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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA02G074760
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 19389206-19395775 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

3045 bp · TkA02G074760|TK1151|cDNA

CTCCATTAAAAATTAGGCACTTTCAGCCGAATTCGCGACTTGAACGAAAGGAAAAAACCGCTACCGAAAGAGAGAAACAACCACCACTTCCTTCTTCACAAATCTCACTCCTTCACATCTCTTTTAGGGTTTCGATTTGATCGATTTCTCCACAACAGAAATTCACACCAAATGGAGCACCAACACCAGCTGCATCATCATCGTTGATCAGATAGCGCGGAACGGAAACGGAGGTTTGAAAATGGCGGAAGACGGATCGG...

2520 bp · TkA02G074760|TK1151|CDS

ATGGCGGAAGACGGATCGGAGAGGGGGAGTACAAGTAAGGGAAATGGAGGGTTAAGTTCCATGGATTCAATGGAATCTCATCGATGGGTGTTTCAAGACGAAGAGAATTCAGAGATCGATTACGAGGACAATGGTGATGATGACGGGGATGATTTAACGTTGCAAAATGACATTGATTCGGACGATGAAGATAGTTTATACCAGAAGCTGATTCGGACCGGGCCAAGGATTGATTCGTTTGGCGTTGAAGCCCTTGAGGT...

839 aa · TkA02G074760|TK1151|PROTEIN

MAEDGSERGSTSKGNGGLSSMDSMESHRWVFQDEENSEIDYEDNGDDDGDDLTLQNDIDSDDEDSLYQKLIRTGPRIDSFGVEALEVPGAHRSDYEDASLGKSVFLVFQTLGVVFGDVGTSPLYTFSVMFSRAPIESNEDIIGALSLVLYTLILIPLIKYILIVLLANDDGEGGTFALYSLICRHAKISLLPNQLPSDSRISSFRLKVPSAELERSLKIKEYLETSLAMKKLVLVLVLAGTSMVIADGVVTPAMSVISAV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G074760
TK1151 IDTkA02G074760
OH-1004 IDLXL04_017104
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G074760
位置Chr02:19389206-19395775 (-)
描述Similar to POT7: Potassium transporter 7
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g09400 可能的钾离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At4g33530 可能的钾离子转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g60160 推测的钾转运蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0509200 高亲和力钾转运蛋白。 暂无已核实直接文献
Os04g0610700 高亲和力钾转运蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_017104 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006813 potassium ion transport 生物过程
GO:0048825 cotyledon development 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004016 adenylate cyclase activity 分子功能
GO:0015079 potassium ion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G60160
ath:AT4G33530
ath:AT5G09400
dosa:Os04g0610700
dosa:Os07g0509200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.434
排名 1 · TkA02G074760 · TK1151
溶酶体/液泡0.302
排名 2 · TkA02G074760 · TK1151
内质网0.140
排名 3 · TkA02G074760 · TK1151
细胞质0.136
排名 4 · TkA02G074760 · TK1151
高尔基体0.098
排名 5 · TkA02G074760 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02705K_trans106-577 aa
PF22776K_trans_C607-837 aa
PF02705K_trans635-651 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G074760PF02705K_trans1065771e-141473.3
TkA02G074760PF22776K_trans_C6078371.2e-2177.9
TkA02G074760PF02705K_trans6356511e-141473.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FY75拟南芥sp|Q9FY75|POT7_ARATH Potassium transporter 771.500%Swiss-Prot高置信
Q8LPL8拟南芥sp|Q8LPL8|POT13_ARATH Potassium transporter 1368.200%Swiss-Prot高置信
O80739拟南芥sp|O80739|POT12_ARATH Putative potassium transporter 1257.400%Swiss-Prot高置信
Q69RI8水稻sp|Q69RI8|HAK14_ORYSJ Probable potassium transporter 1467.500%Swiss-Prot高置信
Q7XPL3水稻sp|Q7XPL3|HAK15_ORYSJ Probable potassium transporter 1559.800%Swiss-Prot高置信

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