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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G474830
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 121205063-121206803 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1126 bp · TkA02G474830|TK1151|cDNA

CCCTTTCTAATCCTCGAAAAAGAAACATGTCTAGCATCCTTATGGAGACTAAAATCCTACGACTCCCTAAAACTCCACCTACCCAAAAAATATTGCCAACTCCCTCACTACCCCTTCCCCAACAATTTCCCAAAATACCCCTCGAAACAACAGTTCATTACCTACCTCGATTCCTACGCGAAACATTTCTCTATCCGTCCGATGTTTGGGTACGAGGTTAAGAGCGCGGAGTATGATGTTGATAGTTGTCTGTGGAGGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1098 bp · TkA02G474830|TK1151|CDS

CCCTTTCTAATCCTCGAAAAAGAAACATGTCTAGCATCCTTATGGAGACTAAAATCCTACGACTCCCTAAAACTCCACCTACCCAAAAAATATTGCCAACTCCCTCACTACCCCTTCCCCAACAATTTCCCAAAATACCCCTCGAAACAACAGTTCATTACCTACCTCGATTCCTACGCGAAACATTTCTCTATCCGTCCGATGTTTGGGTACGAGGTTAAGAGCGCGGAGTATGATGTTGATAGTTGTCTGTGGAGGGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

365 aa · TkA02G474830|TK1151|PROTEIN

PFLILEKETCLASLWRLKSYDSLKLHLPKKYCQLPHYPFPNNFPKYPSKQQFITYLDSYAKHFSIRPMFGYEVKSAEYDVDSCLWRVVGNGTEFVSRWLVVATGDNADPVVPEFDGFEKFGGKVMHSFEYKNGGEFREKKVLVVGCGNSGMEIGLNLCCNGARVSLVVRHKLHILPRDILGRSSFAVAVGLLKLFPLRFVDWVLTVYSRLALGDTSRVGIVRPKDGPLKIKGKTGKTPVLDVGVLSKIKSGQIKVVGEIR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G474830
TK1151 IDTkA02G474830
OH-1004 IDLXL04_025866
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)54.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.904 / OH-1004 85.480
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G474830
位置Chr02:121205063-121206803 (-)
描述Similar to YUC6: Indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA6
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g33230 参与生长素生物合成。
Activation of a flavin monooxygenase gene YUCCA7 enhances drought resistance in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1007/s00425-011-1552-3
At4g13260 参与生长素生物合成。
Auxin biosynthesis by the YUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floral organs and vascular tissues in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1101/gad.1415106
At1g04610 参与生长素生物合成。 暂无已核实直接文献
At5g25620 通过吲哚-3-丙酮酸 途径参与生长素生物合成。
Auxin biosynthesis by the YUCCA flavin monooxygenases controls the formation of floral organs and vascular tissues in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1101/gad.1415106
yucca6, a dominant mutation in Arabidopsis, affects auxin accumulation and auxin-related phenotypes.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.104935
Overexpression of Arabidopsis YUCCA6 in potato results in high-auxin developmental phenotypes and enhanced resistance to water deficit.2013 · DOI: 10.1093/mp/sss100
The biochemical mechanism of auxin biosynthesis by an arabidopsis YUCCA flavin-containing monooxygenase.2013 · DOI: 10.1074/jbc.m112.424077
At1g04180 参与生长素生物合成。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025866 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009635 response to herbicide 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009819 drought recovery 生物过程
GO:0009851 auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0010038 response to metal ion 生物过程
GO:0010262 somatic embryogenesis 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G04180
ath:AT1G04610
ath:AT4G13260
ath:AT5G11320
ath:AT5G25620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.269
排名 1 · TkA02G474830 · TK1151
过氧化物酶体0.239
排名 2 · TkA02G474830 · TK1151
线粒体0.164
排名 3 · TkA02G474830 · TK1151
内质网0.158
排名 4 · TkA02G474830 · TK1151
细胞核0.115
排名 5 · TkA02G474830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00743FMO-like20-289 aa
PF13434Lys_Orn_oxgnase37-166 aa
PF13738Pyr_redox_344-171 aa
PF07992Pyr_redox_287-169 aa
PF02789Peptidase_M17_N119-150 aa
PF13241NAD_binding_7136-170 aa
PF00070Pyr_redox140-171 aa
PF01134GIDA140-171 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G474830PF00743FMO-like202891.4e-2590.5
TkA02G474830PF13434Lys_Orn_oxgnase371662e-1350.9
TkA02G474830PF13738Pyr_redox_3441718.2e-2175.3
TkA02G474830PF07992Pyr_redox_2871691.4e-0938.6
TkA02G474830PF02789Peptidase_M17_N1191502.28.9
TkA02G474830PF13241NAD_binding_71361700.1913.0
TkA02G474830PF00070Pyr_redox1401710.008517.3
TkA02G474830PF01134GIDA1401710.05113.4
TkA02G474830PF01494FAD_binding_31401710.2511.2
TkA02G474830PF02558ApbA1411740.2411.7
TkA02G474830PF02789Peptidase_M17_N2292572.28.9
TkA02G474830PF13738Pyr_redox_32482968.2e-2175.3
TkA02G474830PF07992Pyr_redox_22602911.4e-0938.6
TkA02G474830PF01134GIDA2673490.05113.4
TkA02G474830PF13241NAD_binding_72682850.1913.0
TkA02G474830PF13434Lys_Orn_oxgnase2712872e-1350.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O49312拟南芥sp|O49312|YUC7_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA752.700%Swiss-Prot高置信
Q9SVQ1拟南芥sp|Q9SVQ1|YUC2_ARATH Indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA254.800%Swiss-Prot高置信
O23024拟南芥sp|O23024|YUC3_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA352.200%Swiss-Prot高置信
Q8VZ59拟南芥sp|Q8VZ59|YUC6_ARATH Indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA653.800%Swiss-Prot高置信
O64489拟南芥sp|O64489|YUC9_ARATH Probable indole-3-pyruvate monooxygenase YUCCA950.100%Swiss-Prot高置信

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