TkA02G074600 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G074600

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 19340487-19341213 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

607 bp · TkA02G074600|TK1151|cDNA

TTCAACGCCATTTCTCAAAGACCAAATCGATCGTCTTCAACCTAAGAAAGCAAAAACCTAGAAAGCAAGATAATTTGCTTGATAAAACGTGTCTAAGTCAACAAAATGGAAGAAAACGAGGAAATCGAAAAAACTCCATTGACGAACACCGTCGTCTTCATCTGCATAATTGCAGGTTCTGCTGGTTTAATGTATGGATACGACACTGCCGTTTCAGGAGGAGTAATGATGATGAAGCCCTTTCTGAAAACATTCTTCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

456 bp · TkA02G074600|TK1151|CDS

ATGGAAGAAAACGAGGAAATCGAAAAAACTCCATTGACGAACACCGTCGTCTTCATCTGCATAATTGCAGGTTCTGCTGGTTTAATGTATGGATACGACACTGCCGTTTCAGGAGGAGTAATGATGATGAAGCCCTTTCTGAAAACATTCTTCCCGGCGATCCTGGCGAAGATGGTGGACACGAAACAAGACCAGTACTGTAGGTTCAATAGCCATAGATTAACTGCGTTTATCTCGTCGATGTTCATAGCTGGTTTAGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

151 aa · TkA02G074600|TK1151|PROTEIN

MEENEEIEKTPLTNTVVFICIIAGSAGLMYGYDTAVSGGVMMMKPFLKTFFPAILAKMVDTKQDQYCRFNSHRLTAFISSMFIAGLASSLLAGRVTCLIGRKFSLITSGILFLTGNGLAVFAQNVAMLIAGRLFVGFGIGFANQVCTFYIM

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G074600`
TK1151 ID	TkA02G074600
OH-1004 ID	LXL04_017110
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	96.700
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.338 / OH-1004 30.426 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA02G074600

位置 Chr02:19340487-19341213 (-)

描述 Similar to STP5: Sugar transport protein 5

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g34580`	可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。	暂无已核实直接文献
`At3g19930`	可能通过糖/氢共转运介导己糖的主动摄取。	The sink-specific and stress-regulated Arabidopsis STP4 gene: enhanced expression of a gene encoding a monosaccharide transporter by wounding, elicitors, and pathogen challenge.1996 · DOI: 10.1105/tpc.8.12.2169

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0452700`	通过糖：质子协同介导对己糖的主动摄取。	暂无已核实直接文献
`Os07g0106200`	通过糖：质子协同介导对己糖的主动摄取。	Characterization and expression of monosaccharide transporters (osMSTs) in rice.2000 · DOI: 10.1093/pcp/pcd016

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017110 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0015145 monosaccharide transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0015293 symporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G34580

dosa:Os01g0567500

dosa:Os04g0452700

dosa:Os07g0106200

osa:4326342

osa:4336012

rcu:8289638

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.751

排名 1 · TkA02G074600 · TK1151

细胞质0.113

排名 2 · TkA02G074600 · TK1151

内质网0.074

排名 3 · TkA02G074600 · TK1151

线粒体0.053

排名 4 · TkA02G074600 · TK1151

溶酶体／液泡0.053

排名 5 · TkA02G074600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17461DUF54236-45 aa

PF11772EpuA16-32 aa

PF00083Sugar_tr20-150 aa

PF07690MFS_173-149 aa

PF17461DUF542399-130 aa

PF11772EpuA125-141 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G074600	`PF17461`	DUF5423	6	45	1.5	8.4
TkA02G074600	`PF11772`	EpuA	16	32	1.4	9.3
TkA02G074600	`PF00083`	Sugar_tr	20	150	6e-20	72.3
TkA02G074600	`PF07690`	MFS_1	73	149	4.1e-06	26.7
TkA02G074600	`PF17461`	DUF5423	99	130	1.5	8.4
TkA02G074600	`PF11772`	EpuA	125	141	1.4	9.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q93Y91`	拟南芥	sp\|Q93Y91\|STP5_ARATH Sugar transport protein 5	48.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q39228`	拟南芥	sp\|Q39228\|STP4_ARATH Sugar transport protein 4	46.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q0JCR9`	水稻	sp\|Q0JCR9\|MST1_ORYSJ Sugar transport protein MST1	45.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q7EZD7`	水稻	sp\|Q7EZD7\|MST3_ORYSJ Sugar transport protein MST3	46.800%	Swiss-Prot	中等置信

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