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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G042500
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 10746827-10753008 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2354 bp · TkA02G042500|TK1151|cDNA

TTCCGATTTGTACTTGGTATACAATTATAATCGTGCCCCTTAAGCTTTGCCTCCTCATTGCAAGTAAACCCCCTTTTCCTTCCCATTATTCGCCGGCATTCTCACCTGTTTTCAACTCGATCGTTCCGTTTAACACCTACTCAAATCATCAAAACCCTCAAATCGACTCATCGATTATCGATTACAAGGGCTTATTGATCAAGTTTTGCACGTTTACACCCGCCGTTTGTGAATTGCGATGGAAGAGGAGGATTGCATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1818 bp · TkA02G042500|TK1151|CDS

ATGGAAGAGGAGGATTGCATGAGCAGCGGCGGCGAAGAAGATTACTATTGCTCCGATCGTGAGTCCCTCGGCGATGCGCTCGAGAACGAAGACTCTGATTCTCAGTGGGCTCCTCCTAAAGGTCCCTCAGCCAAGGTCATCACAAAAGAATCTCTATTGGCTGCACAGAGGGAAGATTTACGCAGAGTTATGGAATTACTCTCTTTAAGGGAACACCATGCACGTACACTGCTTATACATTATCGTTGGGATGTTGAGAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

605 aa · TkA02G042500|TK1151|PROTEIN

MEEEDCMSSGGEEDYYCSDRESLGDALENEDSDSQWAPPKGPSAKVITKESLLAAQREDLRRVMELLSLREHHARTLLIHYRWDVEKIFAILVEKGKARLFIEAGLPMLESHDLDTSVSTSTTMCEICMEELPFSKKTRMDCGHCFCNDCWTEHFIVKINEGQSRRIRCMAHKCHAICDESIIRTLVGKRHPDLAEKFERFLLESYIEDNKMVKWCPSTPHCGNAIRVEEDEFCEVECSCGNQFCFSCLCEAHSPCSCAM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G042500
TK1151 IDTkA02G042500
OH-1004 IDLXL04_017462
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.339 / OH-1004 83.838
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G042500
位置Chr02:10746827-10753008 (-)
描述Similar to ARI1: Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g34370 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶作用，或者作为 E3 复合物的一部分，从特定的 E2 泛素连接酶接受泛素，然后将其转移到底物。 暂无已核实直接文献
At2g16090 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶作用，或者作为 E3 复合物的一部分，从特定的 E2 泛素连接酶接受泛素，然后将其转移到底物。 暂无已核实直接文献
At3g27710 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶作用，或者作为 E3 复合物的一部分，从特定的 E2 泛素连接酶接受泛素，然后将其转移到底物。 暂无已核实直接文献
At3g27720 可能作为 E3 泛素蛋白连接酶作用，或者作为 E3 复合物的一部分，从特定的 E2 泛素连接酶接受泛素，然后将其转移到底物。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0625800 作为E3泛素蛋白连接酶，或作为E3复合体的一部分，接受特定E2泛素结合酶的泛素，并随后将其转移到底物上。
Perception of viral infections and initiation of antiviral defence in rice.2025 · DOI: 10.1038/s41586-025-08706-8
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017462 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0051607 defense response to virus 生物过程
GO:0080141 regulation of jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0098586 cellular response to virus 生物过程
GO:2000022 regulation of jasmonic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0000151 ubiquitin ligase complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
GO:0031624 ubiquitin conjugating enzyme binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G16090
ath:AT3G27710
ath:AT3G27720
ath:AT4G34370
dosa:Os03g0625800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.658
排名 1 · TkA02G042500 · TK1151
细胞质0.392
排名 2 · TkA02G042500 · TK1151
线粒体0.049
排名 3 · TkA02G042500 · TK1151
细胞膜0.043
排名 4 · TkA02G042500 · TK1151
内质网0.025
排名 5 · TkA02G042500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF21235UBA_ARI155-87 aa
PF26200Rcat_RNF216122-145 aa
PF13923zf-C3HC4_2124-153 aa
PF13639zf-RING_2124-154 aa
PF13445zf-RING_UBOX125-169 aa
PF00097zf-C3HC4125-164 aa
PF01485IBR137-151 aa
PF22191IBR_1141-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G042500PF21235UBA_ARI155872.1e-0834.5
TkA02G042500PF26200Rcat_RNF2161221451.9e-0629.1
TkA02G042500PF13923zf-C3HC4_21241530.003717.7
TkA02G042500PF13639zf-RING_21241540.006317.5
TkA02G042500PF13445zf-RING_UBOX1251690.000520.7
TkA02G042500PF00097zf-C3HC41251640.02715.1
TkA02G042500PF01485IBR1371512.1e-1660.4
TkA02G042500PF22191IBR_11411515.9e-0626.8
TkA02G042500PF01485IBR1591802.1e-1660.4
TkA02G042500PF13639zf-RING_21691830.006317.5
TkA02G042500PF13923zf-C3HC4_21741860.003717.7
TkA02G042500PF13445zf-RING_UBOX1751820.000520.7
TkA02G042500PF01485IBR1962582.1e-1660.4
TkA02G042500PF22191IBR_12142515.9e-0626.8
TkA02G042500PF26200Rcat_RNF2162172521.9e-0629.1
TkA02G042500PF13639zf-RING_22342560.006317.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q949V6拟南芥sp|Q949V6|ARI1_ARATH Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI165.100%Swiss-Prot高置信
Q84RR2拟南芥sp|Q84RR2|ARI2_ARATH Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI266.800%Swiss-Prot高置信
Q9LVX0拟南芥sp|Q9LVX0|ARI3_ARATH Probable E3 ubiquitin-protein ligase ARI361.200%Swiss-Prot高置信
Q9LVW9拟南芥sp|Q9LVW9|ARI4_ARATH Putative E3 ubiquitin-protein ligase ARI457.800%Swiss-Prot高置信
Q75LV6水稻sp|Q75LV6|RG454_ORYSJ Ring-type E3 ubiquitin ligase 45446.900%Swiss-Prot中等置信

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