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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G637940
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 161409542-161411044 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1273 bp · TkA01G637940|TK1151|cDNA

TATCCTGATAATCTGGCTATTTCTAGAACATATAAAGGCGAAAACGGGCACAAGCCACACCCTGCAGCCACTGCATAGTATCCCCAAACAGCCTCCATTCACACACACACACACACACACACACAGTGCTACGAATCAATGGACGGAACCGGAGTAGTGGCGGTGTACGGCAACGGTGCTCTGACGGAGAGCAAGAAATCACCATACTCCGTCAAGGTCGGCCTCGCTCAGATGCTTCGTGGCGGCGTCATCATGGACGT...

CDS

下载 CDS FASTA

927 bp · TkA01G637940|TK1151|CDS

ATGGACGGAACCGGAGTAGTGGCGGTGTACGGCAACGGTGCTCTGACGGAGAGCAAGAAATCACCATACTCCGTCAAGGTCGGCCTCGCTCAGATGCTTCGTGGCGGCGTCATCATGGACGTCGTCAACGCAGAACAAGCCCGCATAGCCGAAGAAGCCGGCGCCTGTGCTGTCATGGCCCTAGAGCGTGTCCCAGCAGACATCCGTGCGCAAGGCGGCGTTGCTCGGATGAGCGACCCACAACTGATAAAGGAAATCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

308 aa · TkA01G637940|TK1151|PROTEIN

MDGTGVVAVYGNGALTESKKSPYSVKVGLAQMLRGGVIMDVVNAEQARIAEEAGACAVMALERVPADIRAQGGVARMSDPQLIKEIKQAVTIPVMAKARIGHFVEAQILEAIGVDYVDESEVLTLADDMNHINKHNFRIPFVCGCRNLGEALRRIREGAAMIRTKGEAGTGNIIEAVRHVRSVMGDIRVLANMDDDEVFTFAKKIAAPYDLVMQTKQLGRLPVVQFAAGGVATPADAALMMQLGCDGVFVGSGVFKSGDP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G637940
TK1151 IDTkA01G637940
OH-1004 IDLXL04_000062
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G637940
位置Chr01:161409542-161411044 (-)
描述Similar to PDX1: Probable pyridoxal 5'-phosphate synthase subunit PDX1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g01410 催化由核糖-5-磷酸（RBP）、甘油醛-3-磷酸（G3P）和氨生成吡哆醛-5'-磷酸。 暂无已核实直接文献
At2g38230 催化由核糖-5-磷酸（RBP）、甘油醛-3-磷酸（G3P）和氨生成吡哆醛-5'-磷酸。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0100200 催化由核糖-5-磷酸（RBP）、甘油醛-3-磷酸（G3P）和氨生成吡哆醛-5'-磷酸。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000062 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006520 amino acid metabolic process 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0006982 response to lipid hydroperoxide 生物过程
GO:0008615 pyridoxine biosynthetic process 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0010335 response to non-ionic osmotic stress 生物过程
GO:0015994 chlorophyll metabolic process 生物过程
GO:0042538 hyperosmotic salinity response 生物过程
GO:0042823 pyridoxal phosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G38230
ath:AT5G01410
dosa:Os07g0100200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.715
排名 1 · TkA01G637940 · TK1151
细胞核0.296
排名 2 · TkA01G637940 · TK1151
细胞膜0.101
排名 3 · TkA01G637940 · TK1151
内质网0.061
排名 4 · TkA01G637940 · TK1151
线粒体0.045
排名 5 · TkA01G637940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01680SOR_SNZ24-228 aa
PF00218IGPS35-112 aa
PF03060NMO38-96 aa
PF05690ThiG46-128 aa
PF01207Dus46-113 aa
PF00977His_biosynth75-97 aa
PF04131NanE76-118 aa
PF05690ThiG136-156 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G637940PF01680SOR_SNZ242284.1e-112373.7
TkA01G637940PF00218IGPS351120.02314.6
TkA01G637940PF03060NMO38960.09612.8
TkA01G637940PF05690ThiG461288.6e-1142.4
TkA01G637940PF01207Dus461136.8e-0626.1
TkA01G637940PF00977His_biosynth75970.04414.0
TkA01G637940PF04131NanE761180.01115.6
TkA01G637940PF05690ThiG1361568.6e-1142.4
TkA01G637940PF01207Dus2052776.8e-0626.1
TkA01G637940PF05690ThiG2082728.6e-1142.4
TkA01G637940PF03060NMO2112530.09612.8
TkA01G637940PF04131NanE2212550.01115.6
TkA01G637940PF00218IGPS2232650.02314.6
TkA01G637940PF00977His_biosynth2242550.04414.0
TkA01G637940PF17935TetR_C_272512830.0002122.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L940拟南芥sp|Q8L940|PDX13_ARATH Pyridoxal 5'-phosphate synthase subunit PDX1.392.600%Swiss-Prot高置信
O80448拟南芥sp|O80448|PDX11_ARATH Pyridoxal 5'-phosphate synthase subunit PDX1.189.300%Swiss-Prot高置信
Q69LA6水稻sp|Q69LA6|PDX11_ORYSJ Probable pyridoxal 5'-phosphate synthase subunit PDX1.186.700%Swiss-Prot高置信

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