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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G239100
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 61543920-61547771 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2146 bp · TkA02G239100|TK1151|cDNA

TGATTAATCGAATCTGTTATACATATTCAGCGCAGCCAGGCCTCCATTTCTCCACTCACTGTCTCCACGGTTCTATTCTGCATGCCCTTGTTCGATACCTAATCCTCTGCGTAGATTCTAAAGCCATTTTTGATTGATTTTAGACACTGCCAGACGCCATGTGTGGAATACTCGCGGTATTTGGTTGTGTGGATTGCTCTCAGGCCAAGAGGTCCAGAATCATTGAACTTTCCAGACGGTTGCGCCATAGAGGTCCTGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1539 bp · TkA02G239100|TK1151|CDS

ATGTGTGGAATACTCGCGGTATTTGGTTGTGTGGATTGCTCTCAGGCCAAGAGGTCCAGAATCATTGAACTTTCCAGACGGTTGCGCCATAGAGGTCCTGATTGGAGTGGGCTGCACAGTGAGCAAGACTGTTATCTTGCTCATCAACGGTTAGCCATTGTAGACCCTGCTTCAGGAGATCAACCCCTTTACAATGAAGACAAGACCATTATTGTCACGGTTAATGGGGAGATATACAACCATAAAGCCTTAAAGGAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

512 aa · TkA02G239100|TK1151|PROTEIN

MCGILAVFGCVDCSQAKRSRIIELSRRLRHRGPDWSGLHSEQDCYLAHQRLAIVDPASGDQPLYNEDKTIIVTVNGEIYNHKALKEKLKSHKFNTGSDCEVIAHLYEEYGEDFVHMLDGMFSFVLLDTRDKSYIAARDAIGITPLYMGWGLDGSVWFASEMKALSDDCEQFMSFLPGHIYSSKIGGLRRWYNPTWYSERIPSTPYDPLVLRHAFEKAVIKRLMTDVPFGVLLSGGLDSSLVAAVASRHLANSEASWQWGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G239100
TK1151 IDTkA02G239100
OH-1004 IDLXL04_018682
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)75.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 6.250 / OH-1004 19.048
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G239100
位置Chr02:61543920-61547771 (-)
描述Similar to Prep: Prolyl endopeptidase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g65010 对于植物内通过韧皮部的氮同化、分配和再利用至关重要。
Arabidopsis thaliana ASN2 encoding asparagine synthetase is involved in the control of nitrogen assimilation and export during vegetative growth.2013 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2012.02576.x
At5g10240 对植物通过韧皮部进行氮的同化、分配和重新分布至关重要。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0265000 对植物通过韧皮部进行氮的同化、分配和重新分布至关重要。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018682 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002003 angiotensin maturation 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004175 endopeptidase activity 分子功能
GO:0004181 metallocarboxypeptidase activity 分子功能
GO:0004252 serine-type endopeptidase activity 分子功能
GO:0008233 peptidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
bta:286818
hsa:5550
mmu:19072
rno:83471
ssc:445540
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.682
排名 1 · TkA02G239100 · TK1151
细胞核0.231
排名 2 · TkA02G239100 · TK1151
过氧化物酶体0.136
排名 3 · TkA02G239100 · TK1151
线粒体0.120
排名 4 · TkA02G239100 · TK1151
细胞膜0.040
排名 5 · TkA02G239100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13522GATase_61-168 aa
PF12481DUF370021-33 aa
PF13537GATase_748-165 aa
PF24712YxiG_292-114 aa
PF16901DAO_C94-117 aa
PF12481DUF3700112-200 aa
PF24712YxiG_2191-294 aa
PF00733Asn_synthase210-361 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G239100PF13522GATase_611681.1e-56192.4
TkA02G239100PF12481DUF370021331.2e-1041.9
TkA02G239100PF13537GATase_7481651.2e-42145.5
TkA02G239100PF24712YxiG_2921140.006317.3
TkA02G239100PF16901DAO_C941170.1712.5
TkA02G239100PF12481DUF37001122001.2e-1041.9
TkA02G239100PF24712YxiG_21912940.006317.3
TkA02G239100PF00733Asn_synthase2103611.9e-87294.9
TkA02G239100PF02540NAD_synthase2292920.02214.6
TkA02G239100PF06508QueC2302930.1312.4
TkA02G239100PF03054tRNA_Me_trans2302960.3111.4
TkA02G239100PF16901DAO_C2783080.1712.5
TkA02G239100PF13522GATase_63253841.1e-56192.4
TkA02G239100PF00733Asn_synthase3594871.9e-87294.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LV77拟南芥sp|Q9LV77|ASNS2_ARATH Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing] 286.400%Swiss-Prot高置信
Q9LFU1拟南芥sp|Q9LFU1|ASNS3_ARATH Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing] 386.200%Swiss-Prot高置信
Q43011水稻sp|Q43011|ASNS2_ORYSJ Asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing] 284.600%Swiss-Prot高置信

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