基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA02G292200
当前版本: TK1151
染色体: Chr02
坐标: 74591381-74593363
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1002 bp · TkA02G292200|TK1151|cDNA
ATGGGAGTTAAAGGTCTCTGGGATATACTAGATTCTTGCAAGAAAACCCTCCTTCTCCACCATCTGCAGAACAAGACGGTGTGCGTAGATCTATCATGTTGGATAGTTCAACTTAACAAAGTAAACCAATCACACTGTGCTCTGAAAGATAAGCTTTATCTCAAGGGTTTATTTCATCGCATCAGGGCTCTCATTGCGTTAAATTGTAGCCTCATCTTCGTCACAGATGGATCGATTCCAGGTATCAAAGTAACTACATA...
CDS
下载 CDS FASTA1002 bp · TkA02G292200|TK1151|CDS
ATGGGAGTTAAAGGTCTCTGGGATATACTAGATTCTTGCAAGAAAACCCTCCTTCTCCACCATCTGCAGAACAAGACGGTGTGCGTAGATCTATCATGTTGGATAGTTCAACTTAACAAAGTAAACCAATCACACTGTGCTCTGAAAGATAAGCTTTATCTCAAGGGTTTATTTCATCGCATCAGGGCTCTCATTGCGTTAAATTGTAGCCTCATCTTCGTCACAGATGGATCGATTCCAGGTATCAAAGTAACTACATA...
333 aa · TkA02G292200|TK1151|PROTEIN
MGVKGLWDILDSCKKTLLLHHLQNKTVCVDLSCWIVQLNKVNQSHCALKDKLYLKGLFHRIRALIALNCSLIFVTDGSIPGIKVTTYRQRLHLDNEGRDESYLNKTIPLQRNTGSEFSCMIKEAKILASALGVPCLDGIEEGEAQCALLDAESLCDGCFSLDSDIVLFGARTVYRDICLGEGGYVVCYEMDDIEKKLGLGRKSLIALAVRLGCDYAPGVPRLGANLACKIVKSFSESEVLQRIASEDLSVLKKTNRSKKQ...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA02G292200 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA02G292200 |
| OH-1004 ID | LXL04_006736 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 96.000 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 75.676 / OH-1004 81.494覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA02G292200 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:74591381-74593363 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to SEND1: Single-strand DNA endonuclease 1 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0000723 telomere maintenance 生物过程 GO:0000724 double-strand break repair via homologous recombination 生物过程 GO:0006281 DNA repair 生物过程 GO:0006289 nucleotide-excision repair 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009650 UV protection 生物过程 GO:0010213 non-photoreactive DNA repair 生物过程 GO:0010824 regulation of centrosome duplication 生物过程 GO:0031297 replication fork processing 生物过程 GO:0071139 resolution of DNA recombination intermediates 生物过程 GO:0071140 resolution of mitotic recombination intermediates 生物过程 GO:0090267 positive regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint 生物过程 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G48900 dosa:Os08g0101600 hsa:348654 mmu:209334 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.792
细胞质0.229
线粒体0.055
细胞膜0.033
内质网0.021
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00752XPG_N1-90 aaPF00867XPG_I132-214 aaPF00867XPG_I251-255 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA02G292200 | PF00752 | XPG_N | 1 | 90 | 2.4e-13 | 51.1 |
| TkA02G292200 | PF00867 | XPG_I | 132 | 214 | 6.4e-19 | 68.8 |
| TkA02G292200 | PF00867 | XPG_I | 251 | 255 | 6.4e-19 | 68.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9M2Z3 | 拟南芥 | sp|Q9M2Z3|GENL2_ARATH Single-strand DNA endonuclease 1 | 58.800% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LPD2 | 拟南芥 | sp|Q9LPD2|GENL1_ARATH Flap endonuclease GEN-like 1 | 36.300% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q9ATY5 | 拟南芥 | sp|Q9ATY5|UVH3_ARATH DNA repair protein UVH3 | 40.700% | Swiss-Prot | 低置信 |
Q8W5R1 | 水稻 | sp|Q8W5R1|GENL2_ORYSJ Single-strand DNA endonuclease 1 | 56.400% | Swiss-Prot | 高置信 |