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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G608630
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 153426110-153432014 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3750 bp · TkA01G608630|TK1151|cDNA

GCTAACGGGCCATAACTTAAAAACAAAAAAACAAAAATCCCCGTCAACTTTAACGAGCTGGAGCCCCAAAATTCAAACGCCCCCGTAACGGCCATAATTTTGAAGTCCCTTTCTTCATCATCTCACCTCATCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATATTTTAACCTAAAAATACTCACCATTTCCGTGAATTAACTCCATTTACACTGAATCTACCTTCGCTATACAGCAATTTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

3105 bp · TkA01G608630|TK1151|CDS

ATGGAGAGGAAGGGAGGAAACACGGTTCCGAGTTCACCATCGCACACCCCAAGGTCCACTGACAAATCAGTAAGAGATCTCCGACATGTAGAAGGAAATATGAGTGGTAAACACGATAAAGAAAAAGGCGTGAATGTTCAGGTTGTTGTGCGATGCAGACCAATGAACGCCGAAGAGGAGAAATTACACACACCGATGGTTATTACATGCTCAGAAAACAAGAGGGAAATATGCGCAATTCAGACTATAGCCAACAAGCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1034 aa · TkA01G608630|TK1151|PROTEIN

MERKGGNTVPSSPSHTPRSTDKSVRDLRHVEGNMSGKHDKEKGVNVQVVVRCRPMNAEEEKLHTPMVITCSENKREICAIQTIANKQIDRSFVFDKVFGPKSQQRDLYHSAVSPIVFEVLEGYNCTIFAYGQTGTGKTYTMEGGGRKKNGEFPSDAGVIPRAVKQIFDILEAQNAEYSMKVTFLELYNEEITDLLALEEASKYPEDKSKKPIALMEDGKGGVLVRGLEEEIVSTADEIYRILEKGSAKRRTAETLMNKQS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G608630
TK1151 IDTkA01G608630
OH-1004 IDLXL04_000492
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G608630
位置Chr01:153426110-153432014 (+)
描述Similar to KIN5D: Kinesin-like protein KIN-5D
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g45850 负责微管的转运。 暂无已核实直接文献
At2g28620 负责微管的转运。 暂无已核实直接文献
At2g37420 负责微管的转运。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0117798 负责微管的转运。 暂无已核实直接文献
Os08g0558400 负责微管的转运。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000492 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000281 mitotic cytokinesis 生物过程
GO:0000911 cytokinesis by cell plate formation 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0043622 cortical microtubule organization 生物过程
GO:0051231 spindle elongation 生物过程
GO:0090307 mitotic spindle assembly 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005819 spindle 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0005876 spindle microtubule 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G28620
ath:AT2G37420
dosa:Os05g0117798
osa:9268593
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.743
排名 1 · TkA01G608630 · TK1151
细胞核0.226
排名 2 · TkA01G608630 · TK1151
细胞膜0.079
排名 3 · TkA01G608630 · TK1151
高尔基体0.072
排名 4 · TkA01G608630 · TK1151
线粒体0.059
排名 5 · TkA01G608630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd45-195 aa
PF00225Kinesin51-387 aa
PF25524RSLD_CPSF6217-254 aa
PF29653YqxI235-254 aa
PF20667Sec10_N462-505 aa
PF20667Sec10_N462-520 aa
PF29653YqxI545-577 aa
PF20667Sec10_N567-607 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G608630PF16796Microtub_bd451951.2e-2797.5
TkA01G608630PF00225Kinesin513871e-116390.2
TkA01G608630PF25524RSLD_CPSF62172540.7910.7
TkA01G608630PF29653YqxI2352540.7911.2
TkA01G608630PF20667Sec10_N4625050.0116.6
TkA01G608630PF20667Sec10_N4625200.0116.6
TkA01G608630PF29653YqxI5455770.7911.2
TkA01G608630PF20667Sec10_N5676070.0116.6
TkA01G608630PF17511Mobilization_B5726236.67.8
TkA01G608630PF29653YqxI6176870.7911.2
TkA01G608630PF17511Mobilization_B6627166.67.8
TkA01G608630PF25524RSLD_CPSF66757110.7910.7
TkA01G608630PF20667Sec10_N6767350.0116.6
TkA01G608630PF16796Microtub_bd7157701.2e-2797.5
TkA01G608630PF00225Kinesin7448061e-116390.2
TkA01G608630PF25524RSLD_CPSF67818230.7910.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZU5拟南芥sp|Q9LZU5|KN5D_ARATH Kinesin-like protein KIN-5D70.700%Swiss-Prot高置信
F4IIS5拟南芥sp|F4IIS5|KN5A_ARATH Kinesin-like protein KIN-5A65.800%Swiss-Prot高置信
Q0WQJ7拟南芥sp|Q0WQJ7|KN5B_ARATH Kinesin-like protein KIN-5B46.100%Swiss-Prot中等置信
Q5W7C6水稻sp|Q5W7C6|KN5A_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-5A66.000%Swiss-Prot高置信
B7EJ91水稻sp|B7EJ91|KN5C_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-5C47.100%Swiss-Prot中等置信

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