基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA01G641520
当前版本: TK1151
染色体: Chr01
坐标: 162341799-162344129
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1610 bp · TkA01G641520|TK1151|cDNA
ATAAAATCGTGCTCCTCCATCCATACAACTTCACACAAGTGTTAAGATACCATCAAGACTCTTCAATGGGTATAATCACAAAGTCACCCCGTGGGAAGCTCTCTCTTTCTATCGTCATTGTTTTAATTTTTTCATCATCATTCATTGTTCTCTTGTACACCGAGAGAACCAACTTGCTCTCTTCGACCACCGTTTTCAATACCAAGTCTTGCGCGAAAAGGGGTTATTCCAAACCTACAAAATATTCGATACAAGATGAA...
CDS
下载 CDS FASTA1302 bp · TkA01G641520|TK1151|CDS
ATGGGTATAATCACAAAGTCACCCCGTGGGAAGCTCTCTCTTTCTATCGTCATTGTTTTAATTTTTTCATCATCATTCATTGTTCTCTTGTACACCGAGAGAACCAACTTGCTCTCTTCGACCACCGTTTTCAATACCAAGTCTTGCGCGAAAAGGGGTTATTCCAAACCTACAAAATATTCGATACAAGATGAAAGAAACGCTACAGAGGAGAATAGACTCAAGTCCATTCTCGATGATAGATTCATCTTTGAGGCAGA...
433 aa · TkA01G641520|TK1151|PROTEIN
MGIITKSPRGKLSLSIVIVLIFSSSFIVLLYTERTNLLSSTTVFNTKSCAKRGYSKPTKYSIQDERNATEENRLKSILDDRFIFEADECNIARGKWVYNQSFEPLYTDFSCPYLDRQVSCVKNGKPDSDYRKWEWQLDGCVLPRFDAKLALEKIRGKRVMFVGDSLQRGQWQSFVCLVEFLIPKDQKSMRRGRVHSVFSIKDHNATIEFYWAPFLIDSNTDVKIIGDPKKRILRVDSIEKHAKHWIGVDVLVYNTYVWWM...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA01G641520 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G641520 |
| OH-1004 ID | LXL04_000018 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 98.600 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 98.152 / OH-1004 98.608覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA01G641520 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:162341799-162344129 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to TBL3: Protein trichome birefringence-like 3 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009409 response to cold 生物过程 GO:0009827 plant-type cell wall modification 生物过程 GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程 GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程 GO:0045489 pectin biosynthetic process 生物过程 GO:0045492 xylan biosynthetic process 生物过程 GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程 GO:0050826 response to freezing 生物过程 GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT2G40150 ath:AT2G40320 ath:AT3G55990 ath:AT5G01360 dosa:Os03g0291200 osa:4332503 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
高尔基体0.537
细胞膜0.082
细胞外0.076
内质网0.059
质体0.035
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14416PMR5N88-140 aaPF13839PC-Esterase142-424 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G641520 | PF14416 | PMR5N | 88 | 140 | 7.1e-20 | 71.8 |
| TkA01G641520 | PF13839 | PC-Esterase | 142 | 424 | 5.9e-89 | 299.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8LED3 | 拟南芥 | sp|Q8LED3|TBL3_ARATH Protein trichome birefringence-like 3 | 59.200% | Swiss-Prot | 高置信 |
Q9LY46 | 拟南芥 | sp|Q9LY46|TBL29_ARATH Xylan O-acetyltransferase 1 | 47.600% | Swiss-Prot | 中等置信 |
F4IH21 | 拟南芥 | sp|F4IH21|TBL33_ARATH Protein trichome birefringence-like 33 | 47.800% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q94K00 | 拟南芥 | sp|Q94K00|TBL28_ARATH Protein trichome birefringence-like 28 | 49.000% | Swiss-Prot | 中等置信 |
Q10MX4 | 水稻 | sp|Q10MX4|XOAT8_ORYSJ Probable xylan O-acetyltransferase 8 | 58.400% | Swiss-Prot | 高置信 |