基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_000496
当前版本: OH-1004
染色体: Chr01
坐标: 9046999-9051241
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3234 bp · LXL04_000496|LXL04_000496|OH1004|cDNA
ATGTTCGTTGCTTCGAAATTTCGATATTGTCTGCTAATTTTTTCTAATCAAGTTCAGTTTTTTGTTTGCAGACGGAAAGACAGTACAGACAAATCATCACTGGATCGCAACCAATATGCTGCCTGGGCAAAGGACGTTCATGAATGTGAACAAAACTACCAGGTAGACAGCAAATCCGGTCTATCTGATAGTGAAGTAGAGAAGCGGCTGAAAAAGTATGGCACAAACGAGTTGGAAAAGCATGAAGGACAATCTGtttt...
CDS
下载 CDS FASTA3234 bp · LXL04_000496|LXL04_000496|OH1004|CDS
ATGTTCGTTGCTTCGAAATTTCGATATTGTCTGCTAATTTTTTCTAATCAAGTTCAGTTTTTTGTTTGCAGACGGAAAGACAGTACAGACAAATCATCACTGGATCGCAACCAATATGCTGCCTGGGCAAAGGACGTTCATGAATGTGAACAAAACTACCAGGTAGACAGCAAATCCGGTCTATCTGATAGTGAAGTAGAGAAGCGGCTGAAAAAGTATGGCACAAACGAGTTGGAAAAGCATGAAGGACAATCTGTTTT...
1077 aa · LXL04_000496|LXL04_000496|OH1004|PROTEIN
MFVASKFRYCLLIFSNQVQFFVCRRKDSTDKSSLDRNQYAAWAKDVHECEQNYQVDSKSGLSDSEVEKRLKKYGTNELEKHEGQSVFRLILDQFNDTLVRILLAAAVISFVLAWYDGEEGGEMEITAFVEPLVIFLILIVNAIVGVWQESNAEKALEALKEIQSQQATVIRNGRKLSSLPAKELVPGDIVELRVGDKIPADLRVITLISSTLRVEQGSLTGESEAVSKTTKPVPEETDIQGKKCMVFAGTTVVNGHCLCM...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_000496 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G608510 |
| OH-1004 ID | LXL04_000496 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / Strict |
| 蛋白一致性 (%) | 99.900 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 99.153 / OH-1004 97.772覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_000496 |
|---|---|
| 位置 | Chr01:9046999-9051241 (-) |
| 描述 | Similar to ECA1: Calcium-transporting ATPase 1, endoplasmic reticulum-type |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006816 calcium ion transport 生物过程 GO:0006874 intracellular calcium ion homeostasis 生物过程 GO:0010042 response to manganese ion 生物过程 GO:0070588 calcium ion transmembrane transport 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0005388 P-type calcium transporter activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G07670 ath:AT1G07810 ath:AT4G00900 sly:543554 tgo:TGME49_230420 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
内质网0.397
细胞膜0.225
高尔基体0.177
细胞质0.108
溶酶体／液泡0.099
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00690.32Cation_ATPase_N42-109 aaPF00122.26E1-E2_ATPase162-277 aaPF13246.13Cation_ATPase452-651 aaPF00702.33Hydrolase640-760 aaPF12710.14HAD647-757 aaPF08282.19Hydrolase_3734-789 aaPF00689.27Cation_ATPase_C832-1057 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_000496 | PF00690.32 | Cation_ATPase_N | 42 | 109 | 3e-21 | 75.6 |
| LXL04_000496 | PF00122.26 | E1-E2_ATPase | 162 | 277 | 3.9e-25 | 88.3 |
| LXL04_000496 | PF13246.13 | Cation_ATPase | 452 | 651 | 4.2e-39 | 134.9 |
| LXL04_000496 | PF00702.33 | Hydrolase | 640 | 760 | 4.3e-18 | 67.1 |
| LXL04_000496 | PF12710.14 | HAD | 647 | 757 | 1.6e-06 | 29.3 |
| LXL04_000496 | PF08282.19 | Hydrolase_3 | 734 | 789 | 8.3e-07 | 29.7 |
| LXL04_000496 | PF00689.27 | Cation_ATPase_C | 832 | 1057 | 2e-47 | 162.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。