RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G091490
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 23827192-23828111 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

723 bp · TkA02G091490|TK1151|cDNA

ATGAGAGCAATGAAAGAGTTTAGACAAGGAGAACTTGAAGAGAAGAAGCACCCAAAACTTCTCAAGACACCATCTTTAGGCCTTTGCAAGCTACAAGACACCTCCAAGATCGAAAACGAAGCTCGTATATTATCGTCTTTTGCACAGAATCGGTTCTTGGTCAACTTACTCGGGACGAGTCATGACTCAGCCGGGCACCGAGTCCTTGTCATGGAACACATGCCGGTGGCATGCTTCATGACTTGCTACATATCACCATT...

CDS

下载 CDS FASTA

723 bp · TkA02G091490|TK1151|CDS

ATGAGAGCAATGAAAGAGTTTAGACAAGGAGAACTTGAAGAGAAGAAGCACCCAAAACTTCTCAAGACACCATCTTTAGGCCTTTGCAAGCTACAAGACACCTCCAAGATCGAAAACGAAGCTCGTATATTATCGTCTTTTGCACAGAATCGGTTCTTGGTCAACTTACTCGGGACGAGTCATGACTCAGCCGGGCACCGAGTCCTTGTCATGGAACACATGCCGGTGGCATGCTTCATGACTTGCTACATATCACCATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

240 aa · TkA02G091490|TK1151|PROTEIN

MRAMKEFRQGELEEKKHPKLLKTPSLGLCKLQDTSKIENEARILSSFAQNRFLVNLLGTSHDSAGHRVLVMEHMPVACFMTCYISPLVALLHHHVERQTGDFGLSVCINSPSQLANSVSLPAELSDTWILVTLPQSKLSTKNDVFSFGVVLLEIISGTKAIDVSRAPASIVEWARGMFEKDQVMEICDKKVKMPRHMEDMIRRMLVLAMRCVSSDEESRPSITEIVTELERFRFHYGQIR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G091490
TK1151 IDTkA02G091490
OH-1004 IDLXL04_016934
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)64.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.500 / OH-1004 82.825
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G091490
位置Chr02:23827192-23828111 (-)
描述Similar to At5g23170: Serine/threonine-protein kinase-like protein At5g23170
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g23170 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶样蛋白 At5g23170。 暂无已核实直接文献
At3g51990 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶样蛋白 At3g51990。 暂无已核实直接文献
At1g28390 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶样蛋白 At1g28390。 暂无已核实直接文献
At3g09780 活性低的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献
At2g39180 活性低的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016934 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009786 regulation of asymmetric cell division 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010311 lateral root formation 生物过程
GO:0032877 positive regulation of DNA endoreduplication 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048829 root cap development 生物过程
GO:0090392 sepal giant cell differentiation 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009986 cell surface 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G28390
ath:AT3G51990
ath:AT3G59420
ath:AT4G34500
ath:AT5G23170
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.413
排名 1 · TkA02G091490 · TK1151
细胞质0.376
排名 2 · TkA02G091490 · TK1151
细胞核0.260
排名 3 · TkA02G091490 · TK1151
内质网0.082
排名 4 · TkA02G091490 · TK1151
高尔基体0.058
排名 5 · TkA02G091490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr31-78 aa
PF00069Pkinase33-76 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr94-229 aa
PF00069Pkinase95-227 aa
PF26031IREH1177-231 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G091490PF07714PK_Tyr_Ser-Thr31784.1e-1453.2
TkA02G091490PF00069Pkinase33761.1e-0938.8
TkA02G091490PF07714PK_Tyr_Ser-Thr942294.1e-1453.2
TkA02G091490PF00069Pkinase952271.1e-0938.8
TkA02G091490PF26031IREH11772310.1113.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FMY3拟南芥sp|Q9FMY3|STPKL_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein At5g2317032.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SV05拟南芥sp|Q9SV05|CCR35_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein At3g5199037.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SGN7拟南芥sp|Q9SGN7|CCR12_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein At1g2839043.600%Swiss-Prot低置信
Q9S7D9拟南芥sp|Q9S7D9|ACCR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein CCR132.500%Swiss-Prot中等置信
O80963拟南芥sp|O80963|ACCR2_ARATH Serine/threonine-protein kinase-like protein CCR229.100%Swiss-Prot低置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看