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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G350990
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 89276533-89280351 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2693 bp · TkA02G350990|TK1151|cDNA

AAATAGTCTCAATAAAATGTCGTTGACGGTAACAGACGTTTCGTAAAGGATATTGGGTCAAGAAGAAGCAACCCCAGCCTGAGAAATCGATAGAGAGACTCAAATTCTTCACAAAACAATTATTCACAAAACCCCACAAATTCTTTCGTCTGCTCAAATCAAAGATCCCTTTTTAAATAAATGGTGAATAATTTACAAGTTATTTCACTGTAATGAGAATGAGAGGACCTATAATTTCACTTTTGCGCCTTTTGGCCGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2475 bp · TkA02G350990|TK1151|CDS

ATGAGAATGAGAGGACCTATAATTTCACTTTTGCGCCTTTTGGCCGTGATTCCAGCGGCATATGGGAGTCTGCCGGTCCTCCCGCCGCCGTCAACAACTTCCGGTTCCTCTGTTCTGGATCAATTTCAGCTTCCGCCGCCGCTTCCAGCTAAGATCAACTCAACACCTAAACAGGATGCTATATTGGTGGCTGCTCCAGATGGCACATTATATCAAGTAGATATCAGTTCAGGTAAAATTCTTTGGTCTTTCCCATCTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

824 aa · TkA02G350990|TK1151|PROTEIN

MRMRGPIISLLRLLAVIPAAYGSLPVLPPPSTTSGSSVLDQFQLPPPLPAKINSTPKQDAILVAAPDGTLYQVDISSGKILWSFPSGAPIYDSQQSPNLEDDEHNSSRQKHNKFYIDCGDDWQLYIHSKDSKAEKLPFGAEELIGRTPHVSVDGVLLGSKKTTVFLVDPQTGKIVYTFKSNGGQSPENSSIILKKDADKWKEPTTLGFDHVDHDQLLYIKRFDYELTYSSSTTGNVLWYLMFADFEASQCHGSNTFLGGM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G350990
TK1151 IDTkA02G350990
OH-1004 IDLXL04_015261
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 96.479
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G350990
位置Chr02:89276533-89280351 (+)
描述Similar to IRE1B: Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1b
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g24360 Senses 通过其 N 末端结构域在内质网腔中展开蛋白质，从而导致酶自动激活。
Heat induces the splicing by IRE1 of a mRNA encoding a transcription factor involved in the unfolded protein response in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1073/pnas.1102117108
AtIRE1A/AtIRE1B and AGB1 independently control two essential unfolded protein response pathways in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04788.x
Arabidopsis IRE1 catalyses unconventional splicing of bZIP60 mRNA to produce the active transcription factor.2011 · DOI: 10.1038/srep00029
IRE1/bZIP60-mediated unfolded protein response plays distinct roles in plant immunity and abiotic stress responses.2012 · DOI: 10.1371/journal.pone.0031944
Alteration of the bZIP60/IRE1 pathway affects plant response to ER stress in Arabidopsis thaliana.2012 · DOI: 10.1371/journal.pone.0039023
Degradation of the endoplasmic reticulum by autophagy during endoplasmic reticulum stress in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1105/tpc.112.101535
At2g17520 Senses 通过其 N 末端结构域在内质网腔中展开蛋白质，从而导致酶自动激活。
Characterization of two homologs of Ire1p, a kinase/endoribonuclease in yeast, in Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1016/s0167-4781(02)00237-3
AtIRE1A/AtIRE1B and AGB1 independently control two essential unfolded protein response pathways in Arabidopsis.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04788.x
Arabidopsis IRE1 catalyses unconventional splicing of bZIP60 mRNA to produce the active transcription factor.2011 · DOI: 10.1038/srep00029
IRE1/bZIP60-mediated unfolded protein response plays distinct roles in plant immunity and abiotic stress responses.2012 · DOI: 10.1371/journal.pone.0031944
At3g11870 失活的丝氨酸／苏氨酸蛋白激酶／核糖核酸内切酶IRE1样蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0471000 参与内质网 应激反应。
Signal transduction by IRE1-mediated splicing of bZIP50 and other stress sensors in the endoplasmic reticulum stress response of rice.2012 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2011.04844.x
Conservation of IRE1-regulated bZIP74 mRNA unconventional splicing in rice (Oryza sativa L.) involved in ER stress responses.2012 · DOI: 10.1093/mp/ssr115
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015261 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000394 RNA splicing, via endonucleolytic cleavage and ligation 生物过程
GO:0002376 immune system process 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0006914 autophagy 生物过程
GO:0006986 response to unfolded protein 生物过程
GO:0008380 RNA splicing 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0030968 endoplasmic reticulum unfolded protein response 生物过程
GO:0034263 positive regulation of autophagy in response to ER overload 生物过程
GO:0034976 response to endoplasmic reticulum stress 生物过程
GO:0036498 IRE1-mediated unfolded protein response 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G17520
ath:AT3G11870
ath:AT5G24360
dosa:Os07g0471000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.543
排名 1 · TkA02G350990 · TK1151
高尔基体0.208
排名 2 · TkA02G350990 · TK1151
细胞核0.133
排名 3 · TkA02G350990 · TK1151
细胞质0.126
排名 4 · TkA02G350990 · TK1151
细胞膜0.081
排名 5 · TkA02G350990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13570Beta-prop_ACSF437-182 aa
PF13360PQQ_257-173 aa
PF25292Beta-prop_CGLA57-91 aa
PF01011PQQ58-89 aa
PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st60-99 aa
PF07774EMC1_C61-180 aa
PF22112OmcA-like_N113-194 aa
PF01011PQQ142-234 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G350990PF13570Beta-prop_ACSF4371823e-0524.3
TkA02G350990PF13360PQQ_2571730.0007320.0
TkA02G350990PF25292Beta-prop_CGLA57910.006416.7
TkA02G350990PF01011PQQ58890.02614.0
TkA02G350990PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st60990.02714.6
TkA02G350990PF07774EMC1_C611800.1112.5
TkA02G350990PF22112OmcA-like_N1131940.09513.3
TkA02G350990PF01011PQQ1422340.02614.0
TkA02G350990PF13360PQQ_21491830.0007320.0
TkA02G350990PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st1521820.02714.6
TkA02G350990PF13570Beta-prop_ACSF42122503e-0524.3
TkA02G350990PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4166821.3e-30107.3
TkA02G350990PF00069Pkinase4176871.3e-40140.2
TkA02G350990PF17667Pkinase_fungal5296195.2e-0626.2
TkA02G350990PF06293Kdo5315710.05213.7
TkA02G350990PF03109ABC15395830.3310.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93VJ2拟南芥sp|Q93VJ2|IRE1B_ARATH Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1b46.200%Swiss-Prot中等置信
Q9C5S2拟南芥sp|Q9C5S2|IRE1A_ARATH Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1a43.400%Swiss-Prot中等置信
Q9SF12拟南芥sp|Q9SF12|IRE1L_ARATH Inactive serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1-like43.300%Swiss-Prot中等置信
Q7XIT1水稻sp|Q7XIT1|IRE1_ORYSJ Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE139.200%Swiss-Prot中等置信

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