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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G590080
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 148453367-148457908 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3615 bp · TkA01G590080|TK1151|cDNA

CAGCAATCCTCTGAAATCGGATCTTTGAATTTTTTGGATCTGGATCAGTTACGTCGGGTTTGGACCGATCACATAATAATTAATGATTTGATTTTGTCATTTAATTGATCGCCTGTCTGAAAATGTCTTAAGACCATAATAGGTCAACACGCAGATTGACCAACATATCATGAATTTCTCGCGAGAAAATAAGTTCGAATTTAAAAAACGTGATGGAGAAAGTGCCAAGATCGACACAGACGGAGGAACGACGAAGTGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2235 bp · TkA01G590080|TK1151|CDS

ATGGATGATTTCGGTATGTTAGCGAAAGATTTTGGGTTTCGGCCTCAAGGAAAATCTGCTCCGATGAAATCGAGTGGTGGAGATCGCCGGAGTCGACATTCACCGTCGTCAGCAACATTGTCTGCGGATGGAAATGGTATATTTAACGACGTCTTTGGCGGTCCGCCTAAATACACCAACAACAACGCTAACTCCAAATCCACATCGTCAATGTCTGATTTCGATTACGATTCGATTTTCAAGGACTCTGTATCGGCCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

744 aa · TkA01G590080|TK1151|PROTEIN

MDDFGMLAKDFGFRPQGKSAPMKSSGGDRRSRHSPSSATLSADGNGIFNDVFGGPPKYTNNNANSKSTSSMSDFDYDSIFKDSVSANNNEAKTKPTSSNSPVYDKPVYDDDVFDGLPGIKSKPISSSSSGRYDDNIFASMTSSPPKPSPLTDHFDDLFSNLGRTEKAQPSKHQYDQSPRGFDELISGFGSGSPASGTRWNSDPSPKSANKTKEKSNPLDDPFSVLESISTPVTSSRTLFTDPLEEITKIGKSNTRKPSSS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G590080
TK1151 IDTkA01G590080
OH-1004 IDLXL04_000754
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)98.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G590080
位置Chr01:148453367-148457908 (+)
描述Similar to At4g12770: Auxilin-related protein 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g12770 可能促进网格蛋白包被囊泡的脱包衣。 暂无已核实直接文献
At4g12780 促进网格蛋白衣包被囊泡的脱膜。 暂无已核实直接文献
At1g75310 类Auxilin蛋白1。 暂无已核实直接文献
At1g75100 对叶绿体光迁移运动是必需的；在低蓝光条件下进行叶绿体积累，并在黑暗中使叶绿体移动到细胞底部，通过调节叶绿体肌动蛋白 (Cp-actin) 丝状结构的分布、出现和消失实现。
An auxilin-like J-domain protein, JAC1, regulates phototropin-mediated chloroplast movement in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.067371
Overexpression of an auxilin-like gene (F9E10.5) can suppress Al uptake in roots of Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1093/jxb/erl221
Crystallographic and functional analyses of J-domain of JAC1 essential for chloroplast photorelocation movement in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1093/pcp/pcq089
Red light, Phot1 and JAC1 modulate Phot2-dependent reorganization of chloroplast actin filaments and chloroplast avoidance movement.2011 · DOI: 10.1093/pcp/pcr087

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000754 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0045806 negative regulation of endocytosis 生物过程
GO:0045926 negative regulation of growth 生物过程
GO:0072318 clathrin coat disassembly 生物过程
GO:0072583 clathrin-dependent endocytosis 生物过程
GO:1900186 negative regulation of clathrin-dependent endocytosis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009504 cell plate 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G75310
ath:AT4G12770
ath:AT4G12780
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.648
排名 1 · TkA01G590080 · TK1151
细胞膜0.210
排名 2 · TkA01G590080 · TK1151
细胞核0.161
排名 3 · TkA01G590080 · TK1151
高尔基体0.092
排名 4 · TkA01G590080 · TK1151
内质网0.051
排名 5 · TkA01G590080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00226DnaJ690-737 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G590080PF00226DnaJ6907370.0001922.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q0WQ57拟南芥sp|Q0WQ57|AUXI2_ARATH Auxilin-related protein 269.300%Swiss-Prot低置信
Q9SU08拟南芥sp|Q9SU08|AUXI1_ARATH Auxilin-related protein 167.600%Swiss-Prot低置信
Q9FWS1拟南芥sp|Q9FWS1|AUL1_ARATH Auxilin-like protein 161.600%Swiss-Prot低置信
Q9C9Q4拟南芥sp|Q9C9Q4|JAC1_ARATH J domain-containing protein required for chloroplast accumulation response 156.500%Swiss-Prot低置信

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