TkA02G060410 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA02G060410

当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 15740631-15745304 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2379 bp · TkA02G060410|TK1151|cDNA

CCCTCCCCACAACTCTTACTAGAAAATTCGGCCCTCTTTTTAAATCATTTCCCTGCGAAAACCCTAAACCCTTCCTTCTCAAAACCACTGGAACTTCAGCTCACTTCATCGATCGTCTCTCTCATTCACTGTTCGGTGTTCGATGGCGACCTACGCGTTGCTCAGATCTCTTCGTCGAAGAGACGTCTCATCTGCTCCTTTATCCGCCTTCAAATCCTTAAGTGGAGCCAAACCATCATGGGCTGGATCACATTTAAGTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1290 bp · TkA02G060410|TK1151|CDS

ATGGCGACCTACGCGTTGCTCAGATCTCTTCGTCGAAGAGACGTCTCATCTGCTCCTTTATCCGCCTTCAAATCCTTAAGTGGAGCCAAACCATCATGGGCTGGATCACATTTAAGTCACAAGATAAGCATGCTTTCCAGACCCTTCAGCTCAAGACCTCTAGGAAACGAAGTTATTGGTATTGACTTAGGTACAACAAACTCATGTGTTGCAGTCATGGAAGGAAAGACTGCAAAGGTGATTGAGAATTCAGAAGGATC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

429 aa · TkA02G060410|TK1151|PROTEIN

MATYALLRSLRRRDVSSAPLSAFKSLSGAKPSWAGSHLSHKISMLSRPFSSRPLGNEVIGIDLGTTNSCVAVMEGKTAKVIENSEGSRTTPSVVAFNQKGELIVGTPAKRQAVTNPTNTVFGTKRLIGRRFDDPQTQKEMQMVPYKIVKAPNGDAWVEANGQKYSPSQIGAFVLTKMKETAEAYLGKTINKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGRIAGLDVERIINEPTAAALSYGLNNKEGLIAVFDLGGGTFDVSILEIS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA02G060410`
TK1151 ID	TkA02G060410
OH-1004 ID	LXL04_017280
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	98.400
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 37.369 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA02G060410`
位置	Chr02:15740631-15745304 (+)
描述	Similar to Heat shock 70 kDa protein, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_017280` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006457 protein folding 生物过程 GO:0009408 response to heat 生物过程 GO:0009615 response to virus 生物过程 GO:0016226 iron-sulfur cluster assembly 生物过程 GO:0017004 cytochrome complex assembly 生物过程 GO:0042026 protein refolding 生物过程 GO:0140964 intracellular auxin homeostasis 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005739 mitochondrion 细胞组分 GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	ath:AT4G37910 ath:AT5G09590 sot:102582209 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.937

排名 1 · TkA02G060410 · TK1151

细胞质0.079

排名 2 · TkA02G060410 · TK1151

细胞核0.055

排名 3 · TkA02G060410 · TK1151

质体0.030

排名 4 · TkA02G060410 · TK1151

细胞膜0.026

排名 5 · TkA02G060410 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00012HSP7058-425 aa

PF06723MreB_Mbl58-110 aa

PF14450FtsA60-78 aa

PF06723MreB_Mbl188-422 aa

PF14450FtsA244-409 aa

PF25223DUF7841276-328 aa

PF01031Dynamin_M338-406 aa

PF02782FGGY_C364-424 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA02G060410	`PF00012`	HSP70	58	425	1.6e-184	615.2
TkA02G060410	`PF06723`	MreB_Mbl	58	110	1.9e-13	50.7
TkA02G060410	`PF14450`	FtsA	60	78	0.00059	20.9
TkA02G060410	`PF06723`	MreB_Mbl	188	422	1.9e-13	50.7
TkA02G060410	`PF14450`	FtsA	244	409	0.00059	20.9
TkA02G060410	`PF25223`	DUF7841	276	328	0.18	12.7
TkA02G060410	`PF01031`	Dynamin_M	338	406	0.056	13.3
TkA02G060410	`PF02782`	FGGY_C	364	424	0.26	11.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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