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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G142410
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 36778678-36784450 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2874 bp · TkA02G142410|TK1151|cDNA

AAGAACTTCAAATCAGGGGCCCAAAGCAAAAAAGAAGAAGTGATACGTTGTTTTGGCGTGTCGAATTGAACAGGAAGGACTGCTTTCCAAGAAACCCAAACACAGAGGGTATCCTTTTTCGGCGAAGAGTCGCATACATATTGCTAGGGCATCGAATACACAGGCTTCCCTTCTCCGTTATTTAATCCATTAGAACTATCATCTAAACAGTTAGAGTCACCATTTGTTGGCGATGGAAGTTCTCCGAATGAATCTGTCAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2376 bp · TkA02G142410|TK1151|CDS

ATGGAAGTTCTCCGAATGAATCTGTCAAAGGTCCGTATTCCGGAGCCTACCAATCGCATATACAAGCAAGAATGCTGCATCAGTTTCGAAACTCCGAAATCCGAAGGTGGATTGTTTGTGGACATGAACACATTCCTTGCATTTGGAAAGGATTACGTTGGTTGGAACTTTGAGAAAACTGGTAACCCGGTTTATCTGCACATCAAACAAACAAAGAAGGCGATCCCTGAAGATAGACCTTTGAAGAAACCTACTCTCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

791 aa · TkA02G142410|TK1151|PROTEIN

MEVLRMNLSKVRIPEPTNRIYKQECCISFETPKSEGGLFVDMNTFLAFGKDYVGWNFEKTGNPVYLHIKQTKKAIPEDRPLKKPTLLAIGIDGGFDNQEPEYDEKYNIVILPDYTTLPFPSVALPEKVRLAVDAILIAEGAERKEQLASWTADKKQTSEYALTLKQIDNAVIIPPSGWKCAKCDKTENLWLNLTDGMILCGRKLWDGSGGNNHAIDHYNETHYPLAVKLGTITSDLEGADVFSYPEDESVTDPLLAEHLA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G142410
TK1151 IDTkA02G142410
OH-1004 IDLXL04_037353
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)71.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 14.412 / OH-1004 45.912
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G142410
位置Chr02:36778678-36784450 (-)
描述Similar to UBP14: Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g20630 识别并水解泛素 C 末端 Gly 的肽键。
The ubiquitin-specific protease UBP14 is essential for early embryo development in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2001.01106.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037353 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0016579 protein deubiquitination 生物过程
GO:0042127 regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0071370 cellular response to gibberellin stimulus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G42520
ath:AT3G20630
ath:AT3G58570
dosa:Os03g0805200
dosa:Os07g0202100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.613
排名 1 · TkA02G142410 · TK1151
细胞核0.594
排名 2 · TkA02G142410 · TK1151
线粒体0.048
排名 3 · TkA02G142410 · TK1151
细胞膜0.038
排名 4 · TkA02G142410 · TK1151
内质网0.034
排名 5 · TkA02G142410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17807zf-UBP_var11-73 aa
PF02148zf-UBP180-254 aa
PF17807zf-UBP_var208-229 aa
PF00443UCH308-788 aa
PF13423UCH_1408-585 aa
PF17807zf-UBP_var516-530 aa
PF00627UBA615-652 aa
PF22562UBA_7616-663 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G142410PF17807zf-UBP_var11731.5e-2486.2
TkA02G142410PF02148zf-UBP1802547.7e-1865.2
TkA02G142410PF17807zf-UBP_var2082291.5e-2486.2
TkA02G142410PF00443UCH3087884.8e-45154.9
TkA02G142410PF13423UCH_14085851.6e-0732.0
TkA02G142410PF17807zf-UBP_var5165301.5e-2486.2
TkA02G142410PF00627UBA6156521.4e-1970.2
TkA02G142410PF22562UBA_76166637.2e-33113.0
TkA02G142410PF24899UBA_DHX296186533.1e-0524.4
TkA02G142410PF25025EF-Ts_N6276530.08613.5
TkA02G142410PF00627UBA6747101.4e-1970.2
TkA02G142410PF22562UBA_76757207.2e-33113.0
TkA02G142410PF24899UBA_DHX296817103.1e-0524.4
TkA02G142410PF14555UBA_46867080.2411.9
TkA02G142410PF22566UBA_86877120.1312.8
TkA02G142410PF25025EF-Ts_N6927100.08613.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L6Y1拟南芥sp|Q8L6Y1|UBP14_ARATH Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1473.800%Swiss-Prot高置信

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