基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA02G513510
当前版本: TK1151
染色体: Chr02
坐标: 131848620-131851450
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA798 bp · TkA02G513510|TK1151|cDNA
ACACAGGGGAATTTTACTGGAATTCAGGCGGAAAACCCTATCGCTGTGACTGTGACCAAGGAAGCCGGCGGCTCAACCGTTGCTCCTGCTCACGTCAGTCGTCGGCGCAAGCCCTTGATGAAGAAGGGTAAGGGTGTGCATAAGAAGAAACGGATTTCCGATAGTGATGATGCGTTTGTTCCTCCTCCTCTCCCTCCAAATATTATGGAGCAACAGGGGAGGCTGGCGTTTCTCTTCTCCAAGAAGCTGCACAAAAGTGA...
CDS
下载 CDS FASTA798 bp · TkA02G513510|TK1151|CDS
ACACAGGGGAATTTTACTGGAATTCAGGCGGAAAACCCTATCGCTGTGACTGTGACCAAGGAAGCCGGCGGCTCAACCGTTGCTCCTGCTCACGTCAGTCGTCGGCGCAAGCCCTTGATGAAGAAGGGTAAGGGTGTGCATAAGAAGAAACGGATTTCCGATAGTGATGATGCGTTTGTTCCTCCTCCTCTCCCTCCAAATATTATGGAGCAACAGGGGAGGCTGGCGTTTCTCTTCTCCAAGAAGCTGCACAAAAGTGA...
266 aa · TkA02G513510|TK1151|PROTEIN
TQGNFTGIQAENPIAVTVTKEAGGSTVAPAHVSRRRKPLMKKGKGVHKKKRISDSDDAFVPPPLPPNIMEQQGRLAFLFSKKLHKSDVSNIGRIVLPKKPTEARLPVLLENDCIILPMKDIESGDAWSFKFRYWLNNRSRMYVLEGTGSFTKKHRLEAGDYMLLYQDLVNHNYVIRGVRASEYEEYEKQVRENKAREKDDDLMNQSLVGGFNDFDLFNLADQAPSMEDLSLMNDNSYFSDILNSFSSWDEFMTNNYPPIQ...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA02G513510 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G513510 |
| OH-1004 ID | LXL04_023711 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 47.600 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 73.308 / OH-1004 57.542覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA02G513510 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:131848620-131851450 (+) | |||||||||
| 描述 | Similar to FUS3: B3 domain-containing transcription factor FUS3 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation 生物过程 GO:0009657 plastid organization 生物过程 GO:0009733 response to auxin 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0009908 flower development 生物过程 GO:0010116 positive regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程 GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G24650 ath:AT3G26790 dosa:Os01g0713600 dosa:Os01g0911700 zma:542523 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.970
细胞质0.105
细胞膜0.025
内质网0.017
质体0.009
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF02362B379-176 aaPF07883Cupin_2142-177 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA02G513510 | PF02362 | B3 | 79 | 176 | 1e-11 | 45.4 |
| TkA02G513510 | PF07883 | Cupin_2 | 142 | 177 | 0.26 | 11.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LW31 | 拟南芥 | sp|Q9LW31|FUS3_ARATH B3 domain-containing transcription factor FUS3 | 50.000% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q01593 | 拟南芥 | sp|Q01593|ABI3_ARATH B3 domain-containing transcription factor ABI3 | 49.100% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q6Z1Z3 | 水稻 | sp|Q6Z1Z3|IDEF1_ORYSJ B3 domain-containing protein IDEF1 | 50.000% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q7XKC5 | 水稻 | sp|Q7XKC5|IDEFH_ORYSJ B3 domain-containing protein Os04g0676600 | 46.600% | Swiss-Prot | 低置信 |