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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G608510
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 153386275-153390880 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3693 bp · TkA01G608510|TK1151|cDNA

AAAAGGGGAGCTCGCTTTCCTTGATATATATAAACTAATTGATCGATTAAATAAAATTTAACGAAGCTTCAAGGAAATCAGGAGCCCTTACTTGTCTATCAAACCAACTCGAATAAGTGCTTAGCGAAAAGGGATTCTTTCTTCGTAGATCTGTTCCCTCATTCTCACTCAAAATCTTGAAAACGAAGTTCTTTCATCTCTCTAGAGAGAAATCGAACCTGAAACTTTAGAAAAGAGCATCACTTGCTCTACATATATGT...

CDS

下载 CDS FASTA

3189 bp · TkA01G608510|TK1151|CDS

ATGGGTAAAGGAGCCCAAAATTCCGGTAGGAAAGACAGTACAGACAAATCATCACTGGATCGCAACCAATATGCTGCCTGGGCAAAGGACGTTCATGAATGTGAACAAAACTACCAGGTAGACAGCAAATCCGGTCTATCTGATAGTGAAGTAGAGAAGCGGCTGAAAAAGTATGGCACAAACGAGTTGGAAAAGCATGAAGGACAATCTGTTTTCCGTCTAATTCTAGATCAATTCAACGACACTTTAGTTAGAATCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1062 aa · TkA01G608510|TK1151|PROTEIN

MGKGAQNSGRKDSTDKSSLDRNQYAAWAKDVHECEQNYQVDSKSGLSDSEVEKRLKKYGTNELEKHEGQSVFRLILDQFNDTLVRILLAAAVISFVLAWYDGEEGGEMEITAFVEPLVIFLILIVNAIVGVWQESNAEKALEALKEIQSQQATVIRNGRKLSSLPAKELVPGDIVELRVGDKIPADLRVITLISSTLRVEQGSLTGESEAVSKTTKPVPEETDIQGKKCMVFAGTTVVNGHCLCMVTDTGMNTEIGKVHS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G608510
TK1151 IDTkA01G608510
OH-1004 IDLXL04_000496
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.153 / OH-1004 97.772
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G608510
位置Chr01:153386275-153390880 (+)
描述Similar to ECA1: Calcium-transporting ATPase 1, endoplasmic reticulum-type
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g07810 这种依赖镁的酶催化ATP水解，同时将钙从细胞质转运到内质网腔。 暂无已核实直接文献
At1g07670 这种依赖镁的酶催化ATP的水解，同时伴随钙从胞质转运到内膜区室。 暂无已核实直接文献
At4g00900 这种依赖镁的酶催化ATP的水解，同时伴随钙从胞质转运到内膜区室。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000496 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006816 calcium ion transport 生物过程
GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程
GO:0010042 response to manganese ion 生物过程
GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0005388 P-type calcium transporter activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G07670
ath:AT1G07810
ath:AT4G00900
sly:543554
tgo:TGME49_230420
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.392
排名 1 · TkA01G608510 · TK1151
细胞膜0.272
排名 2 · TkA01G608510 · TK1151
高尔基体0.180
排名 3 · TkA01G608510 · TK1151
细胞质0.114
排名 4 · TkA01G608510 · TK1151
溶酶体／液泡0.090
排名 5 · TkA01G608510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00690Cation_ATPase_N27-94 aa
PF00689Cation_ATPase_C100-100 aa
PF00690Cation_ATPase_N112-123 aa
PF00122E1-E2_ATPase147-262 aa
PF12710HAD185-207 aa
PF00689Cation_ATPase_C287-303 aa
PF00702Hydrolase379-408 aa
PF13246Cation_ATPase437-636 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G608510PF00690Cation_ATPase_N27942.9e-2175.6
TkA01G608510PF00689Cation_ATPase_C1001001.9e-47162.0
TkA01G608510PF00690Cation_ATPase_N1121232.9e-2175.6
TkA01G608510PF00122E1-E2_ATPase1472623.8e-2588.3
TkA01G608510PF12710HAD1852071.6e-0629.4
TkA01G608510PF00689Cation_ATPase_C2873031.9e-47162.0
TkA01G608510PF00702Hydrolase3794084e-1867.2
TkA01G608510PF13246Cation_ATPase4376365.5e-39134.6
TkA01G608510PF08282Hydrolase_35185828.2e-0729.7
TkA01G608510PF00702Hydrolase6257454e-1867.2
TkA01G608510PF12710HAD6327421.6e-0629.4
TkA01G608510PF08282Hydrolase_36356708.2e-0729.7
TkA01G608510PF08282Hydrolase_37197748.2e-0729.7
TkA01G608510PF00689Cation_ATPase_C81710421.9e-47162.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P92939拟南芥sp|P92939|ECA1_ARATH Calcium-transporting ATPase 1, endoplasmic reticulum-type78.900%Swiss-Prot高置信
Q9XES1拟南芥sp|Q9XES1|ECA4_ARATH Calcium-transporting ATPase 4, endoplasmic reticulum-type79.100%Swiss-Prot高置信
O23087拟南芥sp|O23087|ECA2_ARATH Calcium-transporting ATPase 2, endoplasmic reticulum-type64.500%Swiss-Prot高置信

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