RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G289000
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 73845671-73848919 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2872 bp · TkA02G289000|TK1151|cDNA

GTTGACTGGCGTATGCCAAAAACCCAGCAAGCTACAATGGCGTCATCATCTGCGTCACCTCAAACTTTCATCTTCATCTCATGTTCACAATCCGACAACAGTTTACAGCGAAACCTCTGCGAAATTTTCTGCTTTTTCACACCCTAGCTAGATGCTAGACTTTTGAAGCTTTCTTTGATTCATCACCTACAACAGATATTCTCGATTTTTCTCATTAATTTCGGTTTGTAATTGATTTTTCGTTCTGGATTTTTGGGTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1413 bp · TkA02G289000|TK1151|CDS

ATGAGTGAGATATTGCCATTTGGGAATGTTGGATATGATGCTTTTCTTGTGTTCTTGAGCTACTTGTATACCGGAAAAATGAAGGGGTCACCACCGGAGGTTTCAACATGCGTTCATGGTGGATGCCCTCATGATGCTTGTAGGCCCGCTATAGTGTTCGCTGTTGAATTGATGTACGCTTCTGTTATTTTTCAGGTGCCTGAGTTAGTTTCACTTTTTCAGCGACGTCTTCTTAACTTCATCGAAAAGGCATTTGTCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

470 aa · TkA02G289000|TK1151|PROTEIN

MSEILPFGNVGYDAFLVFLSYLYTGKMKGSPPEVSTCVHGGCPHDACRPAIVFAVELMYASVIFQVPELVSLFQRRLLNFIEKAFVEDVIPILLVAFHCELTHILTQCIHRVARSDLDDISLEKNLPPEAARDVKSLRTNHLPEPAQTPKSEEDPLREKRIRQIHKALDSDDVELVKLLLTESNITLDDAHALHYAVSYCDPKVVKELVDLDLADVNRRNPRGYTVLHVAAMRKEPSIMVCLLNKQVSVFETTRDGQNAV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G289000
TK1151 IDTkA02G289000
OH-1004 IDLXL04_015763
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 80.167
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G289000
位置Chr02:73845671-73848919 (+)
描述Similar to NPR1: BTB/POZ domain and ankyrin repeat-containing protein NPR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g45110 结合水杨酸（SA）的E3泛素蛋白连接酶复合体（CUL3-RBX1-BTB）底物特异性衔接蛋白，响应SA并介导NPR1泛素化及随后的蛋白酶体降解。
Negative regulation of defense responses in Arabidopsis by two NPR1 paralogs.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02903.x
NPR3 and NPR4 are receptors for the immune signal salicylic acid in plants.2012 · DOI: 10.1038/nature11162
At4g19660 结合水杨酸（SA）的E3泛素蛋白连接酶复合体（CUL3-RBX1-BTB）底物特异性衔接蛋白，在缺乏SA时介导NPR1泛素化及随后的蛋白酶体降解。
An Arabidopsis NPR1-like gene, NPR4, is required for disease resistance.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02296.x
Negative regulation of defense responses in Arabidopsis by two NPR1 paralogs.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02903.x
NPR3 and NPR4 are receptors for the immune signal salicylic acid in plants.2012 · DOI: 10.1038/nature11162
Structural basis of salicylic acid perception by Arabidopsis NPR proteins.2020 · DOI: 10.1038/s41586-020-2596-y

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0767900 水杨酸（SA）结合的底物特异性适配器，属于E3泛素蛋白连接酶复合物（CUL3-RBX1-BTB），介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解（通过相似性预测）。
Functional analysis of rice NPR1-like genes reveals that OsNPR1/NH1 is the rice orthologue conferring disease resistance with enhanced herbivore susceptibility.2007 · DOI: 10.1111/j.1467-7652.2007.00243.x
Os03g0667100 水杨酸（SA）结合的底物特异性适配器，属于E3泛素蛋白连接酶复合物（CUL3-RBX1-BTB），介导目标蛋白的泛素化及随后通过蛋白酶体降解（通过相似性预测）。
Functional analysis of rice NPR1-like genes reveals that OsNPR1/NH1 is the rice orthologue conferring disease resistance with enhanced herbivore susceptibility.2007 · DOI: 10.1111/j.1467-7652.2007.00243.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015763 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010112 regulation of systemic acquired resistance 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G19660
ath:AT5G45110
dosa:Os01g0767900
dosa:Os03g0667100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.483
排名 1 · TkA02G289000 · TK1151
细胞核0.289
排名 2 · TkA02G289000 · TK1151
细胞膜0.177
排名 3 · TkA02G289000 · TK1151
线粒体0.117
排名 4 · TkA02G289000 · TK1151
高尔基体0.105
排名 5 · TkA02G289000 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF11900DUF3420116-165 aa
PF13606Ank_3164-185 aa
PF13637Ank_4164-206 aa
PF12796Ank_2165-246 aa
PF00023Ank165-187 aa
PF13857Ank_5190-198 aa
PF13857Ank_5190-209 aa
PF00023Ank191-220 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G289000PF11900DUF34201161651.2e-0732.4
TkA02G289000PF13606Ank_31641859e-0935.5
TkA02G289000PF13637Ank_41642062.2e-0731.7
TkA02G289000PF12796Ank_21652466.1e-1659.5
TkA02G289000PF00023Ank1651873.4e-1040.3
TkA02G289000PF13857Ank_51901984.2e-0730.9
TkA02G289000PF13857Ank_51902094.2e-0730.9
TkA02G289000PF00023Ank1912203.4e-1040.3
TkA02G289000PF13606Ank_31912179e-0935.5
TkA02G289000PF12796Ank_21932606.1e-1659.5
TkA02G289000PF13637Ank_41932422.2e-0731.7
TkA02G289000PF13857Ank_52082604.2e-0730.9
TkA02G289000PF00023Ank2232493.4e-1040.3
TkA02G289000PF13606Ank_32232479e-0935.5
TkA02G289000PF13637Ank_42272622.2e-0731.7
TkA02G289000PF12313NPR1_like_C2644553.3e-84282.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L746拟南芥sp|Q8L746|NPR3_ARATH Regulatory protein NPR358.300%Swiss-Prot高置信
Q5ICL9拟南芥sp|Q5ICL9|NPR4_ARATH Regulatory protein NPR457.700%Swiss-Prot高置信
Q0JJ01水稻sp|Q0JJ01|NPR2_ORYSJ BTB/POZ domain and ankyrin repeat-containing protein NPR260.100%Swiss-Prot高置信
Q75HA6水稻sp|Q75HA6|NPR3_ORYSJ BTB/POZ domain and ankyrin repeat-containing protein NPR352.700%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看