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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G130820
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 33847544-33852689 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2943 bp · TkA02G130820|TK1151|cDNA

ATCACCACCTTCTTTTTTTATTCATTTTTTAACGAAAAAAACAATCGGGTATTTCAGAACTTTGTGGGGGAGTTCCTTTTCTATTTTCCATTTATGGTAACAAAGGAAAGATCAAAGATCCAATTAACAGTCACAAAACGGCAATTTTCAGAAGCTAAAGAAAACCTCAATCCAAGAATTCTAAAGCTTCGAACTTTTCTAGAAGGTTTTTATTAATGGAGGCGAGTAATTGTTACAAAAATCGAAAGATTTTGGCGTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1206 bp · TkA02G130820|TK1151|CDS

ATGGAGCACTCATATGAATTCGGTTCTTCAGAAGCTTCAATTCGAAACCCTCAACCAATTCCATCGGGCCATGATTCCGGAGTCATAACAGAGGAATGGAAACAGCGATTCCCAACAAACCACAAAGACGTTGTTACCTTACGACAATGGTTAGATAACAGAAACCAAGTCGTTGATGCCTTTGAATGCTTGCATATATTTATACAAATTGTAGAAATTGTGAATTTATCACATTCGAAAGGAATTGTCGTTCATAATCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

401 aa · TkA02G130820|TK1151|PROTEIN

MEHSYEFGSSEASIRNPQPIPSGHDSGVITEEWKQRFPTNHKDVVTLRQWLDNRNQVVDAFECLHIFIQIVEIVNLSHSKGIVVHNLRPSCFTISSLNHISFIEPVSCSDSDSGFTGSLQSGLENLDEDRNQRFQRLQMESNWYTSPEEANGGPSSCASDVYRLGALLFELYCMCSSMEEKKATMSSLRHRVFPPQLLLKWPKEALFCLWLLHPDPASRPKIDEVLKSEFLTGLKENLDERLAAIELKQRIEEQELLLEF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G130820
TK1151 IDTkA02G130820
OH-1004 IDLXL04_016519
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.252 / OH-1004 49.937
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G130820
位置Chr02:33847544-33852689 (-)
描述Similar to SPA3: Protein SPA1-RELATED 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g53090 光形态发生的阻遏物。
The SPA1-like proteins SPA3 and SPA4 repress photomorphogenesis in the light.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01813.x
Functional and expression analysis of Arabidopsis SPA genes during seedling photomorphogenesis and adult growth.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02812.x
Arabidopsis SPA proteins regulate photoperiodic flowering and interact with the floral inducer CONSTANS to regulate its stability.2006 · DOI: 10.1242/dev.02481
At3g15354 光形态发生的阻遏物。
The SPA1-like proteins SPA3 and SPA4 repress photomorphogenesis in the light.2003 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01813.x
Functional and expression analysis of Arabidopsis SPA genes during seedling photomorphogenesis and adult growth.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02812.x
Arabidopsis SPA proteins regulate photoperiodic flowering and interact with the floral inducer CONSTANS to regulate its stability.2006 · DOI: 10.1242/dev.02481
At4g11110 参与抑制黑暗生长的幼苗的光形态建成。
The SPA quartet: a family of WD-repeat proteins with a central role in suppression of photomorphogenesis in arabidopsis.2004 · DOI: 10.1105/tpc.104.024216
Functional and expression analysis of Arabidopsis SPA genes during seedling photomorphogenesis and adult growth.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02812.x
UniProt: Q9SYX2 控制正常光周期开花并调节昼夜节律。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016519 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009585 red, far-red light phototransduction 生物过程
GO:0009637 response to blue light 生物过程
GO:0009640 photomorphogenesis 生物过程
GO:0009658 chloroplast organization 生物过程
GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程
GO:0010100 negative regulation of photomorphogenesis 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
GO:0010218 response to far red light 生物过程
GO:0048575 short-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:2000028 regulation of photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G53090
ath:AT2G46340
ath:AT3G15354
ath:AT4G11110
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.465
排名 1 · TkA02G130820 · TK1151
细胞核0.441
排名 2 · TkA02G130820 · TK1151
细胞膜0.106
排名 3 · TkA02G130820 · TK1151
高尔基体0.059
排名 4 · TkA02G130820 · TK1151
线粒体0.056
排名 5 · TkA02G130820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27207Y4lR_2nd43-55 aa
PF00069Pkinase47-231 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr128-182 aa
PF30901PEG10-RTL1_C-capsid133-144 aa
PF27207Y4lR_2nd134-148 aa
PF27207Y4lR_2nd205-244 aa
PF30901PEG10-RTL1_C-capsid223-253 aa
PF30901PEG10-RTL1_C-capsid283-298 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G130820PF27207Y4lR_2nd43550.0215.8
TkA02G130820PF00069Pkinase472312.5e-0731.1
TkA02G130820PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1281820.00417.2
TkA02G130820PF30901PEG10-RTL1_C-capsid1331440.7310.6
TkA02G130820PF27207Y4lR_2nd1341480.0215.8
TkA02G130820PF27207Y4lR_2nd2052440.0215.8
TkA02G130820PF30901PEG10-RTL1_C-capsid2232530.7310.6
TkA02G130820PF30901PEG10-RTL1_C-capsid2832980.7310.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94BM7拟南芥sp|Q94BM7|SPA4_ARATH Protein SPA1-RELATED 451.300%Swiss-Prot高置信
Q9LJR3拟南芥sp|Q9LJR3|SPA3_ARATH Protein SPA1-RELATED 346.900%Swiss-Prot中等置信
Q9T014拟南芥sp|Q9T014|SPA2_ARATH Protein SPA1-RELATED 230.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SYX2拟南芥sp|Q9SYX2|SPA1_ARATH Protein SUPPRESSOR OF PHYA-105 138.800%Swiss-Prot中等置信

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