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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA02G064720
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 16823637-16824573 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

798 bp · TkA02G064720|TK1151|cDNA

ATGGATTCAAAATCGGATGAATATCATGGCGATGGGCTCACATTCTTTCTTCCCGAGAACAATTCTGAGATAAAAACTGGTTCGTCCGTAGGGCTTCCCATCACTAACTCAAGAAGTACGAATTTATTTATTGTAGTGGAGTTTGATACATTTGCGAATGCGGAGTGGGATCCAAGAAACTCTAGCAATGATTTGATAGGTGATCATGTAGTTGTACTTCAGGCACTTCATTACATAATCGATATGTTGCCAGAATGGGT...

798 bp · TkA02G064720|TK1151|CDS

ATGGATTCAAAATCGGATGAATATCATGGCGATGGGCTCACATTCTTTCTTCCCGAGAACAATTCTGAGATAAAAACTGGTTCGTCCGTAGGGCTTCCCATCACTAACTCAAGAAGTACGAATTTATTTATTGTAGTGGAGTTTGATACATTTGCGAATGCGGAGTGGGATCCAAGAAACTCTAGCAATGATTTGATAGGTGATCATGTAGTTGTACTTCAGGCACTTCATTACATAATCGATATGTTGCCAGAATGGGT...

265 aa · TkA02G064720|TK1151|PROTEIN

MDSKSDEYHGDGLTFFLPENNSEIKTGSSVGLPITNSRSTNLFIVVEFDTFANAEWDPRNSSNDLIGDHVVVLQALHYIIDMLPEWVTFGFPAATGLVVQTNSVKCWAFVFNSSDLHINASNTLPPTSGSNPLNDKNITVLVVNLVVGLFVMITFLALIAFYVWRRKKSRKNEQGYDVGMNTEFEIGTRPKRFSYQELARSSGEFSENKKLGEAGFGGVYRGFLAKLGTYVAVKGCPRVQSTGSREPEPDRLEPMSHILV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G064720
TK1151 IDTkA02G064720
OH-1004 IDLXL04_017243
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G064720
位置Chr02:16823637-16824573 (+)
描述Similar to LECRK91: L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g10530 促进过氧化氢H(2)O(2)的生成和细胞死亡。 暂无已核实直接文献
At1g56130 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56130。 暂无已核实直接文献
At4g23230 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶15。 暂无已核实直接文献
At4g23190 富半胱氨酸受体样蛋白激酶11。 暂无已核实直接文献
At1g56140 可能的 LRR 受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g56140。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_017243 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009862 systemic acquired resistance, salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048041 focal adhesion assembly 生物过程
GO:0071318 cellular response to ATP 生物过程
GO:0106167 extracellular ATP signaling 生物过程
GO:0140426 pathogen-associated molecular pattern receptor signaling pathway 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G55550
ath:AT5G10530
ath:AT5G60300
ath:AT5G65600
dosa:Os02g0640500
osa:4330111
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.629
排名 1 · TkA02G064720 · TK1151
内质网0.162
排名 2 · TkA02G064720 · TK1151
细胞质0.102
排名 3 · TkA02G064720 · TK1151
溶酶体/液泡0.082
排名 4 · TkA02G064720 · TK1151
细胞外0.074
排名 5 · TkA02G064720 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139Lectin_legB6-60 aa
PF04341DUF48548-60 aa
PF00139Lectin_legB81-115 aa
PF04341DUF48587-101 aa
PF22812CR_prot_dom_plant121-168 aa
PF24195DUF7420128-160 aa
PF07047OPA3128-173 aa
PF27360UU048130-172 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G064720PF00139Lectin_legB6602.2e-1351.0
TkA02G064720PF04341DUF48548600.1213.1
TkA02G064720PF00139Lectin_legB811152.2e-1351.0
TkA02G064720PF04341DUF485871010.1213.1
TkA02G064720PF22812CR_prot_dom_plant1211680.07714.2
TkA02G064720PF24195DUF74201281600.02915.3
TkA02G064720PF07047OPA31281730.03114.8
TkA02G064720PF27360UU0481301720.0712.4
TkA02G064720PF08693SKG61311730.01514.9
TkA02G064720PF04341DUF4851381680.1213.1
TkA02G064720PF05545FixQ1471730.0215.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LXA5拟南芥sp|Q9LXA5|LRK91_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IX.129.700%Swiss-Prot低置信
C0LGH2拟南芥sp|C0LGH2|Y1561_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5613032.800%Swiss-Prot低置信
Q8W4G6拟南芥sp|Q8W4G6|CRK15_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1535.900%Swiss-Prot低置信
Q9ZP16拟南芥sp|Q9ZP16|CRK11_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1133.100%Swiss-Prot低置信
C0LGH3拟南芥sp|C0LGH3|Y5614_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g5614030.000%Swiss-Prot低置信

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