25578EF-hand_STIM13693980.01316.3
TkA02G527510PF23564EF-hand_FSTL13744363.9e-0524.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZV15拟南芥sp|Q9ZV15|CDPKK_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2074.200%Swiss-Prot高置信
Q06850拟南芥sp|Q06850|CDPK1_ARATH Calcium-dependent protein kinase 166.300%Swiss-Prot高置信
Q852N6水稻sp|Q852N6|CDPKB_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1171.600%Swiss-Prot高置信
Q7XIM0水稻sp|Q7XIM0|CDPKH_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1770.000%Swiss-Prot高置信
Q9FXQ3水稻sp|Q9FXQ3|CDPKD_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1364.300%Swiss-Prot高置信

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