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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_002378
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 47522277-47525063 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1065 bp · LXL04_002378|LXL04_002378|OH1004|cDNA

ATGAATAAGGGAAATTTGGCCCCTTTTCTTAAGTTAAATCTCCCTCCACCTGATGAAACTTCTCTTGCTAAATTCTTGACTGAATCTGGGACGTTTATGGATGGTGATCTGCTAGTGAACAGGGATGGTGTTCGAATTGTTTCTCAAAGCCAATCGGAGACTCCACCTCTAATTCAGCCCTCAGACAACCAATTAAGCTTAGCCGATTTTGATGCGGTTAAAGTCGTTGGAAAGGGTAATGGTGGAATCGTTCGATTGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1065 bp · LXL04_002378|LXL04_002378|OH1004|CDS

ATGAATAAGGGAAATTTGGCCCCTTTTCTTAAGTTAAATCTCCCTCCACCTGATGAAACTTCTCTTGCTAAATTCTTGACTGAATCTGGGACGTTTATGGATGGTGATCTGCTAGTGAACAGGGATGGTGTTCGAATTGTTTCTCAAAGCCAATCGGAGACTCCACCTCTAATTCAGCCCTCAGACAACCAATTAAGCTTAGCCGATTTTGATGCGGTTAAAGTCGTTGGAAAGGGTAATGGTGGAATCGTTCGATTGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

354 aa · LXL04_002378|LXL04_002378|OH1004|PROTEIN

MNKGNLAPFLKLNLPPPDETSLAKFLTESGTFMDGDLLVNRDGVRIVSQSQSETPPLIQPSDNQLSLADFDAVKVVGKGNGGIVRLVRHKWTEQFFALKVIQMNVEESARKQIAQELKINQSSQCPNVVVCYQSFYDNGAVSIILEYMDGGSLADFLKTVRSIPEPYLAAISKQVLRGLWYLHHEKHIIHRDLKPSNLLINHQGDVKITDFGVSAILASTSGLANTFVGTYNYMSPERIIGGSYGYKSDIWSLGLVLLEC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_002378
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_002378
位置Chr01:47522277-47525063 (+)
描述Similar to MKK2: Mitogen-activated protein kinase kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g29810 MEKK1、MKK1/MKK2 和 MPK4 在信号通路中发挥作用，调节响应生物和非生物胁迫的基因表达，并通过负向调节先天免疫在病原体防御中发挥重要作用。
The MKK2 pathway mediates cold and salt stress signaling in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1016/j.molcel.2004.06.023
The MAP kinase kinase MKK2 affects disease resistance in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1094/mpmi-20-5-0589
Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinases MKK1 and MKK2 have overlapping functions in defense signaling mediated by MEKK1, MPK4, and MKS1.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.120006
At4g26070 MEKK1、MKK1/MKK2 和 MPK4/MPK6 在信号通路中发挥作用，调节响应生物和非生物胁迫的基因表达，并通过负向调节先天免疫在病原体防御中发挥重要作用。
ATMPK4, an Arabidopsis homolog of mitogen-activated protein kinase, is activated in vitro by AtMEK1 through threonine phosphorylation.2000 · DOI: 10.1104/pp.122.4.1301
The Arabidopsis MAP kinase kinase MKK1 participates in defence responses to the bacterial elicitor flagellin.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02888.x
AtMEK1 mediates stress-induced gene expression of CAT1 catalase by triggering H2O2 production in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1093/jxb/erm144
AtMKK1 mediates ABA-induced CAT1 expression and H2O2 production via AtMPK6-coupled signaling in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03433.x
Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinases MKK1 and MKK2 have overlapping functions in defense signaling mediated by MEKK1, MPK4, and MKS1.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.120006
AtMKK1 and AtMPK6 are involved in abscisic acid and sugar signaling in Arabidopsis seed germination.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9503-0

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0510100 丝裂原活化蛋白激酶激酶1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002378 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009612 response to mechanical stimulus 生物过程
GO:0009631 cold acclimation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009875 pollen-pistil interaction 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G26070
ath:AT4G29810
dosa:Os01g0510100
nta:107818847
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.683
排名 1 · LXL04_002378 · OH-1004
细胞核0.531
排名 2 · LXL04_002378 · OH-1004
细胞膜0.065
排名 3 · LXL04_002378 · OH-1004
线粒体0.051
排名 4 · LXL04_002378 · OH-1004
内质网0.044
排名 5 · LXL04_002378 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase72-330 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr73-326 aa
PF03109.23ABC1141-217 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_002378PF00069.32Pkinase723306.3e-70236.3
LXL04_002378PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr733261.8e-39136.3
LXL04_002378PF03109.23ABC11412173.6e-0627.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9S7U9拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase 268.362%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q94A06拟南芥Mitogen-activated protein kinase kinase 164.789%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q5QN75水稻Mitogen-activated protein kinase kinase 159.760%Swiss-Prot强数据库同源证据

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