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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G508480
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 130515163-130518062 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2117 bp · TkA02G508480|TK1151|cDNA

CTAAAACTTGTCCCCCAAGAAGTTTATCAAAACCACCAAAAGTTGTCCTTTTAACGTGTCTCTGGGTTTTTCTTCACGTTGGAATATCGTCTTACCTGTTCTTCATAATCAATTGACATAGCCTATACATCATCAAATTCGGATACTGGTCCAATCACTTTCAATATCTGGAGTTCGTTTCAGACCCAAAACCTCTACAGTCGATTGACCCCCGTCGTCTCCTTCCCCTCGTCCCGGTCTGTTCGTCTTACCATCGATGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1557 bp · TkA02G508480|TK1151|CDS

ATGGCAGGACTTGAAGAATTGAAAAAGAAACTCGTACCACTATTCGATGCAGAAAAGGGCTTTTCTTCAGGATCAACCATGGATCCCTCTGATTCGTACATGCTATCAGATGGCGGGACTGTCAACCTACTCAGCCGATCTTACGGAGTATACAACATCAACGAACTCGGATTACAAAAATGCACATCGAGACTCTCAAACGACGTAGACGAAAGAGAAAGGACTTACAGATGCGCTTCACACGAAATGAGAATATTTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

518 aa · TkA02G508480|TK1151|PROTEIN

MAGLEELKKKLVPLFDAEKGFSSGSTMDPSDSYMLSDGGTVNLLSRSYGVYNINELGLQKCTSRLSNDVDERERTYRCASHEMRIFGAIGSGASSVVQRAIHIPTHRIIALKKINIFEKEKRQQLLTEIRTLCEAPCYQGLVEFYGAFYTPDSGQISIALEYMDGGSLADVIKRQRCIPEAVLSLMVQKLLQGLSYLHGVRYLVHRDIKPANLLVNLKGEPKITDFGISAGLENSMAMCATFVGTVTYMSPERIRNESYS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G508480
TK1151 IDTkA02G508480
OH-1004 IDLXL04_002378
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)48.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 52.317 / OH-1004 77.684
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G508480
位置Chr02:130515163-130518062 (+)
描述Similar to MKK2: Mitogen-activated protein kinase kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g40440 MKK3-MPK6模块通过负调控MYC2/JIN1表达在茉莉酸信号转导通路中发挥重要作用。
The mitogen-activated protein kinase cascade MKK3-MPK6 is an important part of the jasmonate signal transduction pathway in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.046581
The Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinase MKK3 is upstream of group C mitogen-activated protein kinases and participates in pathogen signaling.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.050039
Calmodulin-dependent activation of MAP kinase for ROS homeostasis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1016/j.molcel.2011.02.029
Identification and characterization of an ABA-activated MAP kinase cascade in Arabidopsis thaliana.2015 · DOI: 10.1111/tpj.12808
The Arabidopsis Mitogen-Activated Protein Kinase Kinase Kinase 20 (MKKK20) Acts Upstream of MKK3 and MPK18 in Two Separate Signaling Pathways Involved in Root Microtubule Functions.2017 · DOI: 10.3389/fpls.2017.01352
At5g56580 ANPs-MKK6-MPK4 模块参与减数分裂和有丝分裂过程中植物胞质分裂的调节。
NQK1/NtMEK1 is a MAPKK that acts in the NPK1 MAPKKK-mediated MAPK cascade and is required for plant cytokinesis.2003 · DOI: 10.1101/gad.1071103
The Arabidopsis thaliana MEK AtMKK6 activates the MAP kinase AtMPK13.2004 · DOI: 10.1016/j.febslet.2004.08.051
HINKEL kinesin, ANP MAPKKKs and MKK6/ANQ MAPKK, which phosphorylates and activates MPK4 MAPK, constitute a pathway that is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq135
The MAP kinase MPK4 is required for cytokinesis in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.077164
AtMPK4 is required for male-specific meiotic cytokinesis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04642.x
AtMKK6 and AtMPK13 are required for lateral root formation in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.4161/psb.6.10.17089

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0510100 丝裂原活化蛋白激酶激酶1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002378 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009612 response to mechanical stimulus 生物过程
GO:0009631 cold acclimation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009875 pollen-pistil interaction 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G26070
ath:AT4G29810
dosa:Os01g0510100
nta:107818847
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.653
排名 1 · TkA02G508480 · TK1151
细胞核0.411
排名 2 · TkA02G508480 · TK1151
细胞膜0.086
排名 3 · TkA02G508480 · TK1151
线粒体0.066
排名 4 · TkA02G508480 · TK1151
高尔基体0.058
排名 5 · TkA02G508480 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase87-339 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr88-335 aa
PF11116DUF2624108-134 aa
PF03109ABC1158-235 aa
PF14531Kinase-like201-284 aa
PF02136NTF2369-459 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G508480PF00069Pkinase873391.5e-60205.6
TkA02G508480PF07714PK_Tyr_Ser-Thr883351.3e-34120.4
TkA02G508480PF11116DUF26241081340.1813.4
TkA02G508480PF03109ABC11582350.0001321.9
TkA02G508480PF14531Kinase-like2012840.1811.7
TkA02G508480PF02136NTF23694590.01416.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80396拟南芥sp|O80396|M2K3_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase 378.500%Swiss-Prot高置信
Q9FJV0拟南芥sp|Q9FJV0|M2K6_ARATH Mitogen-activated protein kinase kinase 642.000%Swiss-Prot中等置信
Q5QN75水稻sp|Q5QN75|M2K1_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase kinase 141.900%Swiss-Prot中等置信

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