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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G358820
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 91148408-91151623 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2787 bp · TkA02G358820|TK1151|cDNA

AAAATGTATAAAAAAACCCTCCATTGTAGATAACAGGGTGATTATAAGAACACGTAGATGCAATCCAATCCAACACTCAAAAACATATGGCTTTGGTTGATGCATGAAACCTCCATTTCCTTCACATAAAAATCAAACCCATTTCCCTCAAATTCAATCGCTTTTCACACGATTTGCCAATATATACACTTGATTGATCGATTTCAAGAAACCTCGACCAAAAAAAAGCTCAATTCATCAATGGCTTCCGCCACAAATAC...

CDS

下载 CDS FASTA

2124 bp · TkA02G358820|TK1151|CDS

ATGGCTTCCGCCACAAATACCGTTCTTTCTTCCAATTTCCTTGGTTCAACTGTCTTGCTCTCAACCCCAACGCCCAAAACCCATAAATCGTTAAGGAATAGATTTGTAATCCCACAATCAGTTCTTAGCAAAAAACCCAATTCTTCAAAAGATTTCAATTTTCAATCGAAAGCCACTTTAGCTGCTCTACTATTCTCTTCAATCACAGCACCACAAGCCCTAGCGGACACCAATTCACCACCACCACCACCACAAACCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

707 aa · TkA02G358820|TK1151|PROTEIN

MASATNTVLSSNFLGSTVLLSTPTPKTHKSLRNRFVIPQSVLSKKPNSSKDFNFQSKATLAALLFSSITAPQALADTNSPPPPPQTPLQAELVKQNPSTNSLPFSQSNVLTAPKPQANSDLPEGSQWRYSEFLNAVKKGKVERVRFNKDGGVLQLTAVDGRRASVVVPNDPDLIDILAMNGVDISVSEGEASNGLLGFIGNLLFPILAFGGLFFLFRRSQGGGGGPGGLGGPMDFGRSKSKFQEVPETGVSFADVAGADQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G358820
TK1151 IDTkA02G358820
OH-1004 IDLXL04_015176
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G358820
位置Chr02:91148408-91151623 (+)
描述Similar to FTSH: ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g50250 复合物的一部分，具有 ATP 依赖性锌金属肽酶的功能。 暂无已核实直接文献
At5g42270 复合物的一部分，具有 ATP 依赖性锌金属肽酶的功能。
The VAR1 locus of Arabidopsis encodes a chloroplastic FtsH and is responsible for leaf variegation in the mutant alleles.2002 · DOI: 10.1046/j.1365-2443.2002.00558.x
Coordinated regulation and complex formation of yellow variegated1 and yellow variegated2, chloroplastic FtsH metalloproteases involved in the repair cycle of photosystem II in Arabidopsis thylakoid membranes.2003 · DOI: 10.1105/tpc.017319

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0725900 可能的 ATP 依赖性锌金属肽酶。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015176 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0010205 photoinhibition 生物过程
GO:0010206 photosystem II repair 生物过程
GO:0010304 PSII associated light-harvesting complex II catabolic process 生物过程
GO:0019684 photosynthesis, light reaction 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0048564 photosystem I assembly 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009534 chloroplast thylakoid 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G50250
ath:AT5G42270
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.966
排名 1 · TkA02G358820 · TK1151
线粒体0.048
排名 2 · TkA02G358820 · TK1151
细胞核0.019
排名 3 · TkA02G358820 · TK1151
细胞质0.018
排名 4 · TkA02G358820 · TK1151
细胞膜0.011
排名 5 · TkA02G358820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05729NACHT52-77 aa
PF06480FtsH_ext124-187 aa
PF06480FtsH_ext203-220 aa
PF13191AAA_16286-340 aa
PF12775AAA_7286-306 aa
PF06068TIP49287-323 aa
PF00004AAA289-421 aa
PF07728AAA_5289-409 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G358820PF05729NACHT52770.2511.9
TkA02G358820PF06480FtsH_ext1241877.9e-0626.7
TkA02G358820PF06480FtsH_ext2032207.9e-0626.7
TkA02G358820PF13191AAA_162863400.0001722.9
TkA02G358820PF12775AAA_72863060.2711.5
TkA02G358820PF06068TIP492873230.001918.2
TkA02G358820PF00004AAA2894219.9e-46156.1
TkA02G358820PF07728AAA_52894097.2e-0523.5
TkA02G358820PF13401AAA_222893150.002818.7
TkA02G358820PF20720nSTAND32894170.002818.0
TkA02G358820PF05496RuvB_N2893190.009316.5
TkA02G358820PF13173AAA_142893570.02515.3
TkA02G358820PF01078Mg_chelatase2893070.07213.2
TkA02G358820PF05729NACHT2893080.2511.9
TkA02G358820PF07724AAA_22903580.004417.8
TkA02G358820PF13521AAA_282903240.00917.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39102拟南芥sp|Q39102|FTSH1_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 1, chloroplastic83.900%Swiss-Prot高置信
Q9FH02拟南芥sp|Q9FH02|FTSH5_ARATH ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 5, chloroplastic84.200%Swiss-Prot高置信
Q5Z974水稻sp|Q5Z974|FTSH1_ORYSJ ATP-dependent zinc metalloprotease FTSH 1, chloroplastic87.000%Swiss-Prot高置信

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