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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G044820
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 11571342-11573099 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1587 bp · TkA02G044820|TK1151|cDNA

ATGGCGTCTCTAATGGCGATTCGCAGAAGCACCTTCACTTCTTCCTTCAGGGTAACTTCTTTACGCTCATCTCATTCCATTTTCAACCGTGACACCCTCAGAACTCTCTCCACATCGACCGCCCCAAACAGCTTCGATTCGCCCCCAAATGATCGAACGAACTCTAACCAATGGAATCTGCAACAAAATCATCCGCAAAATTATCCACCAAATACAGGACAGCAAAATCATTACCAGGAGTACCGTAATCAGCGTCAGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1587 bp · TkA02G044820|TK1151|CDS

ATGGCGTCTCTAATGGCGATTCGCAGAAGCACCTTCACTTCTTCCTTCAGGGTAACTTCTTTACGCTCATCTCATTCCATTTTCAACCGTGACACCCTCAGAACTCTCTCCACATCGACCGCCCCAAACAGCTTCGATTCGCCCCCAAATGATCGAACGAACTCTAACCAATGGAATCTGCAACAAAATCATCCGCAAAATTATCCACCAAATACAGGACAGCAAAATCATTACCAGGAGTACCGTAATCAGCGTCAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

528 aa · TkA02G044820|TK1151|PROTEIN

MASLMAIRRSTFTSSFRVTSLRSSHSIFNRDTLRTLSTSTAPNSFDSPPNDRTNSNQWNLQQNHPQNYPPNTGQQNHYQEYRNQRQNYPPVTGGQNFYQENPNQRQNYPSNEARQSSYQTNTNQRPNYPPQPPIQRQNFQQHQPSNYSPPNPNPGQSKVDLLKICKEGKLKEAIELMDKGELADAECFNALFSLCGKFKKLEDAKKVHDYLLRSSYRGETQLNHKVIDMYSKCGSMIDARRVFDHMSEKAIDTWHLIITG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G044820
TK1151 IDTkA02G044820
OH-1004 IDLXL04_017426
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)88.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G044820
位置Chr02:11571342-11573099 (+)
描述Similar to PCMP-H66: Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g15690, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g15690 含五重复肽的蛋白At2g15690，线粒体。 暂无已核实直接文献
At2g25580 含五聚肽序列重复的蛋白At2g25580。 暂无已核实直接文献
At4g32450 含五聚肽重复的蛋白 At4g32450，线粒体。 暂无已核实直接文献
At4g30700 含五重复肽序列的蛋白At4g30700。 暂无已核实直接文献
At4g02750 含五肽重复序列的蛋白 At4g02750。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017426 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009451 RNA modification 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G15690
ath:AT2G25580
ath:AT3G24000
ath:AT4G32450
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.603
排名 1 · TkA02G044820 · TK1151
质体0.292
排名 2 · TkA02G044820 · TK1151
细胞核0.074
排名 3 · TkA02G044820 · TK1151
细胞质0.044
排名 4 · TkA02G044820 · TK1151
细胞膜0.012
排名 5 · TkA02G044820 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF19964EAD11160-205 aa
PF01535PPR165-179 aa
PF13041PPR_2165-178 aa
PF12854PPR_1165-179 aa
PF23276TPR_24175-207 aa
PF13041PPR_2184-213 aa
PF01535PPR187-213 aa
PF12854PPR_1187-209 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G044820PF19964EAD111602050.03115.0
TkA02G044820PF01535PPR1651798.6e-1864.0
TkA02G044820PF13041PPR_21651781.2e-1661.3
TkA02G044820PF12854PPR_11651791.1e-0938.6
TkA02G044820PF23276TPR_241752075.3e-0523.9
TkA02G044820PF13041PPR_21842131.2e-1661.3
TkA02G044820PF01535PPR1872138.6e-1864.0
TkA02G044820PF12854PPR_11872091.1e-0938.6
TkA02G044820PF13812PPR_31872102.3e-0628.3
TkA02G044820PF23276TPR_242042515.3e-0523.9
TkA02G044820PF01535PPR2262498.6e-1864.0
TkA02G044820PF13041PPR_22262511.2e-1661.3
TkA02G044820PF12854PPR_12272471.1e-0938.6
TkA02G044820PF29070MSC6_N2273460.0002720.9
TkA02G044820PF13812PPR_32302512.3e-0628.3
TkA02G044820PF17177PPR_long2352532.1e-0628.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZQE5拟南芥sp|Q9ZQE5|PP153_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g15690, mitochondrial56.600%Swiss-Prot高置信
Q680H3拟南芥sp|Q680H3|PP170_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g2558038.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SUU7拟南芥sp|Q9SUU7|PP346_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g32450, mitochondrial37.600%Swiss-Prot中等置信
Q9SUH6拟南芥sp|Q9SUH6|PP341_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g3070037.100%Swiss-Prot中等置信
Q9SY02拟南芥sp|Q9SY02|PP301_ARATH Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g0275036.300%Swiss-Prot中等置信

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