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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G482880
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 123211832-123212416 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

552 bp · TkA02G482880|TK1151|cDNA

ATGTTGTCTTCTGTCTTTCCCGCCGCCGGCGACCGTATTCCGTCCGACGACTTTCTTGGAACCGGGTTCACCCCCTGGGACACTGACACGCAAGAAAGCCCCTTCGTATACCCATCTCAAGAACCGGTATTTTCGTTTTCCGGTTCCGACGACTCCACACCGAAAACCAATAGCTCCAACTCCGGCTCCGACGAGGGAGACGTTGATGAACGTAAGCGGAGACGCATGATATCAAACCGGGAGTCGGCACGGCGATCCCG...

CDS

下载 CDS FASTA

552 bp · TkA02G482880|TK1151|CDS

ATGTTGTCTTCTGTCTTTCCCGCCGCCGGCGACCGTATTCCGTCCGACGACTTTCTTGGAACCGGGTTCACCCCCTGGGACACTGACACGCAAGAAAGCCCCTTCGTATACCCATCTCAAGAACCGGTATTTTCGTTTTCCGGTTCCGACGACTCCACACCGAAAACCAATAGCTCCAACTCCGGCTCCGACGAGGGAGACGTTGATGAACGTAAGCGGAGACGCATGATATCAAACCGGGAGTCGGCACGGCGATCCCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

183 aa · TkA02G482880|TK1151|PROTEIN

MLSSVFPAAGDRIPSDDFLGTGFTPWDTDTQESPFVYPSQEPVFSFSGSDDSTPKTNSSNSGSDEGDVDERKRRRMISNRESARRSRMRKQKHLENLRNQVNRHKTANRELMNQLRFVSHHGQVLQQENERLRSESAMLRQKLWDMRQVLLVRQLQNQLLSSAWPCNNNMTSINEQNPPSLIT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G482880
TK1151 IDTkA02G482880
OH-1004 IDLXL04_013636
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)94.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G482880
位置Chr02:123211832-123212416 (-)
描述Similar to BZIP43: Basic leucine zipper 43
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g59530 可能参与体细胞胚胎发生的转录因子。
Stress-related function of bHLH109 in somatic embryo induction in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1016/j.jplph.2016.02.012
At5g38800 可能参与体细胞胚胎发生的转录因子。
Stress-related function of bHLH109 in somatic embryo induction in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1016/j.jplph.2016.02.012
At1g75390 与 MAN7 启动子的 DNA G-box 基序 5'- CACGTG-3' 结合的转录因子。
Arabidopsis thaliana bZIP44: a transcription factor affecting seed germination and expression of the mannanase-encoding gene AtMAN7.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12162
At3g62420 可能结合靶基因启动子中的特定序列并激活转录。
A novel subgroup of bZIP proteins functions as transcriptional activators in hypoosmolarity-responsive expression of the ProDH gene in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1093/pcp/pch036
Combinatorial control of Arabidopsis proline dehydrogenase transcription by specific heterodimerisation of bZIP transcription factors.2006 · DOI: 10.1038/sj.emboj.7601206
A pivotal role of the basic leucine zipper transcription factor bZIP53 in the regulation of Arabidopsis seed maturation gene expression based on heterodimerization and protein complex formation.2009 · DOI: 10.1105/tpc.108.062968
Heterodimers of the Arabidopsis transcription factors bZIP1 and bZIP53 reprogram amino acid metabolism during low energy stress.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.075390
A novel method to identify the DNA motifs recognized by a defined transcription factor.2014 · DOI: 10.1007/s11103-014-0234-5
At2g18160 转录因子，可结合靶基因启动子中的特定DNA序列。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_013636 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006971 hypotonic response 生物过程
GO:0009267 cellular response to starvation 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0017148 negative regulation of translation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0080149 sucrose induced translational repression 生物过程
GO:2000693 positive regulation of seed maturation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G75390
ath:AT2G18160
ath:AT3G62420
ath:AT4G34590
ath:AT5G38800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.979
排名 1 · TkA02G482880 · TK1151
细胞质0.086
排名 2 · TkA02G482880 · TK1151
细胞膜0.020
排名 3 · TkA02G482880 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA02G482880 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA02G482880 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF31042DUF878237-121 aa
PF09726Macoilin48-148 aa
PF24126DUF739467-99 aa
PF07716bZIP_269-115 aa
PF13863DUF420070-127 aa
PF00170bZIP_171-129 aa
PF03131bZIP_Maf71-132 aa
PF30842LEKR175-150 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G482880PF31042DUF8782371210.1712.6
TkA02G482880PF09726Macoilin481480.02513.9
TkA02G482880PF24126DUF739467999.67.3
TkA02G482880PF07716bZIP_2691150.0001322.6
TkA02G482880PF13863DUF4200701270.02515.6
TkA02G482880PF00170bZIP_1711291.8e-0731.9
TkA02G482880PF03131bZIP_Maf711320.01816.2
TkA02G482880PF30842LEKR1751501.010.4
TkA02G482880PF06785UPF0242791620.2911.9
TkA02G482880PF06156YabA961430.8610.9
TkA02G482880PF00170bZIP_11231461.8e-0731.9
TkA02G482880PF24126DUF73941241489.67.3
TkA02G482880PF07716bZIP_21251410.0001322.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LQ65拟南芥sp|Q9LQ65|BZIP4_ARATH Basic leucine zipper 447.100%Swiss-Prot低置信
Q9FMC2拟南芥sp|Q9FMC2|BZP43_ARATH Basic leucine zipper 4338.500%Swiss-Prot中等置信
C0Z2L5拟南芥sp|C0Z2L5|BZP44_ARATH bZIP transcription factor 4440.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LZP8拟南芥sp|Q9LZP8|BZP53_ARATH bZIP transcription factor 5343.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SI15拟南芥sp|Q9SI15|BZIP2_ARATH bZIP transcription factor 241.300%Swiss-Prot低置信

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