TkA01G640850 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G640850

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 162188799-162190685 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1824 bp · TkA01G640850|TK1151|cDNA

ATGCAACTTGTTTCTTCAAGGAGTTCGACTAATTACTCTTCGGGTTTCTACAAGCTCTTTTTTGACATAGATAGCATTCTTCGAATTCTTTATGATGGTCCAGAAACGACTACTGTTTTTTGGCCTAACCCGAGTATATTTTTACTAGATAGAAGATTCCTTTATAGAGATAATCGAAGTGCAAGTCTTGACTCCGATGGTCAATTCAACTCATCTGATGATGGTAATGTAAGAGTTTATAGTCTCGTGGAGGGCAAAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1824 bp · TkA01G640850|TK1151|CDS

ATGCAACTTGTTTCTTCAAGGAGTTCGACTAATTACTCTTCGGGTTTCTACAAGCTCTTTTTTGACATAGATAGCATTCTTCGAATTCTTTATGATGGTCCAGAAACGACTACTGTTTTTTGGCCTAACCCGAGTATATTTTTACTAGATAGAAGATTCCTTTATAGAGATAATCGAAGTGCAAGTCTTGACTCCGATGGTCAATTCAACTCATCTGATGATGGTAATGTAAGAGTTTATAGTCTCGTGGAGGGCAAAGG...

蛋白

下载蛋白 FASTA

607 aa · TkA01G640850|TK1151|PROTEIN

MQLVSSRSSTNYSSGFYKLFFDIDSILRILYDGPETTTVFWPNPSIFLLDRRFLYRDNRSASLDSDGQFNSSDDGNVRVYSLVEGKGRMRWEVQYQFLSNPCTIHGICGRNSLCTYSPNLGRQCACLHGYKMVNSEDWSNGCEPEFQPCTQHDCGFIELRHAEFYGYDFQLLINRTTNTCKKACLENNKCMGFQFGIRDDVGAHFCFLKSSLRNGYQMGINYLMYIKLPKTLVSNFNQQTESQSTSSCPSHAPVPIIRSY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G640850`
TK1151 ID	TkA01G640850
OH-1004 ID	LXL04_000021
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	96.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 78.598 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G640850

位置 Chr01:162188799-162190685 (-)

描述 Similar to PK1: Putative receptor protein kinase ZmPK1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g34300`	G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g34300。	暂无已核实直接文献
`At4g00340`	丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。	暂无已核实直接文献
`At5g24080`	G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At5g24080。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0202500`	参与对食草性昆虫褐飞虱（Nilaparvata lugens, BPH）的抗性。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000021 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0048544 recognition of pollen 生物过程

GO:0051707 response to other organism 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0005516 calmodulin binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G00340

ath:AT5G24080

dosa:Os04g0202350

dosa:Os04g0202500

osa:9266608

zma:542378

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.844

排名 1 · TkA01G640850 · TK1151

内质网0.086

排名 2 · TkA01G640850 · TK1151

细胞质0.078

排名 3 · TkA01G640850 · TK1151

细胞核0.047

排名 4 · TkA01G640850 · TK1151

溶酶体／液泡0.030

排名 5 · TkA01G640850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00954S_locus_glycop86-132 aa

PF12947EGF_3105-131 aa

PF14670FXa_inhibition106-133 aa

PF00024PAN_1154-212 aa

PF14295PAN_4163-195 aa

PF30217X92_C179-251 aa

PF10140YukC261-306 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr327-603 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G640850	`PF00954`	S_locus_glycop	86	132	2e-05	25.8
TkA01G640850	`PF12947`	EGF_3	105	131	0.032	15.2
TkA01G640850	`PF14670`	FXa_inhibition	106	133	0.043	14.7
TkA01G640850	`PF00024`	PAN_1	154	212	0.00095	19.7
TkA01G640850	`PF14295`	PAN_4	163	195	0.0044	17.8
TkA01G640850	`PF30217`	X92_C	179	251	0.098	12.8
TkA01G640850	`PF10140`	YukC	261	306	0.3	10.6
TkA01G640850	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	327	603	8.9e-39	134.1
TkA01G640850	`PF00069`	Pkinase	328	602	3.5e-48	165.0
TkA01G640850	`PF03109`	ABC1	336	355	0.021	14.7
TkA01G640850	`PF03109`	ABC1	392	473	0.021	14.7
TkA01G640850	`PF10140`	YukC	437	473	0.3	10.6
TkA01G640850	`PF03109`	ABC1	562	591	0.021	14.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9XID3`	拟南芥	sp\|Q9XID3\|Y1343_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g34300	32.100%	Swiss-Prot	中等置信
`Q39203`	拟南芥	sp\|Q39203\|SD22_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase SD2-2	30.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FLV4`	拟南芥	sp\|Q9FLV4\|Y5248_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g24080	31.300%	Swiss-Prot	中等置信
`Q0JEU6`	水稻	sp\|Q0JEU6\|LERK3_ORYSJ G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK3	32.900%	Swiss-Prot	中等置信

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