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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G591800
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 148945759-148954409 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1601 bp · TkA01G591800|TK1151|cDNA

AAACAGTCAGAAACAAAATGTTTGGGACAACACCGTTGGAAATTTAATTACCTGCTAAATTACTCCACAAGAAATCGTTCCACTTCTTGCTTCTCCCCACCGTCTTCGTTCCATTTTCAGCACTCGCCTCCTTCCTACGCCCCGCCACAGCCACCGCCTCTGACGCAGACACCGTCACGGCCACTGTCACAGCAACAATGGAATCGCCAATGCTCGTTGAATGTAAAACGCCCCCGACTCGCCCTGATGCATCCAGCACC...

CDS

下载 CDS FASTA

1236 bp · TkA01G591800|TK1151|CDS

ATGGAATCGCCAATGCTCGTTGAATGTAAAACGCCCCCGACTCGCCCTGATGCATCCAGCACCATGGACTCCCCCCTCTTCGACAACGAAGATGACCTCTACACTCGCCTAAAATCATTAGAGCGTCAAATCGAGTTTATCGAGATCCAAGAAGAGTACGTCAAAGACGAACAAAAGAATCTCAAGCGCGAACTTCTTAGGTCTCAAGAAGAAGTGAAGCGGATCCAGTCGGTTCCGCTCGTGATTGGCCAGTTCATGGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

411 aa · TkA01G591800|TK1151|PROTEIN

MESPMLVECKTPPTRPDASSTMDSPLFDNEDDLYTRLKSLERQIEFIEIQEEYVKDEQKNLKRELLRSQEEVKRIQSVPLVIGQFMEMIDQNNGIVGSTTGSNYYVRILSTINREQLKPSASVALHRHSNALVDVLPPEADSSISLLSQSEKPDVSYSDIGGCDIQKQEIREAVELPLTHHDLYKQIGIDPPRGVLLYGPPGTGKTMLAKAVANSTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAIIFIDEV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G591800
TK1151 IDTkA01G591800
OH-1004 IDLXL04_000720
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 65.971
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G591800
位置Chr01:148945759-148954409 (+)
描述Similar to 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58290 26S 蛋白酶体参与泛素化蛋白的 ATP 依赖性降解。
A mutation in the Proteosomal Regulatory Particle AAA-ATPase-3 in Arabidopsis impairs the light-specific hypocotyl elongation response elicited by a glutamate receptor agonist, BMAA.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9489-7

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000720 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0000502 proteasome complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0008540 proteasome regulatory particle, base subcomplex 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G58290
han:110873361
rno:117262
sot:102577768
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.563
排名 1 · TkA01G591800 · TK1151
细胞质0.548
排名 2 · TkA01G591800 · TK1151
线粒体0.057
排名 3 · TkA01G591800 · TK1151
细胞膜0.040
排名 4 · TkA01G591800 · TK1151
内质网0.032
排名 5 · TkA01G591800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF28901DUF847910-68 aa
PF11932DUF345025-89 aa
PF01025GrpE28-91 aa
PF30147SSP130-73 aa
PF13479AAA_2434-64 aa
PF03225Viral_Hsp9034-93 aa
PF23130IcmW39-113 aa
PF13173AAA_1442-85 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G591800PF28901DUF847910680.113.7
TkA01G591800PF11932DUF345025890.01215.7
TkA01G591800PF01025GrpE28910.1412.5
TkA01G591800PF30147SSP130730.05913.5
TkA01G591800PF13479AAA_2434640.007816.6
TkA01G591800PF03225Viral_Hsp9034930.1211.6
TkA01G591800PF23130IcmW391130.1113.4
TkA01G591800PF13173AAA_1442850.00218.8
TkA01G591800PF14532Sigma54_activ_242710.2312.5
TkA01G591800PF05673DUF81543672.4e-0524.3
TkA01G591800PF06745ATPase44640.1412.3
TkA01G591800PF13086AAA_1148750.2411.9
TkA01G591800PF13604AAA_3055760.02714.9
TkA01G591800PF16450Prot_ATP_ID_OB_C821371.7e-1351.0
TkA01G591800PF00158Sigma54_activat951150.005117.2
TkA01G591800PF13086AAA_111061340.2411.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SEI4拟南芥sp|Q9SEI4|PRS6B_ARATH 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog87.500%Swiss-Prot高置信

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