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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G356270
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 90487288-90489892 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2021 bp · TkA02G356270|TK1151|cDNA

TAAAAACCGACATAGTTTCTTAGCAACTGTAAATCTTTTCCCGGTATATACATTAATTGTCCTTGTGATAGTAATATCCATCAGCAATTAATTGTTCCTCCTCCTCCTCCGATCACCACAATCGCAAGAAGATGTCAAACATGGTGGATAACAAGCAGGAAGGCAAATCTGTAGATCTCAAAACCTCTAAAGCAACTTCTTCCTCTCCATCGGTGGTGGAAAACGTAGATCTCAGCATCAACAATTCCAGTTACCGTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1674 bp · TkA02G356270|TK1151|CDS

ATGTCAAACATGGTGGATAACAAGCAGGAAGGCAAATCTGTAGATCTCAAAACCTCTAAAGCAACTTCTTCCTCTCCATCGGTGGTGGAAAACGTAGATCTCAGCATCAACAATTCCAGTTACCGTCATCAACTCAGCCGCCGTACCATGACTTTGTCTCCCTCTTTGAGGCGTACTGAGTCCAACAGAAATGCGACTGTGAACGAGAGTGTGATTAAGGGGATGGCTACAGCCATGGACGCGGTGGTGAAGGTGTTCTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

557 aa · TkA02G356270|TK1151|PROTEIN

MSNMVDNKQEGKSVDLKTSKATSSSPSVVENVDLSINNSSYRHQLSRRTMTLSPSLRRTESNRNATVNESVIKGMATAMDAVVKVFCIHTEPNFSLPWQRNRQYSSNSTGFVISGRRVLTNAHSVDHYTQVKLKKRGSDTKYVATVLAVGMECDIALLTVDEDEFWDGVSPVEFGDLPALQDAVTVVGYPVGGDTISVTSGVVSRIEILSYGHGSELLGLQIDAAINPGNSGGPAFNAKGDCVGIAFMSLMGQDVENIGY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G356270
TK1151 IDTkA02G356270
OH-1004 IDLXL04_015206
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G356270
位置Chr02:90487288-90489892 (-)
描述Similar to DEGP9: Protease Do-like 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g40200 能降解双组分应答调节蛋白 ARR4 的丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献
At2g47940 丝氨酸蛋白酶，可对植物光系统 II 中光损伤的 D1 蛋白进行初级裂解。
A chloroplast DegP2 protease performs the primary cleavage of the photodamaged D1 protein in plant photosystem II.2001 · DOI: 10.1093/emboj/20.4.713
At5g36950 可能的丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献
At1g65630 推测丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献
At1g65640 推测丝氨酸蛋白酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015206 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0010206 photosystem II repair 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009533 chloroplast stromal thylakoid 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G65630
ath:AT1G65640
ath:AT2G47940
ath:AT5G36950
ath:AT5G40200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.586
排名 1 · TkA02G356270 · TK1151
细胞核0.325
排名 2 · TkA02G356270 · TK1151
细胞膜0.103
排名 3 · TkA02G356270 · TK1151
质体0.067
排名 4 · TkA02G356270 · TK1151
内质网0.066
排名 5 · TkA02G356270 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00089Trypsin94-271 aa
PF13365Trypsin_2109-245 aa
PF10459Peptidase_S46226-249 aa
PF13180PDZ_2303-385 aa
PF17815PDZ_3394-539 aa
PF13180PDZ_2475-496 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G356270PF00089Trypsin942711.6e-2074.6
TkA02G356270PF13365Trypsin_21092453.2e-2487.1
TkA02G356270PF10459Peptidase_S462262490.04713.0
TkA02G356270PF13180PDZ_23033852.2e-0628.6
TkA02G356270PF17815PDZ_33945391.4e-48165.0
TkA02G356270PF13180PDZ_24754962.2e-0628.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FL12拟南芥sp|Q9FL12|DEGP9_ARATH Protease Do-like 974.000%Swiss-Prot高置信
O82261拟南芥sp|O82261|DEGP2_ARATH Protease Do-like 2, chloroplastic51.500%Swiss-Prot高置信
Q9FIV6拟南芥sp|Q9FIV6|DGP10_ARATH Protease Do-like 10, mitochondrial49.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SHZ1拟南芥sp|Q9SHZ1|DEGP3_ARATH Putative protease Do-like 3, mitochondrial46.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SHZ0拟南芥sp|Q9SHZ0|DEGP4_ARATH Protease Do-like 4, mitochondrial42.200%Swiss-Prot中等置信

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