基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA02G377030
当前版本: TK1151
染色体: Chr02
坐标: 95901379-95908411
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA768 bp · TkA02G377030|TK1151|cDNA
TCTCTCTCCTCCGAATTTCTCTCTTCTTTCACATTTCGGTTTTCACCAAAATTTTCAGATCTGATAGCCTTGATCGTGATTTGAAAGAATTCATCAATGGCGGATGTGTCACCCCTGGCCAAATACAAGTTGGTATTTTTGGGCGATCAATCCGTCGGCAAAACCAGCATCATTACCAGATTCATGTATGATAAATTCGACGCCACCTATCAGGCTACAGTTGGCATTGATTTTATGTCTAAAGCAGTGTACCTTAAAGA...
CDS
下载 CDS FASTA480 bp · TkA02G377030|TK1151|CDS
ATGGCGGATGTGTCACCCCTGGCCAAATACAAGTTGGTATTTTTGGGCGATCAATCCGTCGGCAAAACCAGCATCATTACCAGATTCATGTATGATAAATTCGACGCCACCTATCAGGCTACAGTTGGCATTGATTTTATGTCTAAAGCAGTGTACCTTAAAGATAGAACATTTCGGTTACATATTTGGGATACTGCTGGGCACGAGAGATTTAGGAGTCTGATTCCAAGTTATATCAAAGATTCATTGGTTGCTGTTAT...
159 aa · TkA02G377030|TK1151|PROTEIN
MADVSPLAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDATYQATVGIDFMSKAVYLKDRTFRLHIWDTAGHERFRSLIPSYIKDSLVAVIVYDVANRQSFLNTSKWIEEVRTQLGTKVIIFLVGNKTDLVDKRQVSTEEGENKARELGSCLLLKPVQNLEIY
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA02G377030 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G377030 |
| OH-1004 ID | LXL04_014142 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 94.200 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 91.195 / OH-1004 91.124覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA02G377030 |
|---|---|
| 位置 | Chr02:95901379-95908411 (-) |
| 描述 | Similar to RABH1E: Ras-related protein RABH1e |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0001558 regulation of cell growth 生物过程 GO:0001881 receptor recycling 生物过程 GO:0006886 intracellular protein transport 生物过程 GO:0006887 exocytosis 生物过程 GO:0006890 retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum 生物过程 GO:0006891 intra-Golgi vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0007602 phototransduction 生物过程 GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程 GO:0032482 Rab protein signal transduction 生物过程 GO:0042147 retrograde transport, endosome to Golgi 生物过程 GO:0052324 plant-type cell wall cellulose biosynthetic process 生物过程 GO:0060078 regulation of postsynaptic membrane potential 生物过程 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G22290 ath:AT2G44610 ath:AT4G39890 ath:AT5G10260 dme:Dmel_CG6601 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.675
细胞核0.244
高尔基体0.158
溶酶体／液泡0.106
内质网0.090
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03193RsgA_GTPase7-30 aaPF00025Arf9-132 aaPF00071Ras11-145 aaPF08477Roc11-125 aaPF09439SRPRB11-130 aaPF04670Gtr1_RagA11-133 aaPF01926MMR_HSR112-117 aaPF00009GTP_EFTU42-133 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA02G377030 | PF03193 | RsgA_GTPase | 7 | 30 | 0.11 | 13.0 |
| TkA02G377030 | PF00025 | Arf | 9 | 132 | 7.2e-13 | 49.1 |
| TkA02G377030 | PF00071 | Ras | 11 | 145 | 2e-47 | 161.5 |
| TkA02G377030 | PF08477 | Roc | 11 | 125 | 1.9e-35 | 122.4 |
| TkA02G377030 | PF09439 | SRPRB | 11 | 130 | 2.3e-05 | 24.5 |
| TkA02G377030 | PF04670 | Gtr1_RagA | 11 | 133 | 0.00051 | 20.2 |
| TkA02G377030 | PF01926 | MMR_HSR1 | 12 | 117 | 0.00014 | 22.6 |
| TkA02G377030 | PF00009 | GTP_EFTU | 42 | 133 | 7.2e-06 | 26.4 |
| TkA02G377030 | PF19331 | MCCA_BT | 47 | 73 | 0.019 | 15.2 |
| TkA02G377030 | PF03193 | RsgA_GTPase | 113 | 147 | 0.11 | 13.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LFT9 | 拟南芥 | sp|Q9LFT9|RAH1E_ARATH Ras-related protein RABH1e | 84.100% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9SID8 | 拟南芥 | sp|Q9SID8|RAH1D_ARATH Ras-related protein RABH1d | 80.700% | Swiss-Prot | 高置信 |
O80501 | 拟南芥 | sp|O80501|RAH1B_ARATH Ras-related protein RABH1b | 81.900% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9SMR4 | 拟南芥 | sp|Q9SMR4|RAH1C_ARATH Ras-related protein RABH1c | 76.000% | Swiss-Prot | 高置信 |